低温胁迫下意大利蜜蜂预蛹的差异表达基因趋势分析

发布时间：2021-05-17 04:47

　　【目的】蜜蜂是典型的具有发育狭温性的全变态昆虫。本研究以对低温最敏感的意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica预蛹为研究对象,通过低温胁迫不同时间的差异表达基因（differentially expressed genes, DEGs）趋势分析,探讨低温胁迫对蜜蜂发育影响的关键基因。【方法】对3日龄意大利蜜蜂封盖子预蛹进行20℃低温胁迫18 h（T18）和36 h（T36）,以未经低温胁迫的预蛹为对照（CK）,通过Illumina HiSeq^TM平台进行转录组学测定。利用Short Time-series Expression Miner（STEM）软件对2个处理组与对照组比较共有的差异表达基因进行趋势分析,再进一步对显著富集趋势模式中富集的差异表达基因进行GO分类和KEGG pathway分析。利用RT-qPCR对随机挑选的5个DEGs的表达模式进行验证。【结果】对检测到1 062个T18 vs CK和T36 vs CK共有的DEGs进行趋势分析,发现3个显著的基因表达模式,包括2个上调表达模式（Profile 6,有539个基因;Profil... 

【文章来源】：昆虫学报. 2020,63(06)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 供试蜜蜂
    1.2 高通量测序及测序数据质量评估
    1.3 差异表达基因趋势分析
    1.4 差异表达基因GO及KEGG pathway富集分析
    1.5 RT-qPCR基因验证
    1.6 数据分析
2 结果
    2.1 测序结果质量
    2.2 差异表达基因趋势
    2.3 差异表达基因的GO分类
    2.4 差异表达基因的KEGG pathway富集分析
    2.5 差异表达基因的RT-qPCR验证
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]准噶尔小胸鳖甲短时低温胁迫响应的转录组分析[J]. 库尔班·吐松,陆雪莹,刘小宁,马纪.  昆虫学报. 2016(06)
[2]低温导致中华蜜蜂后翅翅脉的新变异[J]. 周冰峰,朱翔杰,李月.  生态学报. 2011(05)



本文编号：3191107