白菜薹细胞核雄性不育基因的定位
发布时间：2021-05-19 10:11
利用十字花科芸薹属白菜薹雄性不育系的育种是发挥其显著杂种优势最为理想的育种的方法。本试验所用白菜薹材料是课题组早年选育的湘薹‘SN-1’不育系,也是本试验中目的基因的供体。为充分发掘白菜薹雄性不育系的优势,推动白菜薹杂交育种进程,本试验在BSR-Seq的基础上,开发与目的基因紧密连锁的SSR标记,并对其进行定位,获得结果如下:本试验之前已经以湘薹‘SN-1’和大白菜DH系‘FT’为亲本构建育性分离群体,经F1群体性状鉴定可得:白菜薹不育基因与本课题组发现的大白菜不育基因的位点不同;经F2群体遗传分析可得:该不育基因是单基因核雄性不育基因;通过BSR-Seq技术,初步将白菜薹细胞核雄性不育基因定位在A01和A05染色体上;利用初步定位结果,结合大白菜数据库在候选区间内设计并筛选SSR引物,最终获得2个与目的基因紧密连锁的SSR引物:2[12]和three[11];并将白菜薹细胞核雄性不育基因定位在A01染色体2.99-6.5Mb区间内,该区间内含有618个候选基因。
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：50 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
前言
文献综述
1.1 白菜薹的概述
1.2 芸薹属植物雄性不育的研究
1.3 芸薹属作物细胞核雄性不育的分子生物学研究进展
1.3.1 分子标记技术的概述
1.3.2 芸薹属作物细胞核雄性不育的分子生物学研究进展
1.4 本研究的目的意义及技术路线
1.4.1 目的与意义
1.4.2 本试验的技术路线
基于BSR-Seq的白菜薹细胞核雄性不育基因的定位
2.1 试验材料与方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 实验材料花器形态观察
2.1.3 冷冻切片
2.1.4 BSR-Seq流程
2.1.5 SSR标记的合成与筛选
2.1.6 DNA的提取
2.1.7琼脂糖凝胶电泳实验
2.1.8 PCR扩增
2.1.9 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验
2.1.10 主要仪器
2.1.11 酶及试剂
2.2 结果与分析
2.2.1 测序数据质量分析
2.2.2 参考序列比对分析
2.2.3 SNV和 InDel分析
2.2.4 基因表达分析
2.2.5 RNA-seq整体质量评估
2.2.6 基因差异表达分析
2.2.7 目标性状区域定位
2.2.8 白菜薹细胞核雄性不育基因染色体定位
讨论与结论
3.1 讨论
3.2 结论
3.3 本研究的后续工作
参考文献
附录
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]大白菜雄性不育研究进展[J]. 石凤岩,周雪,刘志勇,赵莹,董诗瑶,冯辉. 分子植物育种. 2018(17)
[2]大白菜细胞质雄性不育系选育及其细胞学观察[J]. 郭瑛琪,崔海芳,李海燕,岳艳玲. 云南农业大学学报(自然科学). 2016(03)
[3]白菜薹研究与应用进展[J]. 吴湖龙,杨湘虹,成红波,刘乐承. 长江大学学报(自科版). 2016(03)
[4]大白菜细胞核复等位雄性不育基因定位[J]. 肖纯梅,张慧,张淑江,李菲,章时蕃,孙日飞. 植物遗传资源学报. 2016(01)
[5]白菜薹杂交新组合比较试验[J]. 詹远华,王欢妍,张忠武,田军,杨连勇. 湖南农业科学. 2015(05)
[6]黄心春结球白菜核基因雄性不育系的创制与利用[J]. 李承彧,范永怀,冯辉. 沈阳农业大学学报. 2015(02)
[7]植物介导的RNA干扰南方根结线虫Mi-eft2基因的转基因番茄的研究[J]. 黎娟华,孙海彦,赵平娟,彭明. 基因组学与应用生物学. 2015(03)
[8]几个白菜薹杂种一代比较试验报告[J]. 周妍萍,王先琳,晏儒来,陈利丹. 农业与技术. 2015(04)
[9]大白菜CMS7311雄性不育的发生与花蕾内源激素含量变化的关系研究[J]. 许小勇,张静,孙希禄,李梅兰,雷鸣,张鲁刚. 华北农学报. 2014(06)
[10]定向转育卵圆生态型大白菜雄性不育系的研究(英文)[J]. 谭翀,郭瑛琪,岳艳玲. Agricultural Science & Technology. 2014(03)
博士论文
[1]大白菜核基因雄性不育突变体ftms的鉴定[D]. 谭翀.沈阳农业大学 2018
[2]大白菜细胞核雄性不育基因的分子标记及定位[D]. 张慧.中国农业科学院 2010
硕士论文
[1]白菜薹细胞核雄性不育基因分子标记的开发[D]. 王馨哲.沈阳农业大学 2017
[2]白菜薹细胞质雄性不育转育研究及遗传多样性分析[D]. 李雪红.华中农业大学 2013
本文编号：3195596
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：50 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
前言
文献综述
1.1 白菜薹的概述
1.2 芸薹属植物雄性不育的研究
1.3 芸薹属作物细胞核雄性不育的分子生物学研究进展
1.3.1 分子标记技术的概述
1.3.2 芸薹属作物细胞核雄性不育的分子生物学研究进展
1.4 本研究的目的意义及技术路线
1.4.1 目的与意义
1.4.2 本试验的技术路线
基于BSR-Seq的白菜薹细胞核雄性不育基因的定位
2.1 试验材料与方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 实验材料花器形态观察
2.1.3 冷冻切片
2.1.4 BSR-Seq流程
2.1.5 SSR标记的合成与筛选
2.1.6 DNA的提取
2.1.7琼脂糖凝胶电泳实验
2.1.8 PCR扩增
2.1.9 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验
2.1.10 主要仪器
2.1.11 酶及试剂
2.2 结果与分析
2.2.1 测序数据质量分析
2.2.2 参考序列比对分析
2.2.3 SNV和 InDel分析
2.2.4 基因表达分析
2.2.5 RNA-seq整体质量评估
2.2.6 基因差异表达分析
2.2.7 目标性状区域定位
2.2.8 白菜薹细胞核雄性不育基因染色体定位
讨论与结论
3.1 讨论
3.2 结论
3.3 本研究的后续工作
参考文献
附录
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]大白菜雄性不育研究进展[J]. 石凤岩,周雪,刘志勇,赵莹,董诗瑶,冯辉. 分子植物育种. 2018(17)
[2]大白菜细胞质雄性不育系选育及其细胞学观察[J]. 郭瑛琪,崔海芳,李海燕,岳艳玲. 云南农业大学学报(自然科学). 2016(03)
[3]白菜薹研究与应用进展[J]. 吴湖龙,杨湘虹,成红波,刘乐承. 长江大学学报(自科版). 2016(03)
[4]大白菜细胞核复等位雄性不育基因定位[J]. 肖纯梅,张慧,张淑江,李菲,章时蕃,孙日飞. 植物遗传资源学报. 2016(01)
[5]白菜薹杂交新组合比较试验[J]. 詹远华,王欢妍,张忠武,田军,杨连勇. 湖南农业科学. 2015(05)
[6]黄心春结球白菜核基因雄性不育系的创制与利用[J]. 李承彧,范永怀,冯辉. 沈阳农业大学学报. 2015(02)
[7]植物介导的RNA干扰南方根结线虫Mi-eft2基因的转基因番茄的研究[J]. 黎娟华,孙海彦,赵平娟,彭明. 基因组学与应用生物学. 2015(03)
[8]几个白菜薹杂种一代比较试验报告[J]. 周妍萍,王先琳,晏儒来,陈利丹. 农业与技术. 2015(04)
[9]大白菜CMS7311雄性不育的发生与花蕾内源激素含量变化的关系研究[J]. 许小勇,张静,孙希禄,李梅兰,雷鸣,张鲁刚. 华北农学报. 2014(06)
[10]定向转育卵圆生态型大白菜雄性不育系的研究(英文)[J]. 谭翀,郭瑛琪,岳艳玲. Agricultural Science & Technology. 2014(03)
博士论文
[1]大白菜核基因雄性不育突变体ftms的鉴定[D]. 谭翀.沈阳农业大学 2018
[2]大白菜细胞核雄性不育基因的分子标记及定位[D]. 张慧.中国农业科学院 2010
硕士论文
[1]白菜薹细胞核雄性不育基因分子标记的开发[D]. 王馨哲.沈阳农业大学 2017
[2]白菜薹细胞质雄性不育转育研究及遗传多样性分析[D]. 李雪红.华中农业大学 2013
本文编号：3195596
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3195596.html
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