基于上皮间质转化基因表达谱筛选头颈鳞癌预后风险标志物

发布时间：2021-05-21 05:45

　　目的:头颈部鳞状细胞癌（Head and neck squamous cell cancer,HNSCC）是全球最常见的癌症类型之一。有许多报道表明,通过数据库挖掘探索的生物标志物在预测HNSCC预后中起着至关重要的作用。然而,用于预后分析的单一生物标志物是不够的。因此,越来越多的证据表明基因签名可能是HNSCC预后的更好选择。方法:1.下载人类肿瘤基因组数据库（The Cancer Genome Atlas,TCGA）中头颈鳞癌相关的mRNA数据及临床病理参数。2.进行基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis,GSEA）,我们发现参与上皮间质转化（Epithelial-Mesenchymal Transformation,EMT）的基因集HNSCC发生发展密切相关。以归一化P值（P<0.05）为条件进一步筛选所研究的基因集。3.筛选癌与癌旁组织中差异表达的基因。4.单因素以及多因素Cox回归模型进行mRNAs与预后相关的筛选,并构建基于mRNAs表达的分子标签用于预测患者的预后。5.K-M曲线预测分子标签对头颈鳞癌患者预后的预测能力。6.将患者随... 

【文章来源】：中国医科大学辽宁省

【文章页数】：51 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略语
1 前言
2 材料与方法
    2.1 患者临床参数及基因组表达数据
    2.2 功能富集分析
    2.3 统计分析
3 结果
    3.1 上皮间质转化相关基因集在癌旁样本和肿瘤样本之间差异显著
    3.2 Cox回归分析上皮间质转化相关的预后基因
    3.3 构建基于4个mRNAs的分子标签
    3.4 mRNAs分子标签独立于其他临床变量预测患者预后
    3.5 HNSCC中4-m RNA标签的功能富集分析
4 讨论
5 结论
本研究创新性的自我评价
参考文献
综述
    1 前言
    2 分子技术和遗传基因改变与头颈癌
        2.1 细胞遗传学与杂合性丢失
        2.2 微阵列
        2.3 抑癌基因
        2.4 癌基因
        2.5 线粒体突变
        2.6 其他基因改变
    3 结论
    参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
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本文编号：3199162