BSP测序检测青海地区汉、藏族胃癌患者中TGFBI的甲基化状态
发布时间:2021-05-21 20:02
目的:通过检测胃癌(Gastric cancer,GC)患者癌组织及与之相匹配的癌旁组织中TGFBI基因启动子甲基化状态,探讨TGFBI基因甲基化与GC发生、发展的关系。通过民族间的比较,探讨汉族、藏族GC患者之间TGFBI基因启动子甲基化是否具有差异性,为青海地区GC高发及民族间发病率存在差异的可能原因提供相关理论数据。方法:1.收集2019年03月至2019年11月于青海大学附属医院住院并行胃镜活检,首次病理确诊为GC的患者28例。其中,GC组织样本和配对癌旁组织样本各28个。2.依据民族不同分组:汉族17例,藏族11例。3.采用亚硫酸氢盐测序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法检测各样本TGFBI基因启动子甲基化程度,并进行统计学分析。结果:1.GC组织TGFBI基因启动子甲基化克隆数478个,甲基化率为11.42%;癌旁组织TGFBI基因启动子甲基化克隆数293个,甲基化率为6.98%;GC组织甲基化程度高于与其相匹配的癌旁组织,差异具有统计学意义(P<0.05)。2.汉族、藏族GC组织中,汉族TGFBI基因启动子甲基化克隆数299个,平均甲基化...
【文章来源】:青海大学青海省 211工程院校
【文章页数】:45 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
主要符号及英文缩写对照
第1章 前言
第2章 材料及方法
2.1 研究对象
2.1.1 一般资料
2.1.2 纳入及排除标准
2.2 实验材料及试剂
2.3 实验仪器
2.4 实验方法步骤
2.4.1 GC组织、癌旁组织DNA提取
2.4.2 DNA亚硫酸氢钠修饰
2.4.3 引物设计
2.4.4 PCR反应体系
2.4.5 反应条件
2.4.6 电泳检测条带
2.4.7 连接反应体系
2.4.8 连接产物转化
2.4.9 蓝白斑筛选
2.4.10 测序
2.5 实验技术路线图
2.6 实验结果统计
第3章 结果
3.1 TGFBI基因启动子区Cp G岛的分布
3.1.1 应用在线平台,TGFBI基因启动子区Cp G岛
3.2 GC患者癌及癌旁组织中TGFBI基因启动子甲基化的状态
3.3 汉、藏族GC患者,癌及癌旁组织中TGFBI基因启动子甲基化状态
3.3.1 汉、藏族GC患者,癌组织中TGFBI基因启动子甲基化状态
3.3.2 汉、藏GC患者,癌旁组织中TGFBI基因启动子甲基化状态
3.4 TGFBI基因启动子甲基化与临床病理特征的关系
第4章 讨论
第5章 结论
参考文献
作者在读期间科研成果简介
致谢
附录 文献综述 消化系统肿瘤与TGFBI的表达相关性的研究进展
参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]Aberrant methylation of secreted protein acidic and rich in cysteine gene and its significance in gastric cancer[J]. Shuai Shao,Nuo-Ming Zhou,Dong-Qiu Dai. World Journal of Gastroenterology. 2019(46)
[2]Early gastric cancer diagnostic ability of ultrathin endoscope loaded with laser light source[J]. Takuto Suzuki,Yoshiyasu Kitagawa,Rino Nankinzan,Taketo Yamaguchi. World Journal of Gastroenterology. 2019(11)
[3]胃癌中EXD3基因的表达及功能的生物信息学分析[J]. 孙灯众,刘牧林,吴华彰,黄福新. 南方医科大学学报. 2019(02)
[4]中国恶性肿瘤流行情况及防控现状[J]. 曹毛毛,陈万青. 中国肿瘤临床. 2019(03)
[5]Prognostic significance of tumor immune microenvironment and immunotherapy: Novel insights and future perspectives in gastric cancer[J]. Daniela Cornelia Laz?r,Mihaela Flavia Avram,Ioan Romo?an,M?rioara Cornianu,Sorina T?ban,Adrian Goldi?. World Journal of Gastroenterology. 2018(32)
[6]汉族与藏族胃癌发病率及危险因素分析[J]. 任波. 解放军预防医学杂志. 2017(05)
[7]高原藏族人群胃癌发病危险因素病例对照研究[J]. 李康,旦增,刘晓波,刘明花,泽永革,次仁措姆,边巴扎西. 中国公共卫生. 2013(11)
[8]1979-2008年青海地区经胃镜检出胃癌6362例[J]. 荣光宏,熊元治,杨永耿,刘芝兰,赵相,逯艳艳. 世界华人消化杂志. 2012(36)
本文编号:3200296
【文章来源】:青海大学青海省 211工程院校
【文章页数】:45 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
主要符号及英文缩写对照
第1章 前言
第2章 材料及方法
2.1 研究对象
2.1.1 一般资料
2.1.2 纳入及排除标准
2.2 实验材料及试剂
2.3 实验仪器
2.4 实验方法步骤
2.4.1 GC组织、癌旁组织DNA提取
2.4.2 DNA亚硫酸氢钠修饰
2.4.3 引物设计
2.4.4 PCR反应体系
2.4.5 反应条件
2.4.6 电泳检测条带
2.4.7 连接反应体系
2.4.8 连接产物转化
2.4.9 蓝白斑筛选
2.4.10 测序
2.5 实验技术路线图
2.6 实验结果统计
第3章 结果
3.1 TGFBI基因启动子区Cp G岛的分布
3.1.1 应用在线平台,TGFBI基因启动子区Cp G岛
3.2 GC患者癌及癌旁组织中TGFBI基因启动子甲基化的状态
3.3 汉、藏族GC患者,癌及癌旁组织中TGFBI基因启动子甲基化状态
3.3.1 汉、藏族GC患者,癌组织中TGFBI基因启动子甲基化状态
3.3.2 汉、藏GC患者,癌旁组织中TGFBI基因启动子甲基化状态
3.4 TGFBI基因启动子甲基化与临床病理特征的关系
第4章 讨论
第5章 结论
参考文献
作者在读期间科研成果简介
致谢
附录 文献综述 消化系统肿瘤与TGFBI的表达相关性的研究进展
参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]Aberrant methylation of secreted protein acidic and rich in cysteine gene and its significance in gastric cancer[J]. Shuai Shao,Nuo-Ming Zhou,Dong-Qiu Dai. World Journal of Gastroenterology. 2019(46)
[2]Early gastric cancer diagnostic ability of ultrathin endoscope loaded with laser light source[J]. Takuto Suzuki,Yoshiyasu Kitagawa,Rino Nankinzan,Taketo Yamaguchi. World Journal of Gastroenterology. 2019(11)
[3]胃癌中EXD3基因的表达及功能的生物信息学分析[J]. 孙灯众,刘牧林,吴华彰,黄福新. 南方医科大学学报. 2019(02)
[4]中国恶性肿瘤流行情况及防控现状[J]. 曹毛毛,陈万青. 中国肿瘤临床. 2019(03)
[5]Prognostic significance of tumor immune microenvironment and immunotherapy: Novel insights and future perspectives in gastric cancer[J]. Daniela Cornelia Laz?r,Mihaela Flavia Avram,Ioan Romo?an,M?rioara Cornianu,Sorina T?ban,Adrian Goldi?. World Journal of Gastroenterology. 2018(32)
[6]汉族与藏族胃癌发病率及危险因素分析[J]. 任波. 解放军预防医学杂志. 2017(05)
[7]高原藏族人群胃癌发病危险因素病例对照研究[J]. 李康,旦增,刘晓波,刘明花,泽永革,次仁措姆,边巴扎西. 中国公共卫生. 2013(11)
[8]1979-2008年青海地区经胃镜检出胃癌6362例[J]. 荣光宏,熊元治,杨永耿,刘芝兰,赵相,逯艳艳. 世界华人消化杂志. 2012(36)
本文编号:3200296
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3200296.html
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