茶树NAC基因的鉴定及其在逆境反应中的表达调控分析

发布时间：2021-05-27 14:24

　　利用隐马可夫模型检索和同源比对的方法,从茶树基因组鉴定出108个NAC成员（CsNAC）.理化特征、进化关系、基因结构和保守基序分析表明,CsNAC蛋白长度在134～1950个氨基酸之间,分子量介于15.4～222kD,等电点介于4.60～9.91,大部分为亲水性蛋白（除CsNAC97）.其中,CsNAC3、8、14、23、32、74、82、90、106蛋白含跨膜结构域.进化分析将CsNAC家族分为18个亚类,ONAC022和NAP亚类成员最多,AtNAC3和OsNAC8亚类成员最少.CsNAC基因启动子区富含响应干旱、低温、盐胁迫以及病原菌侵染的序列元件.据转录组数据分析结果,CsNAC基因家族成员在不同组织和胁迫处理后呈现显著的表达差异.低温和干旱胁迫下的CsNAC共表达网络中,ABA参与调控其关键基因的表达;KEGG分析显示,信号传递、糖代谢、植物与病原菌互作等途径存在显著富集. 

【文章来源】：信阳师范学院学报(自然科学版). 2020,33(04)北大核心

【文章页数】：12 页

【文章目录】：
0 引言
1 材料和方法
    1.1 茶树NAC转录因子家族的鉴定和序列分析
    1.2 CsNAC基因家族系统进化树构建
    1.3 CsNAC基因结构和保守结构域分析
    1.4 CsNAC基因启动子顺式作用元件分析
    1.5 CsNAC基因表达分析
    1.6 CsNAC基因共表达和相互作用分析
2 结果与分析
    2.1 茶树NAC家族的组成及其分子特征
    2.2 CsNAC家族的系统进化
    2.3 CsNAC的结构和保守基序分析
    2.4 CsNAC基因启动子元件分析
    2.5 CsNAC基因的表达分析
    2.6 逆境反应中CsNAC基因调控通路的功能富集及调控网络分析
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]茶树TCP家族的全基因组鉴定及其表达分析[J]. 周棋赢,韩月华,祝悦,陈赛,李先文,彭波,袁红雨.  园艺学报. 2019(10)
[2]植物NAC转录因子的生物学功能[J]. 张慧珍,白雪芹,曾幼玲.  植物生理学报. 2019(07)
[3]小麦转录因子基因TaNAC67参与调控穗长和每穗小穗数[J]. 张宏娟,李玉莹,苗丽丽,王景一,李超男,杨德龙,毛新国,景蕊莲.  作物学报. 2019(11)
[4]大豆bHLH转录因子家族成员的进化及功能分化研究[J]. 程琳,薛亚杰,付觉民,刘旭阳,曲骁冲,代幸龙,董沛峰,徐月霞,洪一峰,姚远,赵基海.  信阳师范学院学报(自然科学版). 2019(01)
[5]转录因子NAC及其在植物生长发育中的作用[J]. 李桂玲,李思云,刘卫群.  分子植物育种. 2019(03)



本文编号：3207738