兴安落叶松几丁质酶基因的功能分析
发布时间：2021-06-17 10:56
几丁质酶是一种病程相关蛋白,在植物抵御真菌中发挥作用。另一方面,该蛋白能够降低冰点,抑制了冰晶的生长与重结晶,在植物抵御冻害中发挥作用。所以,几丁质酶基因为植物的抗病和耐寒基因遗传工程提供了一个重要的候选基因。本研究通过RNA-Seq技术获取了兴安落叶松的转录组,并对几丁质酶基因家族进行分析。利用遗传转化拟南芥的方法鉴定了前期研究中克隆的兴安落叶松几丁质酶基因（Lgchi2）在植物低温与病害胁迫下发挥的作用。主要获得以下结果:1.利用RNA-Seq技术对兴安落叶松转录组进行分析发现,在兴安落叶松中含有7个几丁质酶基因家族成员,它们参与几丁质结合、几丁质酶的活性、细胞代谢过程、甲壳素分解代谢及几丁质酶的防御作用。该结果为后续系统分析兴安落叶松几丁质酶基因的特征、调控机理及生物学功能奠定了基础。2.为分析Lgchi基因的功能,通过花絮浸染的方法,获得了转Lgchi基因的拟南芥株系。低温胁迫研究显示,几丁质酶活性随胁迫时间的增加呈现出先升高后降低趋势,转化Lgchia1和Lgchia2基因的拟南芥植株的几丁质酶活性显著高于野生型,并且转化Lgchia2株系的几丁质酶活性大于转化Lgchia1...
【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】：39 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
几丁质酶基因结构
结果功能注释及基因表达和基因表达差异水平的衡量［48］，如图2-4:图 2-4 转录组数据分析流程图Fig2-4 Transcriptome data analysis flow chart1 GO 功能富集分析??GO（Gene Ontology）［44］是对基因和蛋白质功能进行限定和描述， GO 功能富集分析是在 GO 数据库分析可以找出在统计上，显著富集的 GO Term，通过该分析能够获得该基因的 GO 信息。2 KEGG Pathy way 富集性分析??KEGG 是对基因功能，基因组信息数据库进一步系统分析。以 KEGG 公共数据库为基础，并通过 ID 对应方法找到与之对应的 Pathy way ID，即基因的代谢途径［44］。3 KOG 富集性分析?KOG 是真核生物直系同源蛋白簇，且典型地保留与原始蛋白有相同的功能［44］。查找方法如上。18
-1 Lgchia2农杆菌转化鉴定M：200bp DNA Marker1；农杆菌2：农杆菌grobacterium transformation Lg、鉴定选、鉴定 转化农杆菌 GV3101，南芥 T0代种子，在培拟南芥植株。通过自-2），及对实验前期转
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物低温胁迫响应机理的研究进展[J]. 薛爽,饶丽莎,左丹丹,汪凤林,林思祖. 安徽农业科学. 2016(33)
[2]独行菜种子转录组的高通量测序及分析[J]. 周茜,赵惠新,李萍萍,曾卫军,李艳红,葛风伟,赵君洁,赵和平. 中国生物工程杂志. 2016(01)
[3]甘蔗几丁质酶基因ScChiⅣ1的克隆、序列分析及其表达[J]. 许颖,王竹青,吴期滨,陈云,杨春春,冯敏谢,苏亚春. 基因组学与应用生物学. 2015(06)
[4]油菜温敏雄性不育系K121S育性转换基因的分子定位[J]. 周筱妍,张传利,李岩,杨进成,李石开,白孟斌,陈升位,彭少丹,林良斌. 分子植物育种. 2015(04)
[5]低温胁迫对葡萄枝条抗寒性的影响[J]. 卢精林,李丹,祁晓婷,孙晓燕. 东北农业大学学报. 2015(04)
[6]辣椒几丁质酶基因受疫霉菌及灰霉菌侵染时的表达变化[J]. 孔维文,闵琪,董京萍,李斌,黄奔立. 扬州大学学报(农业与生命科学版). 2014(03)
[7]转几丁质酶基因烟草对三种真菌拮抗作用的研究[J]. 闫文慧,王兵,楼康怡,杨星勇,申鸿. 西南师范大学学报(自然科学版). 2014(10)
[8]NO处理对采后芒果抗氧化酶系统的影响[J]. 陈娇,袁德保,谭琳,李奕星,李芬芳,郑晓燕,郑丽丽,金志强. 安徽农业科学. 2014(26)
[9]低温胁迫对核桃枝条活性氧代谢的影响[J]. 相昆,徐颖,王新亮,李国田,张美勇. 江西农业学报. 2014(01)
[10]甘蔗几丁质酶基因的电子克隆与生物信息学分析[J]. 苏亚春,李国印,阙友雄,郭晋隆,徐景升,许莉萍. 生物信息学. 2011(04)
博士论文
[1]唐古特白刺果实发育的差异表达基因分析及NtUFGT基因的克隆和功能研究[D]. 王佳.内蒙古大学 2016
[2]甘蓝型油菜低温诱导的转录组和蛋白组分析[D]. 杜春芳.华中农业大学 2016
[3]低温胁迫下甜菜碱对番茄叶片光合作用的保护机制[D]. 卫丹丹.山东农业大学 2016
[4]番茄叶绿体DnaJ蛋白SlCDJ2的功能分析[D]. 王国栋.山东农业大学 2016
[5]西芹种子浸提液对黄瓜枯萎病菌化感作用及其机理的研究[D]. 贾俊英.内蒙古农业大学 2011
[6]低温胁迫与锻炼对草莓生理特性的影响和草莓几丁质酶基因的克隆[D]. 罗娅.四川农业大学 2007
[7]几丁寡糖结构类似物β-1，3-乙酰氨基葡聚糖的化学合成及其诱导植物抗病性的研究[D]. 姚艳平.浙江大学 2006
[8]小麦受条锈菌侵染后防卫基因的表达特征及其克隆[D]. 崔素萍.西北农林科技大学 2005
硕士论文
[1]花椒几丁质酶基因ZaCHIT1克隆及表达分析[D]. 刘雪薇.贵州大学 2017
[2]兴安落叶松几丁质酶基因的克隆及特性分析[D]. 张丽.内蒙古大学 2016
[3]芍药种子下胚轴休眠与萌发相关调控基因PlGAI1的克隆及功能分析[D]. 崔金秋.沈阳农业大学 2016
[4]条纹斑竹鲨肝脏中GSTP1基因的miRNA调控及其相互作用蛋白的研究[D]. 史心怡.浙江理工大学 2016
[5]转哈茨木霉双几丁质酶基因（Ech42+Nag70）提高棉花黄萎病抗性的研究[D]. 辛文慧.浙江大学 2016
[6]兴安落叶松几丁质酶基因的克隆及表达特性分析[D]. 余利敏.内蒙古农业大学 2014
[7]日本三角涡虫转录组、再生表达谱及小RNA谱的鉴定与分析[D]. 秦云飞.郑州大学 2012
[8]小麦几丁质酶基因的检测及酶活性测定[D]. 徐恩静.安徽农业大学 2011
[9]花椰菜菌核病抗性种质资源筛选及诱导抗性生理基础研究[D]. 孙溶溶.浙江大学 2011
[10]球孢白僵菌几丁质酶基因Bbchit1抗病作用研究[D]. 郭绍辉.西南大学 2007
本文编号：3235063
【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】：39 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
几丁质酶基因结构
结果功能注释及基因表达和基因表达差异水平的衡量［48］，如图2-4:图 2-4 转录组数据分析流程图Fig2-4 Transcriptome data analysis flow chart1 GO 功能富集分析??GO（Gene Ontology）［44］是对基因和蛋白质功能进行限定和描述， GO 功能富集分析是在 GO 数据库分析可以找出在统计上，显著富集的 GO Term，通过该分析能够获得该基因的 GO 信息。2 KEGG Pathy way 富集性分析??KEGG 是对基因功能，基因组信息数据库进一步系统分析。以 KEGG 公共数据库为基础，并通过 ID 对应方法找到与之对应的 Pathy way ID，即基因的代谢途径［44］。3 KOG 富集性分析?KOG 是真核生物直系同源蛋白簇，且典型地保留与原始蛋白有相同的功能［44］。查找方法如上。18
-1 Lgchia2农杆菌转化鉴定M：200bp DNA Marker1；农杆菌2：农杆菌grobacterium transformation Lg、鉴定选、鉴定 转化农杆菌 GV3101，南芥 T0代种子，在培拟南芥植株。通过自-2），及对实验前期转
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物低温胁迫响应机理的研究进展[J]. 薛爽,饶丽莎,左丹丹,汪凤林,林思祖. 安徽农业科学. 2016(33)
[2]独行菜种子转录组的高通量测序及分析[J]. 周茜,赵惠新,李萍萍,曾卫军,李艳红,葛风伟,赵君洁,赵和平. 中国生物工程杂志. 2016(01)
[3]甘蔗几丁质酶基因ScChiⅣ1的克隆、序列分析及其表达[J]. 许颖,王竹青,吴期滨,陈云,杨春春,冯敏谢,苏亚春. 基因组学与应用生物学. 2015(06)
[4]油菜温敏雄性不育系K121S育性转换基因的分子定位[J]. 周筱妍,张传利,李岩,杨进成,李石开,白孟斌,陈升位,彭少丹,林良斌. 分子植物育种. 2015(04)
[5]低温胁迫对葡萄枝条抗寒性的影响[J]. 卢精林,李丹,祁晓婷,孙晓燕. 东北农业大学学报. 2015(04)
[6]辣椒几丁质酶基因受疫霉菌及灰霉菌侵染时的表达变化[J]. 孔维文,闵琪,董京萍,李斌,黄奔立. 扬州大学学报(农业与生命科学版). 2014(03)
[7]转几丁质酶基因烟草对三种真菌拮抗作用的研究[J]. 闫文慧,王兵,楼康怡,杨星勇,申鸿. 西南师范大学学报(自然科学版). 2014(10)
[8]NO处理对采后芒果抗氧化酶系统的影响[J]. 陈娇,袁德保,谭琳,李奕星,李芬芳,郑晓燕,郑丽丽,金志强. 安徽农业科学. 2014(26)
[9]低温胁迫对核桃枝条活性氧代谢的影响[J]. 相昆,徐颖,王新亮,李国田,张美勇. 江西农业学报. 2014(01)
[10]甘蔗几丁质酶基因的电子克隆与生物信息学分析[J]. 苏亚春,李国印,阙友雄,郭晋隆,徐景升,许莉萍. 生物信息学. 2011(04)
博士论文
[1]唐古特白刺果实发育的差异表达基因分析及NtUFGT基因的克隆和功能研究[D]. 王佳.内蒙古大学 2016
[2]甘蓝型油菜低温诱导的转录组和蛋白组分析[D]. 杜春芳.华中农业大学 2016
[3]低温胁迫下甜菜碱对番茄叶片光合作用的保护机制[D]. 卫丹丹.山东农业大学 2016
[4]番茄叶绿体DnaJ蛋白SlCDJ2的功能分析[D]. 王国栋.山东农业大学 2016
[5]西芹种子浸提液对黄瓜枯萎病菌化感作用及其机理的研究[D]. 贾俊英.内蒙古农业大学 2011
[6]低温胁迫与锻炼对草莓生理特性的影响和草莓几丁质酶基因的克隆[D]. 罗娅.四川农业大学 2007
[7]几丁寡糖结构类似物β-1，3-乙酰氨基葡聚糖的化学合成及其诱导植物抗病性的研究[D]. 姚艳平.浙江大学 2006
[8]小麦受条锈菌侵染后防卫基因的表达特征及其克隆[D]. 崔素萍.西北农林科技大学 2005
硕士论文
[1]花椒几丁质酶基因ZaCHIT1克隆及表达分析[D]. 刘雪薇.贵州大学 2017
[2]兴安落叶松几丁质酶基因的克隆及特性分析[D]. 张丽.内蒙古大学 2016
[3]芍药种子下胚轴休眠与萌发相关调控基因PlGAI1的克隆及功能分析[D]. 崔金秋.沈阳农业大学 2016
[4]条纹斑竹鲨肝脏中GSTP1基因的miRNA调控及其相互作用蛋白的研究[D]. 史心怡.浙江理工大学 2016
[5]转哈茨木霉双几丁质酶基因（Ech42+Nag70）提高棉花黄萎病抗性的研究[D]. 辛文慧.浙江大学 2016
[6]兴安落叶松几丁质酶基因的克隆及表达特性分析[D]. 余利敏.内蒙古农业大学 2014
[7]日本三角涡虫转录组、再生表达谱及小RNA谱的鉴定与分析[D]. 秦云飞.郑州大学 2012
[8]小麦几丁质酶基因的检测及酶活性测定[D]. 徐恩静.安徽农业大学 2011
[9]花椰菜菌核病抗性种质资源筛选及诱导抗性生理基础研究[D]. 孙溶溶.浙江大学 2011
[10]球孢白僵菌几丁质酶基因Bbchit1抗病作用研究[D]. 郭绍辉.西南大学 2007
本文编号：3235063
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3235063.html
最近更新
教材专著
