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超表达AtHARBI1-2对转基因拟南芥生长发育的影响

发布时间:2021-06-22 18:17
  HARBI1(Harbinger Transposase Derived 1)蛋白起源于脊椎动物共同祖先(硬骨鱼纲)中的活跃的Harbinger转座酶,是迄今唯一已知的与PIF/Harbinger转座元件同源的脊椎动物基因,编码350个氨基酸。HARBI1是DDE转座酶,属于DDETnp4家族蛋白,该家族成员的蛋白分子结构特征为具有三个高度保守的亲核氨基酸残基,包括两个天冬氨酸残基(D)和一个谷氨酸残基(E)。HARBI1包含有DDE转座酶的共同特征,能够实现转座元件位移的反应,是催化DNA断裂和重组的关键蛋白。本研究是在中间锦鸡儿CiHA见B11基因的研究基础上展开的。为验证更进一步研究HARBI1在植物中的功能及其作用机制,本实验选取拟南芥(Arabidopsisthaliana)中的同源基因AtH4RBI1-2进行了功能分析。主要结果如下:1.从拟南芥中克隆得到多胁迫响应的DDETnp4家族基因AtHARBI1-2。其cDNA长度为1509bp,编码502个氨基酸,蛋白的分子量预测为56.82... 

【文章来源】:内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】:59 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

超表达AtHARBI1-2对转基因拟南芥生长发育的影响


图2?IAA生物合成途径??Fig.2?The?IAA?biosynthesis?pathway??生长素极性转运对叶片及其叶脉的发育至关重要

技术路线图,技术路线


?内蒙古农业大学硕士学位论文?21??1.5创新点??HARBI1只在动物中有研宄,在刘建政之前,它在植物中的研宄还未见报道,本??实验以刘建政的研宄为基础,更进一步研究HARBI1在植物中的功能及其作用机制。??1.6技术路线??f拟南芥RNA、 ̄??.DNA轉取??:?T????士产、十卩f?AlHARBIl-2?]、「不同胁迫处理下的基??|生物fe息子分析卜?1?cDNA的克隆?"因表达模式分析??.?i?^?T-?;????(?'??突变体的PC?R鉴定?过表达载体的构建??.??^?V?■/??三引物法?[遗传转化及过裁、??I?、?[株系的纖与觀,??获得纯合突变体j?f?、??—?f表型織??v??????????f生理生化指标的检测与1??分析??V?J???基因功能分析???S?t??图4技术路线??Fig.4?The?technical?route??

疏水性,蛋白,二级结构,蛋白质二级结构


put?for?user_sequence??3??(?,?,?,???Hphob.?/Kyte?&?Doolittle?:??2???.i?I?|?丨丨"??,;f{?"I.獻滅機dfii?¥??x?I?fullr!?^?'ifiu?'I??,….11...?_丨〖例,十??:liljf?H,:?'?'?:-.J??1?I?.??_4??i?i?I?i?i??0?100?200?300?400?500??Position?■??图6?AtHARBIl-2蛋白的疏水性预测??Fig.6?Prediction?of?hydrophobicity?of?AtHARBIl-2??3.1.3蛋白的二级结构预测??利用SOPMA对基因编码的蛋白质二级结构进行预测分析,预测结??果如图7所示,AtHARBIl-2的二级结构中含有由270、163、48、21个氨基酸形成??的a-螺旋结构、无规则卷曲、延伸链和(3-转角,所占比例分别为53.78%、32.47%、9.56%??和?4_18%。??19?2&?30?43?S??m??!?i?I?I?I?i?i????EE££VCNV??DS65,V55KRk??e?TK?ii?Kdifnill-*6?gH£?K-QDQ£Af?f^S????hhh??t*?*hhhhhhhhhhhhhhs?hhhhhhKhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh??£^SLpQSrr/fiKR;:.?T^5DV^SDL?r^>;.D;-E£S<sDX^LKKiRvSftAVASVAVAiAS£ie^£SSSITaS5S??

【参考文献】:
期刊论文
[1]细胞分裂素的生物合成、受体和信号转导的研究进展[J]. 罗超,黄世文,王菡,赵露.  特产研究. 2011(02)
[2]生长素对拟南芥叶片发育调控的研究进展[J]. 李林川,瞿礼嘉.  植物学通报. 2006(05)

博士论文
[1]调控拟南芥叶早期发育的重要基因AS1,AS2的克隆及功能分析[D]. 孙越.中国科学院研究生院(上海生命科学研究院) 2002

硕士论文
[1]超表达中间锦鸡儿CiHARBI1基因影响转基因拟南芥子叶形态建成[D]. 刘建政.内蒙古农业大学 2018
[2]中间锦鸡儿3个DUF基因的生物信息学分析和CiDUF966-1基因功能分析[D]. 杨天瑞.内蒙古农业大学 2018



本文编号:3243312

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