胃癌发生和转移相关的转录组分析及COL10A1促胃癌转移的研究

发布时间：2021-06-25 00:47

　　研究目的和意义:尽管在过去几十年中手术和化疗在肿瘤治疗上取得很大进展,但胃癌（GC）仍是全球癌症相关死亡率的第三大常见原因,其占所有癌症相关死亡人数的8.8%。早期检测中缺乏生物标志物和发生腹膜转移是胃癌治疗失败的主要原因。所以找到预测疾病进展的分子生物标志物可能促进胃癌药物的开发和治疗策略的改善。研究方法:高通量mRNA测序（RNA-seq）结果显示X型胶原蛋白1（COL10A1）是疾病进展相关基因。103例胃癌患者的组织样本QPCR分析结果显示,COL10A1 mRNA高表达与胃癌转移和存活率降低存在显著相关性。我们使用UCSC基因组网站和JASPAR数据库分析COL10A1的启动子序列,预测潜在的转录因子SOX9结合位点。收集胃癌患者的癌组织和对应的正常胃粘膜组织,利用免疫组化技术进行SOX9和COL10A1表达的定位定量检测分析。同时,收集受检患者的临床资料及随访生存预后的相关信息。接着通过QPCR和Western blot实验分别在转录水平和翻译水平验证SOX9和COL10A1的临床相关性。构建过表达COL10A1和敲低COL10A1的稳转细胞株,同时用转化生长因子-β1（T... 

【文章来源】：南方医科大学广东省

【文章页数】：209 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１－１胃癌组织和相应正常胃粘膜组织ＨＥ染色??结果分别以ｘｌＯＯ，?ｘ２〇〇显示

胃粘膜和胃癌组织之间有５８种差异表达基因，有５０?（８６．２％）种基因表达上调，??８?（１３．８％）种基因表达下调。分组间差异基因的结果见表１－８、表１－９、表１－１０、??表１－１１、图１－３和图１－４。??表１－８分组间差异基因的个数??Ｔａｂｌｅ?１－８?Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｇｒｏｕｐｓ??Ｐａｉｒｓ?ＤｉｆｆＧｅｎｅ（Ｕｐ）?ＤｉｆｆＧｅｎｅ（Ｄｏｗｎ）?ＡＨ?ＤｉｆｆＧｅｎｅ??ＥＧＮ－ｖｓ－ＥＧＴ?２８００?（９３．５％）?１９４?（６．５％）?２９９４??ＡＧＮ－ｖｓ－ＡＧＴ?５０?（８６．２％）?８?（１３．８％）?５８??表１－８各项指标说明??Ｔｅｒｍ?意义??Ｐａｉｒｓ?成对比较??ＤｉｆｆＧｅｎｅ（Ｕｐ）?显著上调的差异基因个数??ＤｉｆｆＧｅｎｅ（Ｄｏｗｎ）?显著下调的差异基因个数??Ａｌｌ?ＤｉｆｆＧｅｎｅ?显著差异表达的基因数目??２８??

以帮助我们了解差异表达基因的整体分布情况。火山图中红色的点代表显著差??异表达上调的基因，绿色的点代表显著差异表达下调的基因，黑色的点代表非显??著性差异表达的基因。早期胃癌组和晚期胃癌组的火山图见


本文编号：3248153