中国五个地区献血人群HCV基因型/亚型分布及进化分析

发布时间：2021-07-06 00:23

　　目的研究国内五个地区血液中心献血人群中HCV基因型/亚型分布及不同基因型HCV的群体遗传学特征。方法收集来自重庆、乌鲁木齐、洛阳、绵阳和广西无偿献血人群的抗-HCV确证实验阳性的血浆标本802（人）份,并统计出献血人群的性别、年龄、民族和职业等人口统计学信息;采用逆转录巢式PCR对HCV core基因片段扩增并测序:应用MEGA 6.0软件构建HCV分子进化树并对其做基因分型和系统发育分析,用Arlequin、DNAsp和BEAST软件进行群体遗传学分析,探讨该地区不同基因型HCV的扩张情况。采用SPSS Statistics 17.0软件来分析HCV基因亚型的分布和人口统计学特征的相关性。结果重庆（116）、乌鲁木齐（104）、绵阳（74）、洛阳（67）和广西（58）五个地区血浆标本中获得阳性扩增的共为419例。共检测出HCV-1a、1b、2a、3a、3b、6a、6e和6n等8个基因亚型,未发现4,5型的存在,且各亚型所占比例分别为 0.72%（3/419）、59.90%（251/419）、16.95%（71/419）、4.53%（19/419）、3.82%（16/419）、12.4... 

【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章页数】：88 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１．逆转录体系９６孔板加样示意图

?中国医学科学院北京协和医学院硕士研究生毕业论文第三部分结果??．ＨＣＶ病毒液ＲＴ－巢式ＰＣＲ体系的优化结果??１部分血浆样品ＨＣＶＣｏｒｅ片段琼脂糖凝胶电泳图??随机选择４个血浆样品进行病毒核酸提取，首先用本实验己优化式ＰＣＲ体积进行扩增，结果随机选择的４个样品均有较亮的条带较好。??

１．３基于退火温度的ＨＣＶ?Ｃｏｒｅ片段扩增电泳图的灰度分析结果??将５０、５２、５４、５６、５８和６０°Ｃ作为退火温度条件下扩增后的琼脂糖凝胶电泳图片??进行灰度分析，每个目的条带都有一个相对应的峰图以及相对应的数值，峰图或数??值越高，表明条带越亮，结果发现５８°Ｃ条件下峰图及数值最高，此时条带最亮。??

【参考文献】：
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本文编号：3267134