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过表达细叶百合LpNAC5和LpNAC13转基因烟草的抗逆性研究

发布时间:2021-07-09 02:57
  细叶百合(Lilium pumilum)花色鲜红,耐盐碱,抗寒性强,是百合抗性育种的重要亲本。本研究以细叶百合LpNAC5和LpNAC13为研究对象,对其进行生物信息学分析,同时,利用荧光定量PCR分析2个基因的时空表达特性及非生物胁迫下基因表达模式,比较过表达LpNAC5和LpNAC13转基因烟草与野生型烟草在干旱、盐和碱胁迫下的生理特性差异,从而探索2个NAC基因在非生物胁迫下的功能.主要研究成果如下:1.生物信息学分析结果表明,LpNAC5和LpNACl3基因ORF区核酸编码的蛋白属于NAC家族,分别编码181和208个氨基酸,蛋白为无跨膜结构域的亲水性蛋白,N-末端有保守DNA结合结构域,被分为5个亚结构域(A~E)。序列同源性分析表明LpNAC5和LpNAC13编码蛋白与蓝花耧斗菜(Aquilegia coerulea)和海枣(Phoenix dactyliera)的同源性最高.系统进化树分析表明,LpNAC5和LpNAC13与拟南芥NAC083在同一枝进化树上,属于SENU5亚族。2.荧光定量分析LpNAC5和LpNAC13基因组织特异性结果表明,2个基因在各个组织中均有表... 

【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:93 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

过表达细叶百合LpNAC5和LpNAC13转基因烟草的抗逆性研究


图2-4细叶百合(A)、(B)蛋白氨基酸序列与拟南芥氨基酸序列的系??统进化树??

百合,结构域,基因,氨基酸


COOs?:?ANAC001?? ̄ri?.?-?AHACC-C?!??^1?I?似0005?丨?ANACOtn???KAC?知??ANACOM????M|?UAC075?I??^0044?i??I?liACOSS?!?ONACO03????MJ?NAC075??3J??AflACC-VJ?i?1W??I?'?NAC099?:?ONACOOB???AHACC73?丨?sTj?|?ANACOlO?;??eel?ANAC073?!??图2-4细叶百合(A)、(B)蛋白氨基酸序列与拟南芥氨基酸序列的系??统进化树??Fig.2-4?Phylogenetic?tree?of?amino?sequences?of?LpNAC5?(A)N?LpNAC13?(B)?and?Arabidopsis??amino?acid?sequences??2.3_1.4保守结构域分析??Conserved?Domains保守区预测分析表明IpAMCJ基因在13-37氨基酸处存??高度保守的NAM域;基因在16-127氨基酸处存在一个高度保守的??NAM域,均属于NAC基因家族(图2-5)。??)??5?7S?l?*?i26?17S?181??t?t?I???I?f?i?i?t?:?f?t?i?t?i?I?i?i?■?i?3?f?:?i?t?I?*?i??Query?seq.?A??5?>ecific?hits??Super?Fanil?ies?丨?NfVI?s^rfawiiy?|??Search?for?sinv,5af?dofnain?a;chi;ech.t

蛋白,信号肽,疏水性,蛋白质


?2细叶百合LpAUC5和LpAUCVj基因生物信息学分析及其表达模式分杉f???精氨酸含量最高,占10.6?%,其次为丝氨酸9.1?%和亮胺酸8.2?%。??(2)蛋白质亲/疏水性预测??利用Protscale软件预测LpM4C5和基因编码蛋白亲/疏水性,结果??表明,基因(图2-6A)在第】17位氨基酸残基处具有最强亲水性,最低??值为-2.544,在100位氨基酸残基处具有最强疏水性,最高值为1.444,位于亲水??区的蛋白占绝大多数,表明LpA^C’5蛋白为亲水蛋白,与其预测为亲水蛋白相??合。??基因(图2-6B)在第134位氨基酸残基处具有最强亲水性,最低??值为-2.533,在46位氨基酸残基处具有最强疏水性,最高值为1.667,位于亲水??区的蛋白占绝大多数,表明以从4£7_5蛋白为亲水蛋白,与其预测为亲水蛋白相??合.??^?ProtScale?output?for?user?sequence?g?ProtScale?output?for?uoer?sequence??1.5? ̄'?7.?'?HphoJ^?/Kyte?G?Dcwlittie???^?'?Hphob?/Kyte?&?bcxJIttle?— ̄??。.:、?s?l?:?;::?A?,丨f、:????oi.yi?Lf、丨,[丨i?…。丨丨卜、ii???\j\?|?v??1?1?ylf!i?,??^?iirlJ?ij?ir??'??-I?w?/?y?\i^?,::1?f'?f?F|!?:.?Jj?:??f?:?r?f???3????'?????????■????-3??■?'?1????20?40

【参考文献】:
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[8]麝香百合和仙客来转Mn-SOD基因植株的获得及其耐热性鉴定[D]. 陈莉.西北农林科技大学 2007
[9]中国野生百合资源调查及遗传多样性分析[D]. 王洁琼.北京林业大学 2006



本文编号:3272871

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