毛果杨HDA903基因的克隆及功能分析
发布时间:2021-07-11 03:48
组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)在植物生长、发育和胁迫应答反应中具有重要的作用。HDAC催化组蛋白去乙酰化,能够影响染色质的结构,调节基因的转录。目前,有关木本植物HDAC在盐胁迫应答反应中的功能研究鲜有报道。本研究从毛果杨中克隆了 HDAC的RPD3/HDA1亚家族基因HDA903,研究了其蛋白质序列、基因的表达与功能。(1)毛果杨HDA903基因的ORF序列长度为1506 bp,其编码的蛋白质含有501个氨基酸,该蛋白质的等电点为5.26,属于稳定、亲水性蛋白质。在该蛋白质的N端存在一个HDAC结构域,系统进化树分析表明毛果杨HDA903蛋白与胡杨HDA19亲缘关系较近。(2)利用荧光定量PCR方法分析HDA903基因的表达。HDA903基因能够在毛果杨不同器官中表达,但不具有组织特异性。对HDA903基因在ABA、盐和低温胁迫下的表达进行分析,表明盐胁迫抑制HDA903的表达,低温诱导HDA903的表达,ABA也能够调节HDA903的表达。(3)通过构建HDA903-GFP载体,利用基因枪轰击法将融合基因导入洋葱表皮细胞中,观察荧光信号。结果显...
【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:52 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
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残基数目(Asp+Glu)为77,正电氨基酸残基数目??(Arg+Lys)为53,不稳定指数是35.29,此值不超过40,即为稳定蛋白质。综上结果??表明,HDA903蛋白为稳定亲水性蛋白。??ProtScals?output?for?user?sequence??3?'?I???Uphob.?/?Kyte?G.?Doolittle?—— ̄??K卿鴨議.??-4????????????0?100?200?300?400?500??Position??图3?HDA903蛋白的亲/疏水性分析??2_3.3_2?HDA903蛋白的跨膜区及磷酸化位点分析??利用?TMHMM?Server?v.?2.0?(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)在线软件,??对HDA903蛋白进行跨膜分析。结果表明,HDA903蛋白的跨膜螺旋个数为0,因此推??测HDA903蛋白不存在跨膜区(图4)。利用KinasePhos?2.0??(http://kinasephos.mbc.nctu.edu.tw/predict.php)预测?HDA903?蛋白可能发生憐酸化的位??点,结果显示,HDA903蛋白有64个磷酸化位点,其中丝氨酸27个,酪氨酸23个,??苏氨酸14个。预测HDA903蛋白受磷酸化调节。??TMHMM?posterior?probabilities?for?PtHDA903??1.2????■?■?.???1?????0.8?■??>>??0.6?■??o??Ci??0.4?■?.??0.2?■??0??1???1?1??
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【参考文献】:
期刊论文
[1]表观遗传学研究进展[J]. 丁勇,许超,吴季辉,施蕴渝,臧建业,蔡刚. 中国科学:生命科学. 2017(01)
[2]植物组蛋白乙酰基转移酶的研究进展[J]. 夏德安,刘春娟,吕世博,张彦妮,刘奕佳,马旭俊. 生物技术通报. 2015(07)
[3]植物表观遗传学研究进展[J]. 韦荣昌,唐其,马小军,赵欢,覃喜军,涂冬萍. 北方园艺. 2013(18)
[4]组蛋白去乙酰化酶抑制剂研究进展[J]. 谭玉梅,黄文渊,余聂芳. 药学学报. 2009(10)
本文编号:3277272
【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:52 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1?基因片段的PCR扩增??注:M:?DL?2000?Marker;?1:?//DJ905编码区片段扩增结果??
残基数目(Asp+Glu)为77,正电氨基酸残基数目??(Arg+Lys)为53,不稳定指数是35.29,此值不超过40,即为稳定蛋白质。综上结果??表明,HDA903蛋白为稳定亲水性蛋白。??ProtScals?output?for?user?sequence??3?'?I???Uphob.?/?Kyte?G.?Doolittle?—— ̄??K卿鴨議.??-4????????????0?100?200?300?400?500??Position??图3?HDA903蛋白的亲/疏水性分析??2_3.3_2?HDA903蛋白的跨膜区及磷酸化位点分析??利用?TMHMM?Server?v.?2.0?(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)在线软件,??对HDA903蛋白进行跨膜分析。结果表明,HDA903蛋白的跨膜螺旋个数为0,因此推??测HDA903蛋白不存在跨膜区(图4)。利用KinasePhos?2.0??(http://kinasephos.mbc.nctu.edu.tw/predict.php)预测?HDA903?蛋白可能发生憐酸化的位??点,结果显示,HDA903蛋白有64个磷酸化位点,其中丝氨酸27个,酪氨酸23个,??苏氨酸14个。预测HDA903蛋白受磷酸化调节。??TMHMM?posterior?probabilities?for?PtHDA903??1.2????■?■?.???1?????0.8?■??>>??0.6?■??o??Ci??0.4?■?.??0.2?■??0??1???1?1??
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【参考文献】:
期刊论文
[1]表观遗传学研究进展[J]. 丁勇,许超,吴季辉,施蕴渝,臧建业,蔡刚. 中国科学:生命科学. 2017(01)
[2]植物组蛋白乙酰基转移酶的研究进展[J]. 夏德安,刘春娟,吕世博,张彦妮,刘奕佳,马旭俊. 生物技术通报. 2015(07)
[3]植物表观遗传学研究进展[J]. 韦荣昌,唐其,马小军,赵欢,覃喜军,涂冬萍. 北方园艺. 2013(18)
[4]组蛋白去乙酰化酶抑制剂研究进展[J]. 谭玉梅,黄文渊,余聂芳. 药学学报. 2009(10)
本文编号:3277272
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