大白菜雄性不育相关基因的克隆和表达分析
发布时间：2021-07-12 15:52
雄性不育突变体是研究植物雄配子发育调控机制的宝贵试材。在前期研究中,本实验室对大白菜雄性不育甲型两用系‘AB01’的不育株和可育株花蕾分别进行转录组测序,鉴别出系列差异表达基因,其中Bra036581和Bra040503在可育株花蕾正常表达,而在不育株花蕾中无表达信号,暗示以上2个基因在大白菜雄蕊发育中可能行使一定的功能。本文进一步克隆了Bra036581和Bra040503的全长序列,明确其表达模式,为后期功能鉴定奠定基础。主要研究结果如下:1.克隆了Bra036581和Bra040503的全长DNA和cDNA序列。序列研究发现,Bra036581和Bra040503功能未知。Bra036581无内含子,CDS全长237bp,所翻译蛋白含有78个氨基酸,预测为分泌蛋白,蛋白质相对质量8.27KD,等电点为7.45,信号肽酶切位点位于第24个氨基酸处;Bra040503同样不包含内含子,CDS全长384bp,编码蛋白含有128个氨基酸,预测为分泌蛋白,蛋白质相对质量14.31KD,等电点为9.70,信号肽酶切位点位于第23个氨基酸处。2.选取‘AB01’不育株和可育株的不同组织和花器官...
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Bra036581和Bra040503基因的结构分析
图 2-3 两个目的基因 DNA 和 cDNA 的扩增条带2-3 The amplified bands of two target genes DNA and cDNADL237Marker；1-2：Bra036581 的 DNA 和 cDNA 的扩增DL387Marker；3-4：Bra040503 的 DNA 和 cDNA 的扩增DL387Marker；1-2：The amplified bands of DNA and cDNDL387Marker；3-4：The amplified bands of DNA and cD析质的分析 ProtParam 软件分析蛋白质的理化性质得到，Br为 C341H566N96O111S15，相对分子质量为 8.27KD6 个氨基酸 Asp 和 Glu 带有正电荷，7 个氨基酸 A出酸性氨基酸个数少于碱性氨基酸的个数，所以稳定系数为 80.31，脂肪系数为 58.85，亲水性平不稳定的亲水蛋白。通过 ProtScal（ehttps://web.e36581 蛋白的疏水性质，由图分析可知，组成 Bra的 56.4％，疏水氨基酸为 43.6％，疏水氨基酸区
图 2-4 Bra036581 蛋白的亲水性预测Fig. 2-4 Hydrophilic prediction of the Bra036581 protein.503 共有 128 个氨基酸组成，分子式为 C641H1074N174O189S2，相对分子论等电点（pI）为 9.70。该蛋白有 17 个氨基酸 Asp 和 Glu 带有正电rg 和 Lys 带有负电荷，由此数据可以看出酸性氨基酸个数比碱性氨基所以推断 Bra040503 蛋白呈碱性。该蛋白不稳定系数为 18.74，脂肪性平均值为-0.536，由此可以推断该蛋白为稳定的亲水蛋白。通过 Prb.expasy.org/protscale/）在线工具分析 Bra040503 蛋白的疏水性质，由ra040503 蛋白质中亲水氨基酸占总氨基酸的 65.1％，疏水氨基酸为 34区域较小于亲水氨基酸，从而进一步说明了该蛋白为亲水蛋白，与 Pro结果一致，如图 2-5：
【参考文献】：
期刊论文
[1]花生AhDGAT1基因启动子的克隆与功能验证[J]. 张会,郑玲,万书波,李新国,郭峰,单雷,高文伟,彭振英. 山东农业科学. 2017(07)
[2]植物细胞核雄性不育基因研究进展[J]. 杨莉芳,刁现民. 植物遗传资源学报. 2013(06)
[3]真核生物RNA聚合酶Ⅱ核心启动子[J]. 于福先,朱志伟,陈晓宇,潘建治. 生命的化学. 2011(06)
[4]马铃薯块茎组织特异性启动子的克隆及序列分析[J]. 陈国梁,陈宗礼,贺晓龙,罗茜. 生物技术通报. 2011(07)
[5]大白菜果胶甲酯酶基因BrPME1的克隆及特征分析[J]. 刘志勇,李承彧,叶雪凌,王晓霞,冯辉. 中国农业科学. 2011(02)
[6]大白菜雄性不育类型及应用现状[J]. 吕艳玲,吴海东,王鑫,王宁. 长江蔬菜. 2009(24)
[7]青梗菜核基因雄性不育系的转育[J]. 辛彬,冯辉,杨晓飞,王玉刚. 中国蔬菜. 2009(14)
[8]大白菜细胞核显性雄性不育基因连锁标记的筛选[J]. 张淑江,李菲,韩和平,章时蕃,钮心恪,孙日飞. 中国农业科学. 2008(08)
[9]白菜雄性不育相关新基因BcMF1的分离及特征分析[J]. 王华新,王永勤,曹家树,向珣,余小林,叶纨芝. 中国农业科学. 2008(04)
[10]大白菜新型细胞质雄性不育生理生化机制的研究[J]. 张凤兰,冯忠梅,张德双,于贤昌. 华北农学报. 2007(05)
博士论文
[1]逆境胁迫下小麦脱水蛋白wzy1-2、wzy2基因及启动子的功能研究[D]. 朱维宁.西北农林科技大学 2014
[2]硫化叶菌启动子Initiator元件功能研究[D]. 敖翔.华中农业大学 2013
[3]白菜雄性不育相关基因CYP86MF的功能验证及其人工不育系的创建[D]. 余小林.浙江大学 2002
硕士论文
[1]芥菜开花整合子SOC1的启动子克隆及其与FLC、SVP蛋白相互作用[D]. 赵夏云.西南大学 2015
[2]BACE1基因启动子核心区域的研究[D]. 相燕.重庆医科大学 2014
[3]甘蓝型油菜细胞核雄性不育的基因表达研究[D]. 贺华良.华中农业大学 2003
本文编号：3280207
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Bra036581和Bra040503基因的结构分析
图 2-3 两个目的基因 DNA 和 cDNA 的扩增条带2-3 The amplified bands of two target genes DNA and cDNADL237Marker；1-2：Bra036581 的 DNA 和 cDNA 的扩增DL387Marker；3-4：Bra040503 的 DNA 和 cDNA 的扩增DL387Marker；1-2：The amplified bands of DNA and cDNDL387Marker；3-4：The amplified bands of DNA and cD析质的分析 ProtParam 软件分析蛋白质的理化性质得到，Br为 C341H566N96O111S15，相对分子质量为 8.27KD6 个氨基酸 Asp 和 Glu 带有正电荷，7 个氨基酸 A出酸性氨基酸个数少于碱性氨基酸的个数，所以稳定系数为 80.31，脂肪系数为 58.85，亲水性平不稳定的亲水蛋白。通过 ProtScal（ehttps://web.e36581 蛋白的疏水性质，由图分析可知，组成 Bra的 56.4％，疏水氨基酸为 43.6％，疏水氨基酸区
图 2-4 Bra036581 蛋白的亲水性预测Fig. 2-4 Hydrophilic prediction of the Bra036581 protein.503 共有 128 个氨基酸组成，分子式为 C641H1074N174O189S2，相对分子论等电点（pI）为 9.70。该蛋白有 17 个氨基酸 Asp 和 Glu 带有正电rg 和 Lys 带有负电荷，由此数据可以看出酸性氨基酸个数比碱性氨基所以推断 Bra040503 蛋白呈碱性。该蛋白不稳定系数为 18.74，脂肪性平均值为-0.536，由此可以推断该蛋白为稳定的亲水蛋白。通过 Prb.expasy.org/protscale/）在线工具分析 Bra040503 蛋白的疏水性质，由ra040503 蛋白质中亲水氨基酸占总氨基酸的 65.1％，疏水氨基酸为 34区域较小于亲水氨基酸，从而进一步说明了该蛋白为亲水蛋白，与 Pro结果一致，如图 2-5：
【参考文献】：
期刊论文
[1]花生AhDGAT1基因启动子的克隆与功能验证[J]. 张会,郑玲,万书波,李新国,郭峰,单雷,高文伟,彭振英. 山东农业科学. 2017(07)
[2]植物细胞核雄性不育基因研究进展[J]. 杨莉芳,刁现民. 植物遗传资源学报. 2013(06)
[3]真核生物RNA聚合酶Ⅱ核心启动子[J]. 于福先,朱志伟,陈晓宇,潘建治. 生命的化学. 2011(06)
[4]马铃薯块茎组织特异性启动子的克隆及序列分析[J]. 陈国梁,陈宗礼,贺晓龙,罗茜. 生物技术通报. 2011(07)
[5]大白菜果胶甲酯酶基因BrPME1的克隆及特征分析[J]. 刘志勇,李承彧,叶雪凌,王晓霞,冯辉. 中国农业科学. 2011(02)
[6]大白菜雄性不育类型及应用现状[J]. 吕艳玲,吴海东,王鑫,王宁. 长江蔬菜. 2009(24)
[7]青梗菜核基因雄性不育系的转育[J]. 辛彬,冯辉,杨晓飞,王玉刚. 中国蔬菜. 2009(14)
[8]大白菜细胞核显性雄性不育基因连锁标记的筛选[J]. 张淑江,李菲,韩和平,章时蕃,钮心恪,孙日飞. 中国农业科学. 2008(08)
[9]白菜雄性不育相关新基因BcMF1的分离及特征分析[J]. 王华新,王永勤,曹家树,向珣,余小林,叶纨芝. 中国农业科学. 2008(04)
[10]大白菜新型细胞质雄性不育生理生化机制的研究[J]. 张凤兰,冯忠梅,张德双,于贤昌. 华北农学报. 2007(05)
博士论文
[1]逆境胁迫下小麦脱水蛋白wzy1-2、wzy2基因及启动子的功能研究[D]. 朱维宁.西北农林科技大学 2014
[2]硫化叶菌启动子Initiator元件功能研究[D]. 敖翔.华中农业大学 2013
[3]白菜雄性不育相关基因CYP86MF的功能验证及其人工不育系的创建[D]. 余小林.浙江大学 2002
硕士论文
[1]芥菜开花整合子SOC1的启动子克隆及其与FLC、SVP蛋白相互作用[D]. 赵夏云.西南大学 2015
[2]BACE1基因启动子核心区域的研究[D]. 相燕.重庆医科大学 2014
[3]甘蓝型油菜细胞核雄性不育的基因表达研究[D]. 贺华良.华中农业大学 2003
本文编号：3280207
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3280207.html
最近更新
教材专著
