彩色马蹄莲不同品种和组织qRT-PCR内参基因筛选

发布时间：2021-07-14 10:32

　　为筛选出彩色马蹄莲不同品种和组织最佳内参基因,以彩色马蹄莲不同品种和不同组织为研究材料,运用实时荧光定量PCR技术（qRT-PCR）结合3个内参基因稳定性分析软件（geNorm, NormFinder和BestKeeper）,对彩色马蹄莲6个候选内参基因（18S rRNA, ACT, EF1α, GAPDH, LEU和TUB）的表达稳定性进行了分析。通过geNorm软件计算出彩色马蹄莲不同品种和组织的最适内参基因数目均为3个;综合3个软件的分析结果,筛选出彩色马蹄莲不同品种中稳定性最好的3个基因为18S rRNA、LEU和GAPDH;不同组织中稳定性最佳的3个基因为ACT、EF1α和18S rRNA。本研究为彩色马蹄莲品种间叶片表型差异、种球发育、赤霉素敏感差异等机理研究提供参考依据。 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(12)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

6个内参基因PCR产物对应蛋白的系统进化树

经ge Norm软件计算得到的表达稳定值(M值)越小(M值始终≤1.5)，则该内参基因稳定性越高。通过geNorm软件对候选内参基因在7个彩色马蹄莲品种‘慕拉’、‘桑达’、‘行为’、‘首领’、‘刀锋’、‘菲戈’、‘玛雷诺’的叶片和‘首领’品种的根、佛焰苞、茎段、球茎、肉穗、叶6个不同组织表达稳定性进行分析(表1)。在不同彩色马蹄莲品种中，6个候选内参基因的表达稳定性存在显著差异，其M值从小到大依次为EF1α=LEU<18S rRNA<ACT<GAPDH<TUB，即EF1α和LEU基因表达最为稳定，其次是18S rRNA，表达最不稳定的基因是TUB。在彩色马蹄莲‘首领’的不同组织中，6个内参基因M值从小到大排序依次为：EF1α=ACT<18S rRNA<TUB<LEU<GAPDH，因此，在不同组织中表达最为稳定的是EF1α和ACT，其次是18S rRNA和TUB，而GAPDH和LEU的M值分别为2.841和1.897，即均大于1.5，不适合作为彩色马蹄莲不同组织的内参基因。图3 6个内参基因在不同品种中的Ct平均值

6个内参基因在不同品种中的Ct平均值

【参考文献】：
期刊论文
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[6]胡椒实时荧光定量PCR内参基因的筛选[J]. 胡丽松,范睿,伍宝朵,吴刚,谭乐和,郝朝运.  热带作物学报. 2017(10)
[7]芍药实时定量PCR内参基因的筛选和验证[J]. 李健.  分子植物育种. 2017(07)
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[10]彩色马蹄莲2n配子育种技术初探[J]. 李洁筠,吴红芝,陈溪,周涤.  中国农学通报. 2011(08)

博士论文
[1]马蹄莲属（Zantedeschia）品种指纹图谱及生殖生物学研究[D]. 杨柳燕.南京林业大学 2013

硕士论文
[1]彩色马蹄莲佛焰苞呈色物质及其分布特征研究[D]. 雷霆.昆明理工大学 2017



本文编号：3283967