榅桲C4H基因的克隆、序列分析及表达

发布时间：2021-07-23 09:45

　　【目的】肉桂酸-4-羟化酶（cinnamate 4-hydroxylase,C4H）是调节木质素合成的关键基因,榅桲是新疆特色经济果树之一。目前,有关榅桲C4H基因的序列信息尚不明确。为了获得该基因的序列信息及其在果实不同发育时期的差异性表达规律,为深入研究该基因在榅桲果实发育过程中的作用和功能奠定基础。【方法】以榅桲果实为研究材料,基于GenBank已登录近源物种的C4H基因的cDNA序列,提取其果实的总RNA并反转录为cDNA,利用同源克隆的方法获得榅桲C4H基因的cDNA序列,并对该序列进行生物信息学分析,同时检测在榅桲果实开花后不同时间点C4H基因表达量的差异。【结果】同源克隆结果表明:C4H基因编码区的序列全长为1 518 bp,编码505个氨基酸,其蛋白的分子质量为58.28 kD。生物信息学分析结果显示:榅桲C4H蛋白为亲水性不稳定蛋白质,其二级结构以α-螺旋和无规卷曲结构为主。系统进化分析结果显示:榅桲C4H蛋白与甜樱桃（Prunus avium,XP₀21806844.1）、山杏（Prunus armeniaca,VVA16404.1）的C4H蛋... 

【文章来源】：经济林研究. 2020,38(02)北大核心

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

榅桲C4H基因同源性对比分析结果

榅桲C4H蛋白的进化树

榅桲C4H蛋白疏水/亲水性分析结果如图3所示。图3表明，在榅桲C4H蛋白氨基酸中，第17与第19位氨基酸残基的疏水性均最强（分别为3.600和3.578），第127与第196位氨基酸残基的亲水性均最强（分别为-3.067和-2.722）；另外，在该蛋白中亲水氨基酸的数量远高于疏水氨基酸的数量，由此推断，榅桲C4H蛋白为亲水性蛋白。2.3.3 榅桲C4H基因编码蛋白二级结构和三级结构的预测

【参考文献】：
期刊论文
[1]国内榅桲种质资源研究现状[J]. 罗华,郝兆祥,张忠涛,毕润霞,陈颖.  山西果树. 2018(06)
[2]苦荞C4H基因的cDNA克隆及生物信息学分析[J]. 刘荣华,王丽,孙朝霞,侯思宇,李红英.  山西农业大学学报(自然科学版). 2017(11)
[3]梨属植物果肉和石细胞团木质素相关性分析[J]. 田路明,董星光,曹玉芬,张莹,齐丹.  西南农业学报. 2017(09)
[4]芒果C4H基因的克隆及其表达分析[J]. 刘宽亮,赵志常,高爱平,陈业渊,黄建峰,党志国,罗睿雄.  江苏农业科学. 2017(14)
[5]基于SPME-GC-MS法分析4种榅桲果实香气成分[J]. 车玉红,吴津蓉,郭春苗,杨波.  中国农学通报. 2017(19)
[6]维药榅桲叶总黄酮对血糖、肝功能和脂代谢紊乱的影响[J]. 帕克提娜依·帕塔尔,阿迪力·阿不都热合曼,努尔买买提·吐尔孙,齐曼古丽·萨拉木,秦浩,余顺杰,邬利娅·伊明,艾尼瓦尔·吾买尔.  新疆医科大学学报. 2016(07)
[7]桂花C4H基因的克隆与表达特性分析[J]. 曾祥玲,郑日如,罗靖,王彩云.  园艺学报. 2016(03)
[8]新疆莎车大果榅桲果实营养分析及评价[J]. 车玉红,杨波,艾沙江·买买提,郭春苗,张军,马文鹏,蒋平.  食品工业科技. 2015(24)
[9]榅桲总黄酮降压作用及抗炎机制的实验研究[J]. 周文婷,邬利娅·伊明,马虎,古再努尔·买买提,艾尼瓦尔·吾买尔.  中药材. 2015(10)
[10]维药榅桲多糖抗血栓作用及其机制研究[J]. 美合日阿依·伊萨克,马虎,周文婷,艾尼瓦尔·吾买尔.  中国药理学通报. 2015(02)



本文编号：3298949