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黄连木抗逆基因PcHsf及PcHsp70-90的功能探究

发布时间:2021-07-27 07:57
  中国黄连木(Pistacia chinensis Bunge.)是我国特有的重要生物能源树种,其结果寿命长,但结实率低且果实单产量低,雌雄异株被认为是其低产的主因。项目组在调查中发现雌雄同株黄连木资源,雌雄同株黄连木可进行自花授粉,打破了雌雄异株低产的瓶颈。为了探明黄连木性别决定机制并将雌雄同株资源投入实际生产中,项目组选取各性别表型分化关键期进行转录组、small RNA和蛋白的关联分析,筛选到部分影响性别决定的基因和蛋白,其中与抗逆相关的HSF和HSP家族与中国黄连木花发育关系密切。本研究为了进一步探究黄连木PcHsf和PcHsp70-90基因的功能,以期揭示黄连木花发育过程中对逆境的响应机制。主要结果有:1. 成功克隆了PcHsf和PcHsp70-90基因,并对基因全长序列进行了生物信息学分析,对PcHsf和PcHsp70-90蛋白进行氨基酸多重序列比对和系统进化树分析得出,PcHsf蛋白与柑橘(Gossypium arboreum)亲缘关系最近,PcHsp70-90蛋白与中华柑桔(Citrus sinensis)亲缘性性较高。2. 构建了35S::PcHsf、35S::PcHs... 

【文章来源】:北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:68 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

黄连木抗逆基因PcHsf及PcHsp70-90的功能探究


PcHsf和PcHsp70-90的PCR扩增Figure3.1PCRamplificationofPcHsfandPcHsp70-90

基因,密码子,氨基酸


结果和分析21A:markerDL2000及PcHsf;B:markerDL10000及PcHsp70-90A:markerDL2000andPcHsf;B:markerDL10000andPcHsp70-903.2PcHsf和PcHsp70-90基因的生物信息学分析3.2.1基因全长cDNA序列分析利用NACI在线程序ORFFinder进行开放阅读框分析,PcHsf的核苷酸序列全长为859bp,其最大ORF长度为819bp,预测编码273个氨基酸的蛋白质。图3.2中红色圆圈代表起始密码子,氨基酸序列起始位置为41,终止位置为859。利用在线软件Protparam推测分子质量为30.37kD,包含氨基酸种类20种,稍微丰富的有赖氨酸Lys(K:9.9%)、丝氨酸Ser(S:9.5%)、天冬氨酸Asp(D:8.8%),理论等电点(pI)为7.55,带正电氨基酸残基总数(Arg+Lys)为41总平均亲疏水系数为-0.708。红色圆圈代表起始密码子;绿色圆圈代表终止密码子。图3.2PcHsf基因cDNA全长ORF分析Figure3.2ORFanalysisoffull-lengthcDNAofPcHsfgene同上述方法对PcHsp70-90进行序列分析,该基因的核苷酸序列全长为1734bp,其最大ORF长度为1605bp,预测编码534个氨基酸的蛋白质。图3.3中红色圆圈代表起始密码子,氨基酸序列起始位置为1,绿色圆圈代表终止密码子,终止位置为1605。利用Protparam在线软件推测分子质量为60.49kD,包含氨基酸种类20种,稍微丰

基因,疏水性,蛋白,密码子


黄连木花发育相关基因PcHsf及PcHsp70-90的功能探究22富的有Ala(A:12.4%),Glu(E:11.4%),Lys(K:11.4%),理论等电点(pI)为6.54,带正电氨基酸残基总数(Arg+Lys)为90总平均亲疏水系数为-0.888。红色圆圈代表起始密码子;绿色圆圈代表终止密码子。图3.3PcHsp70-90基因cDNA全长ORF分析Figure3.3Full-lengthORFanalysisofPcHsp70-90genecDNA3.2.2蛋白的亲/疏水性预测分析根据PcHsf和PcHsp70-90蛋白进行亲/疏水性分析(图3.4):PcHsf蛋白多肽链第184位具有最高分值1.933,疏水性最强,第238位具有最低分值-3.233,亲水性最


本文编号:3305403

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