杜仲橡胶生物合成相关microRNA及其靶基因的鉴定与功能分析
发布时间:2021-08-02 14:58
天然橡胶是一种类异戊二烯聚合物。据2019年统计,全球对天然橡胶的年需求量已达到3000万吨,且仍在稳步增长。巴西橡胶树(Hevea brasiliensis Mull.Arg.)作为天然橡胶的主要来源,由于其易受病虫害危害且分布范围窄的缺点,导致橡胶产业面临着严峻挑战。杜仲橡胶是一种具有橡胶和塑料双重特性的反式聚异戊二烯,其开发的新型材料具有高绝缘性和耐酸碱腐蚀等优点。并且杜仲(Eucommia ulmoides Oliver)的适应性强,分布范围广、种植面积大,生产的反式胶质量好,是国际上公认的可以替代巴西橡胶树的胶源树种,是我国橡胶工业持续发展的重要保障。弄清楚杜仲橡胶合成的分子调控机理有利于使用分子育种技术提高杜仲中杜仲橡胶的含量。然而,杜仲橡胶生物合成机制非常复杂,相关的研究还非常有限。本研究利用高通量测序技术对高产胶杜仲品种“秦仲2号”和低产胶杜仲品种“小叶”的叶片进行转录组测序、sRNA测序及降解组测序和分析,从全基因组范围内分析miRNA与mRNA之间的调控网络。利用RLM-5’RACE技术和农杆菌介导的烟草瞬时共转化技术分别证实了n-eu-miR15与其靶基因GGPS...
【文章来源】:西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:143 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
植物miRNA的生物合成(Barteletal.2004)
图 2-1 11 个候选内参基因的 PCR 扩增产物注:泳道 1 ~ 12:50 bp Maker、TUA、18S rRNA、ACT97、ACT、HIS4、HIS2B、TUB、UBC、UBA52、UB和 UBC E2。Fig. 2-1 PCR amplification products of eleven candidate reference genes.Note: Lane 1 ~ 12:50 bp Maker, TUA, 18S rRNA, ACT97, ACT, HIS4, HIS2B, TUB, UBC, UBA52, UBA80, and UE2.
图 2-1 11 个候选内参基因的 PCR 扩增产物注:泳道 1 ~ 12:50 bp Maker、TUA、18S rRNA、ACT97、ACT、HIS4、HIS2B、TUB、UBC、UBA52、UBA和 UBC E2。Fig. 2-1 PCR amplification products of eleven candidate reference genes.Note: Lane 1 ~ 12:50 bp Maker, TUA, 18S rRNA, ACT97, ACT, HIS4, HIS2B, TUB, UBC, UBA52, UBA80, and UBE2.
【参考文献】:
期刊论文
[1]2019全球橡胶需求增至3000万吨[J]. 钱伯章. 现代橡胶技术. 2019(04)
[2]利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行内参基因稳定性分析的方法[J]. 吴建阳,何冰,杜玉洁,李伟才,魏永赞. 现代农业科技. 2017(05)
[3]杜仲胶累积与异戊二烯代谢途径相关基因表达关系研究[J]. 莫俊,赵德刚. 山地农业生物学报. 2014(03)
[4]雷公藤1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原酶基因(TwDXR)的克隆与表达分析[J]. 祝传书,陈欣,郭嘉,缪国鹏,冯俊涛,张兴. 农业生物技术学报. 2014(03)
[5]基于杜仲转录组序列的SSR分子标记的开发[J]. 黄海燕,杜红岩,乌云塔娜,刘攀峰. 林业科学. 2013(05)
[6]杜仲胶在杜仲叶发育过程中的含量变化研究[J]. 赵红艳,蔺芳,王太霞. 湖北农业科学. 2012(18)
[7]Conservation and Diversity of MicroRNA-associated Copper-regulatory Networks in Populus trichocarpa[J]. Vincent L.Chiang. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(11)
[8]油茶乙酰CoA酰基转移酶基因cDNA克隆及序列特征分析[J]. 张琳,谭晓风,胡姣,姚小华,林萍. 中南林业科技大学学报. 2011(08)
[9]一个树种的国家战略[J]. 黎云昆. 中国林业产业. 2011(07)
[10]32种果树microRNA的生物信息学预测与分析[J]. 宋长年,贾启东,王晨,李飞,章镇,房经贵. 园艺学报. 2010(06)
博士论文
[1]早实核桃雌花芽分化关键microRNA及其靶基因的识别、鉴定与表达分析[D]. 周丽.石河子大学 2019
[2]黄瓜响应棒孢叶斑病菌侵染的转录组和microRNAs解析[D]. 王翔宇.沈阳农业大学 2018
[3]杜仲胶生物合成的关键基因作用模式及非编码RNA调控研究[D]. 刘慧敏.中国林业科学研究院 2018
[4]马铃薯光诱导糖苷生物碱代谢相关miRNAs的鉴定与功能分析[D]. 乔岩.甘肃农业大学 2017
[5]受松—杨栅锈菌侵染的杨树miRNA表达特征及其调控作用[D]. 陈敏.西北农林科技大学 2017
[6]杜仲基因组分析及适应性和橡胶生物合成的分子基础研究[D]. 王淋.中国林业科学研究院 2017
[7]参与柑橘果实发育的miRNA和靶基因的挖掘与分析[D]. 刘元龙.华中农业大学 2015
[8]白菜花粉发育相关microRNA的筛选鉴定与功能研究[D]. 江建霞.浙江大学 2014
[9]‘金冠’苹果miRNA克隆分析及Md-miRLn11靶向调控Md-NBS基因表达影响斑点落叶病抗性研究[D]. 马超.中国农业大学 2013
[10]葡萄microRNA及其靶基因的识别、鉴定及作用方式研究[D]. 王晨.南京农业大学 2012
硕士论文
[1]受落叶松-杨栅锈菌侵染的川杨novel miRNA靶基因克隆及功能研究[D]. 刘欣.西北农林科技大学 2019
[2]橡胶草GGPPS基因的克隆和功能分析[D]. 李永梅.石河子大学 2016
[3]杜仲基因组中橡胶合成相关基因的鉴定[D]. 刘慧敏.中南林业科技大学 2015
[4]华东葡萄‘白河-35-1’抗白粉病相关miRNA的鉴定[D]. 韩丽娟.西北农林科技大学 2015
[5]杜仲橡胶合成相关酶基因的克隆及功能研究[D]. 王淋.中南林业科技大学 2014
[6]杜仲法尼基焦磷酸合成酶基因超量表达对含胶细胞的影响研究[D]. 赵丹.贵州大学 2009
[7]杜仲叶内胶含量及分子质量动态变化研究[D]. 张付远.西北农林科技大学 2008
本文编号:3317771
【文章来源】:西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:143 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
植物miRNA的生物合成(Barteletal.2004)
图 2-1 11 个候选内参基因的 PCR 扩增产物注:泳道 1 ~ 12:50 bp Maker、TUA、18S rRNA、ACT97、ACT、HIS4、HIS2B、TUB、UBC、UBA52、UB和 UBC E2。Fig. 2-1 PCR amplification products of eleven candidate reference genes.Note: Lane 1 ~ 12:50 bp Maker, TUA, 18S rRNA, ACT97, ACT, HIS4, HIS2B, TUB, UBC, UBA52, UBA80, and UE2.
图 2-1 11 个候选内参基因的 PCR 扩增产物注:泳道 1 ~ 12:50 bp Maker、TUA、18S rRNA、ACT97、ACT、HIS4、HIS2B、TUB、UBC、UBA52、UBA和 UBC E2。Fig. 2-1 PCR amplification products of eleven candidate reference genes.Note: Lane 1 ~ 12:50 bp Maker, TUA, 18S rRNA, ACT97, ACT, HIS4, HIS2B, TUB, UBC, UBA52, UBA80, and UBE2.
【参考文献】:
期刊论文
[1]2019全球橡胶需求增至3000万吨[J]. 钱伯章. 现代橡胶技术. 2019(04)
[2]利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行内参基因稳定性分析的方法[J]. 吴建阳,何冰,杜玉洁,李伟才,魏永赞. 现代农业科技. 2017(05)
[3]杜仲胶累积与异戊二烯代谢途径相关基因表达关系研究[J]. 莫俊,赵德刚. 山地农业生物学报. 2014(03)
[4]雷公藤1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原酶基因(TwDXR)的克隆与表达分析[J]. 祝传书,陈欣,郭嘉,缪国鹏,冯俊涛,张兴. 农业生物技术学报. 2014(03)
[5]基于杜仲转录组序列的SSR分子标记的开发[J]. 黄海燕,杜红岩,乌云塔娜,刘攀峰. 林业科学. 2013(05)
[6]杜仲胶在杜仲叶发育过程中的含量变化研究[J]. 赵红艳,蔺芳,王太霞. 湖北农业科学. 2012(18)
[7]Conservation and Diversity of MicroRNA-associated Copper-regulatory Networks in Populus trichocarpa[J]. Vincent L.Chiang. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(11)
[8]油茶乙酰CoA酰基转移酶基因cDNA克隆及序列特征分析[J]. 张琳,谭晓风,胡姣,姚小华,林萍. 中南林业科技大学学报. 2011(08)
[9]一个树种的国家战略[J]. 黎云昆. 中国林业产业. 2011(07)
[10]32种果树microRNA的生物信息学预测与分析[J]. 宋长年,贾启东,王晨,李飞,章镇,房经贵. 园艺学报. 2010(06)
博士论文
[1]早实核桃雌花芽分化关键microRNA及其靶基因的识别、鉴定与表达分析[D]. 周丽.石河子大学 2019
[2]黄瓜响应棒孢叶斑病菌侵染的转录组和microRNAs解析[D]. 王翔宇.沈阳农业大学 2018
[3]杜仲胶生物合成的关键基因作用模式及非编码RNA调控研究[D]. 刘慧敏.中国林业科学研究院 2018
[4]马铃薯光诱导糖苷生物碱代谢相关miRNAs的鉴定与功能分析[D]. 乔岩.甘肃农业大学 2017
[5]受松—杨栅锈菌侵染的杨树miRNA表达特征及其调控作用[D]. 陈敏.西北农林科技大学 2017
[6]杜仲基因组分析及适应性和橡胶生物合成的分子基础研究[D]. 王淋.中国林业科学研究院 2017
[7]参与柑橘果实发育的miRNA和靶基因的挖掘与分析[D]. 刘元龙.华中农业大学 2015
[8]白菜花粉发育相关microRNA的筛选鉴定与功能研究[D]. 江建霞.浙江大学 2014
[9]‘金冠’苹果miRNA克隆分析及Md-miRLn11靶向调控Md-NBS基因表达影响斑点落叶病抗性研究[D]. 马超.中国农业大学 2013
[10]葡萄microRNA及其靶基因的识别、鉴定及作用方式研究[D]. 王晨.南京农业大学 2012
硕士论文
[1]受落叶松-杨栅锈菌侵染的川杨novel miRNA靶基因克隆及功能研究[D]. 刘欣.西北农林科技大学 2019
[2]橡胶草GGPPS基因的克隆和功能分析[D]. 李永梅.石河子大学 2016
[3]杜仲基因组中橡胶合成相关基因的鉴定[D]. 刘慧敏.中南林业科技大学 2015
[4]华东葡萄‘白河-35-1’抗白粉病相关miRNA的鉴定[D]. 韩丽娟.西北农林科技大学 2015
[5]杜仲橡胶合成相关酶基因的克隆及功能研究[D]. 王淋.中南林业科技大学 2014
[6]杜仲法尼基焦磷酸合成酶基因超量表达对含胶细胞的影响研究[D]. 赵丹.贵州大学 2009
[7]杜仲叶内胶含量及分子质量动态变化研究[D]. 张付远.西北农林科技大学 2008
本文编号:3317771
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3317771.html
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