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木薯MeHSF7基因克隆及表达分析

发布时间:2021-08-06 13:01
  【目的】克隆木薯热激转录因子(HSF)基因MeHSF7并分析其在抗逆响应和采后生理性变质(PPD)过程中的表达情况,为研究MeHSF7基因在响应干旱胁迫及延缓生理性变质的调控机制提供理论参考。【方法】通过同源克隆从木薯叶片克隆MeHSF7基因,对其生物信息学和组织表达特性进行分析,并明确其在干旱和脱落酸(ABA)处理下及PPD过程中的表达模式。【结果】克隆获得的MeHSF7基因开放阅读框(ORF)为1206 bp,编码401个氨基酸残基,与参考序列(Manes.02G087400.1)仅存在2个碱基差异,位于第2染色体上,含有1个内含子和2个外显子。MeHSF7蛋白理论分子量46.1 kD,理论等电点(pI)5.95,为不稳定蛋白,定位于细胞核,无跨膜区域,含有HSF蛋白的保守结构域DBD(DNA结合功能域)、HR-A Core和HR-B Core,属于HSFA亚家族,与橡胶树和麻疯树HSF蛋白的氨基酸序列同源性最高,分别为79.20%和64.95%,在系统发育进化树上与橡胶树HSF蛋白聚在同一小分支,表明二者亲缘关系较近。MeHSF7基因在不同组织中的表达量均较低,但不同组织间存在明... 

【文章来源】:南方农业学报. 2020,51(06)北大核心CSCD

【文章页数】:9 页

【部分图文】:

木薯MeHSF7基因克隆及表达分析


MeHSF7基因克隆(A)及染色体定位(B)结果

氨基酸序列,cDNA序列,氨基酸序列,预测分析


MeHSF7基因cDNA序列及其推导氨基酸序列分析

预测分析,蛋白,膜结构,cDNA序列


MeHSF7蛋白跨膜结构域预测分析结果

【参考文献】:
期刊论文
[1]木薯NOX基因家族成员的生物信息学及其表达分析[J]. 胡广,梁大成.  南方农业学报. 2019(10)
[2]木薯种子体细胞胚诱导发生及植株再生体系建立[J]. 韦祖生,杨秀娟,付海天,田益农.  南方农业学报. 2017(12)
[3]能源木薯高淀粉抗逆分子育种研究进展与展望[J]. 张鹏,杨俊,周文智,王红霞,马秋香.  生命科学. 2014(05)
[4]木薯块根采后腐烂及贮藏方法研究进展[J]. 张振文,李开绵.  热带作物学报. 2012(07)
[5]木薯储藏根采后生理性变质研究进展[J]. 马秋香,许佳,乔爱民,张鹏.  热带亚热带植物学报. 2009(03)



本文编号:3325822

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