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中国小家鼠Y染色体特异性基因(Zfy1,Zfy2)的遗传多样性分析

发布时间:2021-08-28 16:59
  小家鼠(Mus musculus)属啮齿目(Rodentia)、鼠科(Muridae)、小家鼠属(Mus),是人类伴生种,分布于世界各个地区。野生小家鼠及其实验室品系,在生物学和生物医学研究中有广泛应用。Y染色体严格遵循父系遗传,其演化机制一直是物种演化领域重要的研究课题之一。ZFY基因作为Y染色体上重要的雄性特异性基因,在精子形成及精子发育过程中起到了重要作用,其基因特征及种群遗传结构对于我们了解雄性特异基因的演化机制有重要价值。本论文中,我们对来自全国21个地区的野生小家鼠Zfy1/Zfy2基因进行序列扩增、测序及序列特征和种群遗传结构分析。实验中共得到来自21个地区的251条长度为561bp的Zfy1序列和来自21个地区的251条长度为583bp的Zfy2序列。针对序列进行的后续分析显示:1)Zfy1/Zfy2序列片段的碱基组成平均为A25.1%/28.2%、T 39.6%/36.1%、G 20.7%/20.6%、C 14.6%/15.1%,两个基因序列碱基含量有微小差异;Zfy1/Zfy2序列共检出变异位点(V)25/24个,将序列定义为29/28个单倍型(H);2)不同地理种... 

【文章来源】:鲁东大学山东省

【文章页数】:72 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

中国小家鼠Y染色体特异性基因(Zfy1,Zfy2)的遗传多样性分析


Y染色体结构(BachtrogD.2013)

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鲁东大学硕士学位论文152.1.2DNA提取实验前先提前将采集的样品从超低温冰箱中取出进行解冻,防止DNA的降解及取及用避免在室温下放置时间过长。DNA提取主要为粉碎,消化,提取,清洗等步骤。使用上海生工所售的Promega试剂盒。具体过程见表2.2。2.1.3PCR扩增使用的引物由上海生工生物公司设计并由其合成。合成引物呈粉末状,使用时根据说明进行稀释,并在总样品中吸取10μL置于洁净离心管中进行备用,其余引物防止降解置于冰箱保存。在正式PCR扩增前通过梯度PCR选定Zfy1/Zfy2引物最适退火温度及时间。表2.3为本次实验中是用的两组引物序列。图2.1小家鼠样品各采集地区分布Fig2.1ThecollectionrecordsofM.musculus

电泳图,小家鼠,电泳图,产物


中国小家鼠Y染色体特异性基因(Zfy1,Zfy2)的遗传多样性分析18图2.2部分小家鼠DNA提取产物电泳图Fig2.2TheresultsofgenomicDNAextraction图2.3部分小家鼠PCR扩增产物电泳图Fig2.3PCRamplificationproductselectrophoresisbasedonZFYgene注:M:DNAMarkerDL2000,K:空白对照样品选出寄送至上海生工进行纯化和测序,测序结果的峰图如图所示。图2.4ZFY基因扩增产物测序图片段Fig2.4ZFYgeneDNAsequencingresults2.2数据处理与分析2.2.1序列处理将测序结果通过Chromas软件查看峰图结果。注意检查序列中是否有双峰现

【参考文献】:
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本文编号:3368902

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