洋葱AcSKP1基因的克
发布时间：2021-08-29 17:47
洋葱（Allium cepa L.）是全球主要的商业化蔬菜作物,至少有139个国家种植。洋葱基因组巨大,分子生物学基础领域研究相对薄弱,特别是关于洋葱功能性基因的研究甚少。S期激酶蛋白SKP1（S-phase kinase-associated-protein 1）是普遍存在于真核生物中的一类小分子量蛋白质,其主要生物学功能在于参与了SCF复合体的形成,通过26S蛋白酶途径调控生物体内泛素介导的蛋白质降解,参与了包括植物花粉发育在内的多个生物过程。本研究主要以洋葱恢复系（DH17）和不育系（230）为材料,利用染色体步移、RACE试验、序列比对分析、农杆菌介导的遗传转化等分子生物学方法,初步阐明了洋葱AcSKP1基因在洋葱可育系和不育系中存在可变剪接现象,并且初步进行了AcSKP1基因启动子的功能验证。在此基础上开发了一个稳定高效的洋葱Ms位点的SSR分子标记（WH-SSR-1）,已成功的应用于育种实践。本研究结果如下:（1）克隆了洋葱AcSKP1基因的全长序列,恢复系材料（DH17）含有5659 bp,不育系材料（230）含有5636 bp,比对分析发现,恢复系和不育系材料之间存在大...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：77 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
利用WH-SSR-1标记直接从OP群体中筛选保持株和不育株Figure1ScreeningofmaintainerandsterileplantsdirectlyfromtheOPpopulationusingtheWH-SSR-1marker
洋葱 AcSKP1 基因的克隆、转录特性及其在育种中的应用 结果与分析.1 洋葱总 DNA 和 RNA 提取的结果由图 2 洋葱总 RNA 电泳条带可以得出，点样孔干净，表示无蛋白质或多糖的残留 DNA 条带，表明几乎没有 DNA 残留；28 S 和 18 S 条带清晰，并且可以看出 28 S度大约为 18 S 亮度的两倍，说明 RNA 样本完整性好。有图中洋葱总 DNA 电泳可出，洋葱总 DNA 片段约为 23 kb，条带较清晰，并未发现条带弥散或降解，表示可本试验的需要。
图 3 AcSKP1 序列基因预测的结果a：恢复系（DH17）AcSKP1 序列基因；b：不育系（230）AcSKP1 序列基因Figure 3 Results ofAcSKP1 sequence gene predictiona: Restore line (DH17)AcSKP1 sequence gene; b: Sterile line (230)AcSKP1 sequence gene表 18 引物名称及组合Table18 Primer name and combination组合 Exon3-1LP Exon4-1LP Exon6-1LP Exon7-1LP Exon8-1LP Exon9-1LP Exon10-PolyALPExon1-1UP 385 519 738 827 992 1056 ﹥1000Exon2-1UP 285 419 638 727 892 956 ﹥900Exon3-1UP NA 169 388 477 642 706 ～700Exon4-1UP NA NA 245 334 495 559 ～550Exon5-1UP NA NA 138 227 388 452 ～450Exon6-1UP NA NA NA 133 294 358 ～350Exon7-1UP NA NA NA NA 140 204 ～200Exon8-1UP NA NA NA NA NA 131 ～150
【参考文献】：
期刊论文
[1]洋葱CMS-T型育性分子标记的筛选与鉴定[J]. 潘美红,杨海峰,惠林冲,薛萍,张新圣,缪美华,陈振泰. 西北农业学报. 2018(04)
[2]草莓FaSKP1-1基因的克隆与表达分析[J]. 殷姗姗,李茂福,王华,李洋,张秋雷,金万梅,李天忠. 中国农业大学学报. 2016(12)
[3]棉花GhGT-2转录因子的克隆及其功能分析[J]. 李月,刘晓东,谢宗铭,董永梅,武冬梅,陈受宜. 中国农业科学. 2015(24)
[4]猪SKP1基因的克隆及其在梅山猪与杜洛克猪卵泡中的表达研究[J]. 徐梦思,黄涛,刘丽娟,杨飞,鲁慧文,翟腾蛟,陈亚楠. 中国畜牧兽医. 2015(07)
[5]调控细胞活动不可或缺的重要分子——F-box蛋白[J]. 郑鸿平,李逸平. 生命的化学. 2011(05)
[6]巴西橡胶树乳管细胞HbSKP1基因克隆及原核表达[J]. 马瑞丰,王立丰,彭世清,田维敏. 热带作物学报. 2010(08)
[7]SSR标记在玉米遗传育种中的应用[J]. 孙琦,孟昭东,张发军,丁照华,张庆伟. 玉米科学. 2006(01)
[8]RAPD分子标记技术及其在十字花科蔬菜研究中的应用[J]. 胡学军,邱正明,李金泉. 湖北农业科学. 2005(03)
[9]DNA分子标记及其在谷子遗传育种中的应用[J]. 王军,谢皓,郭二虎,李爱军,范慧萍. 北京农学院学报. 2005(01)
[10]RAPD分子标记技术在蔬菜研究中的应用[J]. 邓俭英,刘忠,康德贤,方锋学. 种子. 2005(03)
博士论文
[1]抗根结线虫基因的克隆、遗传转化及黑籽南瓜再生体系的建立[D]. 霍雨猛.山东农业大学 2008
硕士论文
[1]洋葱果胶甲酯酶基因AcPME的克隆、原核表达及亚细胞定位[D]. 孙亚玲.山东农业大学 2017
[2]云南农业大学滇型杂交水稻优势利用技术发展史研究[D]. 阎祺鹏.云南农业大学 2017
[3]低温处理对菜心花粉发育及相关基因表达的影响[D]. 刘丹丹.浙江大学 2016
[4]白菜花粉发育和授粉受精相关长链非编码RNA的鉴定方法[D]. 张芳.浙江大学 2015
[5]小粒野生稻OmSKP1的点突变蛋白表达纯化与体外互作的初步分析[D]. 范锡麟.湖南农业大学 2013
[6]洋葱A、B、C、E功能MADS-box基因的克隆与表达分析[D]. 黄赫.东北林业大学 2013
[7]拟南芥干旱诱导型启动子的克隆及功能分析[D]. 吴宪.吉林大学 2013
[8]我国杂交水稻育种技术的传播研究[D]. 李小玉.湖南大学 2011
[9]小麦雄性不育相关基因SKP1的克隆与表达分析[D]. 宋瑜龙.西北农林科技大学 2011
本文编号：3371102
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：77 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
利用WH-SSR-1标记直接从OP群体中筛选保持株和不育株Figure1ScreeningofmaintainerandsterileplantsdirectlyfromtheOPpopulationusingtheWH-SSR-1marker
洋葱 AcSKP1 基因的克隆、转录特性及其在育种中的应用 结果与分析.1 洋葱总 DNA 和 RNA 提取的结果由图 2 洋葱总 RNA 电泳条带可以得出，点样孔干净，表示无蛋白质或多糖的残留 DNA 条带，表明几乎没有 DNA 残留；28 S 和 18 S 条带清晰，并且可以看出 28 S度大约为 18 S 亮度的两倍，说明 RNA 样本完整性好。有图中洋葱总 DNA 电泳可出，洋葱总 DNA 片段约为 23 kb，条带较清晰，并未发现条带弥散或降解，表示可本试验的需要。
图 3 AcSKP1 序列基因预测的结果a：恢复系（DH17）AcSKP1 序列基因；b：不育系（230）AcSKP1 序列基因Figure 3 Results ofAcSKP1 sequence gene predictiona: Restore line (DH17)AcSKP1 sequence gene; b: Sterile line (230)AcSKP1 sequence gene表 18 引物名称及组合Table18 Primer name and combination组合 Exon3-1LP Exon4-1LP Exon6-1LP Exon7-1LP Exon8-1LP Exon9-1LP Exon10-PolyALPExon1-1UP 385 519 738 827 992 1056 ﹥1000Exon2-1UP 285 419 638 727 892 956 ﹥900Exon3-1UP NA 169 388 477 642 706 ～700Exon4-1UP NA NA 245 334 495 559 ～550Exon5-1UP NA NA 138 227 388 452 ～450Exon6-1UP NA NA NA 133 294 358 ～350Exon7-1UP NA NA NA NA 140 204 ～200Exon8-1UP NA NA NA NA NA 131 ～150
【参考文献】：
期刊论文
[1]洋葱CMS-T型育性分子标记的筛选与鉴定[J]. 潘美红,杨海峰,惠林冲,薛萍,张新圣,缪美华,陈振泰. 西北农业学报. 2018(04)
[2]草莓FaSKP1-1基因的克隆与表达分析[J]. 殷姗姗,李茂福,王华,李洋,张秋雷,金万梅,李天忠. 中国农业大学学报. 2016(12)
[3]棉花GhGT-2转录因子的克隆及其功能分析[J]. 李月,刘晓东,谢宗铭,董永梅,武冬梅,陈受宜. 中国农业科学. 2015(24)
[4]猪SKP1基因的克隆及其在梅山猪与杜洛克猪卵泡中的表达研究[J]. 徐梦思,黄涛,刘丽娟,杨飞,鲁慧文,翟腾蛟,陈亚楠. 中国畜牧兽医. 2015(07)
[5]调控细胞活动不可或缺的重要分子——F-box蛋白[J]. 郑鸿平,李逸平. 生命的化学. 2011(05)
[6]巴西橡胶树乳管细胞HbSKP1基因克隆及原核表达[J]. 马瑞丰,王立丰,彭世清,田维敏. 热带作物学报. 2010(08)
[7]SSR标记在玉米遗传育种中的应用[J]. 孙琦,孟昭东,张发军,丁照华,张庆伟. 玉米科学. 2006(01)
[8]RAPD分子标记技术及其在十字花科蔬菜研究中的应用[J]. 胡学军,邱正明,李金泉. 湖北农业科学. 2005(03)
[9]DNA分子标记及其在谷子遗传育种中的应用[J]. 王军,谢皓,郭二虎,李爱军,范慧萍. 北京农学院学报. 2005(01)
[10]RAPD分子标记技术在蔬菜研究中的应用[J]. 邓俭英,刘忠,康德贤,方锋学. 种子. 2005(03)
博士论文
[1]抗根结线虫基因的克隆、遗传转化及黑籽南瓜再生体系的建立[D]. 霍雨猛.山东农业大学 2008
硕士论文
[1]洋葱果胶甲酯酶基因AcPME的克隆、原核表达及亚细胞定位[D]. 孙亚玲.山东农业大学 2017
[2]云南农业大学滇型杂交水稻优势利用技术发展史研究[D]. 阎祺鹏.云南农业大学 2017
[3]低温处理对菜心花粉发育及相关基因表达的影响[D]. 刘丹丹.浙江大学 2016
[4]白菜花粉发育和授粉受精相关长链非编码RNA的鉴定方法[D]. 张芳.浙江大学 2015
[5]小粒野生稻OmSKP1的点突变蛋白表达纯化与体外互作的初步分析[D]. 范锡麟.湖南农业大学 2013
[6]洋葱A、B、C、E功能MADS-box基因的克隆与表达分析[D]. 黄赫.东北林业大学 2013
[7]拟南芥干旱诱导型启动子的克隆及功能分析[D]. 吴宪.吉林大学 2013
[8]我国杂交水稻育种技术的传播研究[D]. 李小玉.湖南大学 2011
[9]小麦雄性不育相关基因SKP1的克隆与表达分析[D]. 宋瑜龙.西北农林科技大学 2011
本文编号：3371102
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3371102.html
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