马尾松NAC基因的克隆及功能分析
发布时间：2021-09-04 06:25
目前对NAC基因的研究集中在胁迫上,实验材料多是模式植物,如拟南芥、水稻和大豆等,对木本植物的研究较为薄弱,尤其是马尾松等针叶树种。通过对马尾松苗木进行全长转录组测序,获取NAC基因的序列,分析干旱胁迫、低磷胁迫、生殖生长过程中NAC基因的表达,初探马尾松NAC基因在逆境响应过程和生殖生过程中发挥的作用,同时也为NAC基因功能的多样化研究奠定基础。主要结果如下:（1）通过对马尾松正常生长和干旱胁迫过程中的1年生幼苗进行全长转录组测序,共获得94条NAC基因,利用已公布的拟南芥NAC蛋白和马尾松NAC蛋白构建系统发育树发现,马尾松NAC蛋白存在于AtNAC3、NAP、NAM、OsNAC7、NAC2、ONAC003、ANAC011、PmATAF8个亚家族中,其中PmATAF亚家族是马尾松特有的。马尾松NAC蛋白保守基序分析,马尾松NAC蛋白共存在的10个基序中,其中5、6、1、2、3基序与NAC基因的A、B、C、D、E亚结构域对应。亚家族内大部分成员都具有相同的基序,仅有部分马尾松NAC蛋白保守基序丢失。（2）通过对马尾松苗木干旱胁迫下二代转录组测序分析发现,94条NAC基因中有11条在干...
【文章来源】：贵州大学贵州省 211工程院校
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
不同的NAC转录因子在植物系统中扮演的角色(Elizebeth&Pinky2018)
技术路线图
通过HMM进行NAC相关基因的鉴定，共获得94条NAC基因，大部分的NAC基因局部的序列相似度较高。本研究利用拟南芥已经公布的NAC蛋白和通过全长转录组测序得到的94条NAC蛋白构建系统发育进化树（图2-1），该系统进化树参考了水稻NAC的分类方法（Ooka H et al.,2003）。分析发现拟南芥和马尾松NAC蛋白不均匀的分为17个亚家族，这可能是马尾松和拟南芥经历了不同的基因组事件造成的。马尾松NAC蛋白存在于AtNAC3、NAP、 NAM、 OsNAC7、NAC2、ONAC003、ANAC011、PmATAF分别有5、8、4、2、15、4、46、10条，其中PmATAF属于马尾松NAC蛋白独立分出来的亚家族，并把该亚家族命名为PmATAF，马尾松独立出来的NAC亚家族基因，有可能是由于NAC基因在马尾松中发生了特异性分化，也验证了模式植物中的NAC基因并没有覆盖全部植物
【参考文献】：
期刊论文
[1]沙冬青AmNAC6基因的克隆与功能初步分析[J]. 唐宽刚,任美艳,张文君,庞新跃,薛敏,王茅雁. 植物科学学报. 2018(05)
[2]基于马尾松干旱转录组的抗旱功能SSR位点分析[J]. 杜明凤,丁贵杰. 林业科学研究. 2018(05)
[3]杉木NAC转录因子基因ClNAC1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析[J]. 魏明科,俞金健,黄晓龙,刘琼瑶,黄华宏,林二培,童再康. 林业科学. 2018(09)
[4]马尾松不同叶型幼苗对干旱及复水的生长及生理响应[J]. 王好运,吴峰,吴昌明,于淞,朱小坤,谢维斌. 东北林业大学学报. 2018(01)
[5]NAC转录因子在植物对生物和非生物胁迫响应中的功能[J]. 周鸿慧,黄红,徐彬磊,苏醒,邓蓉,洪永波,蒋明,宋凤鸣,张慧娟. 植物生理学报. 2017(08)
[6]不同家系马尾松对持续干旱的响应及抗旱性[J]. 杜明凤,丁贵杰,赵熙州. 林业科学. 2017(06)
[7]干旱胁迫下马尾松幼苗针叶挥发性物质与内源激素的变化[J]. 全文选,丁贵杰. 林业科学. 2017(04)
[8]马尾松谷胱甘肽过氧化物酶PmGPX6基因cDNA克隆及转化拟南芥耐旱性初步研究[J]. 蔡琼,丁贵杰,文晓鹏. 林业科学研究. 2016(06)
[9]油松小孢子叶球性反转异常繁殖行为研究[J]. 张喜顺,刘世界. 吉林农业. 2015(16)
[10]植物NAC转录因子功能研究新进展[J]. 陈娜,蒋晶,曹必好,雷建军,陈长明. 分子植物育种. 2015(06)
博士论文
[1]马尾松抗旱相关基因的克隆及表达分析[D]. 蔡琼.贵州大学 2017
[2]苹果属观赏海棠类黄酮种类、代谢及生物活性分析[D]. 秦晓晓.西南大学 2016
硕士论文
[1]“多球果”马尾松孢子叶球分化及发育研究[D]. 陈庭巧.贵州大学 2016
[2]番茄SlNAM1转录因子的分离与功能分析[D]. 李晓东.山东农业大学 2016
[3]杉木NAC基因的克隆、表达和SNP分析[D]. 刘琼瑶.浙江农林大学 2015
[4]马尾松CAD和CCoAOMT基因的克隆与表达分析[D]. 张逢凯.南京林业大学 2014
本文编号：3382744
【文章来源】：贵州大学贵州省 211工程院校
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
不同的NAC转录因子在植物系统中扮演的角色(Elizebeth&Pinky2018)
技术路线图
通过HMM进行NAC相关基因的鉴定，共获得94条NAC基因，大部分的NAC基因局部的序列相似度较高。本研究利用拟南芥已经公布的NAC蛋白和通过全长转录组测序得到的94条NAC蛋白构建系统发育进化树（图2-1），该系统进化树参考了水稻NAC的分类方法（Ooka H et al.,2003）。分析发现拟南芥和马尾松NAC蛋白不均匀的分为17个亚家族，这可能是马尾松和拟南芥经历了不同的基因组事件造成的。马尾松NAC蛋白存在于AtNAC3、NAP、 NAM、 OsNAC7、NAC2、ONAC003、ANAC011、PmATAF分别有5、8、4、2、15、4、46、10条，其中PmATAF属于马尾松NAC蛋白独立分出来的亚家族，并把该亚家族命名为PmATAF，马尾松独立出来的NAC亚家族基因，有可能是由于NAC基因在马尾松中发生了特异性分化，也验证了模式植物中的NAC基因并没有覆盖全部植物
【参考文献】：
期刊论文
[1]沙冬青AmNAC6基因的克隆与功能初步分析[J]. 唐宽刚,任美艳,张文君,庞新跃,薛敏,王茅雁. 植物科学学报. 2018(05)
[2]基于马尾松干旱转录组的抗旱功能SSR位点分析[J]. 杜明凤,丁贵杰. 林业科学研究. 2018(05)
[3]杉木NAC转录因子基因ClNAC1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析[J]. 魏明科,俞金健,黄晓龙,刘琼瑶,黄华宏,林二培,童再康. 林业科学. 2018(09)
[4]马尾松不同叶型幼苗对干旱及复水的生长及生理响应[J]. 王好运,吴峰,吴昌明,于淞,朱小坤,谢维斌. 东北林业大学学报. 2018(01)
[5]NAC转录因子在植物对生物和非生物胁迫响应中的功能[J]. 周鸿慧,黄红,徐彬磊,苏醒,邓蓉,洪永波,蒋明,宋凤鸣,张慧娟. 植物生理学报. 2017(08)
[6]不同家系马尾松对持续干旱的响应及抗旱性[J]. 杜明凤,丁贵杰,赵熙州. 林业科学. 2017(06)
[7]干旱胁迫下马尾松幼苗针叶挥发性物质与内源激素的变化[J]. 全文选,丁贵杰. 林业科学. 2017(04)
[8]马尾松谷胱甘肽过氧化物酶PmGPX6基因cDNA克隆及转化拟南芥耐旱性初步研究[J]. 蔡琼,丁贵杰,文晓鹏. 林业科学研究. 2016(06)
[9]油松小孢子叶球性反转异常繁殖行为研究[J]. 张喜顺,刘世界. 吉林农业. 2015(16)
[10]植物NAC转录因子功能研究新进展[J]. 陈娜,蒋晶,曹必好,雷建军,陈长明. 分子植物育种. 2015(06)
博士论文
[1]马尾松抗旱相关基因的克隆及表达分析[D]. 蔡琼.贵州大学 2017
[2]苹果属观赏海棠类黄酮种类、代谢及生物活性分析[D]. 秦晓晓.西南大学 2016
硕士论文
[1]“多球果”马尾松孢子叶球分化及发育研究[D]. 陈庭巧.贵州大学 2016
[2]番茄SlNAM1转录因子的分离与功能分析[D]. 李晓东.山东农业大学 2016
[3]杉木NAC基因的克隆、表达和SNP分析[D]. 刘琼瑶.浙江农林大学 2015
[4]马尾松CAD和CCoAOMT基因的克隆与表达分析[D]. 张逢凯.南京林业大学 2014
本文编号：3382744
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