骆驼刺中慢生根瘤菌CCNWXJ12-2 T 盐胁迫转录组分析及与耐盐相关基因功能研究
发布时间：2021-09-06 01:21
骆驼刺中慢生根瘤菌Mesorhizobium alhagi CCNWXJ12-2T是本实验室从新疆荒漠地区疏叶骆驼刺根瘤中分离得到的具有优良抗逆性的菌株,最高能够耐受0.8 M NaCl。为了更好的研究其耐盐机制,本文使用RNA-Seq技术,研究其在不同盐浓度条件下转录组表达差异,然后选取部分差异表达基因,利用同源重组技术构建基因敲除突变体,对突变体表型进行检测,以进一步研究基因功能。转录组测序结果显示,以2倍为筛选差异表达基因的阈值,在高盐条件下,差异表达基因总数为1849个,占总注释基因数（7195）的25.7%。其中933个基因表达下调,916个基因表达上调。表达上调基因主要集中在氨基酸合成及转运、碳水化合物转运及代谢、能量代谢、核糖体合成、蛋白质翻译等代谢过程,说明在高盐条件下,M.alhagi XJ12-2T的能量代谢水平和蛋白合成能力都有所提高。同时,大部分与抗氧化相关基因的表达有不同程度的升高,说明在高盐条件下,该菌的抗氧化能力有一定程度的提高。下调基因主要富集在膜转运相关代谢通路,该菌中几种常见的蛋白分泌系统,如第二套三型分泌...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：117 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图1-1分布于荒漠地区的骆驼刺Fig1-1Adhagispars扣diaindesertarea
4 骆驼刺中慢生根瘤菌 CCNWXJ12-2T盐胁迫转录组分析及与耐盐相关基因功能研究例如脯氨酸、四氢嘧啶、甘氨酸甜菜碱等(Gouffi et al. 2000)。微生物往往能够利用多种亲和性溶质或渗透保护物来应对高渗条件，以便在不同的营养条件下对高渗胁迫做出响应。下面对几种常见亲和性溶质和渗透保护物进行具体介绍。
图 1-3 以葡萄糖为底物合成海藻糖途径Fig 1-3 Trehalose synthesis pathway using glucose as substrate图 1-4 以淀粉为底物合成海藻糖途径Fig 1-4 Trehalose synthesis pathway using starch as substrate露醇 在高盐条件下，Acinetobacter baylyi 能够通过累积谷氨酸及甘外压力。对该菌的进一步研究发现了一个受高盐条件诱导的基，因甘（mltD）基因，该酶能够催化甘露醇的合成。甘露醇不仅对微生物耐，同时也能为微生物的新陈代谢贮存能量，并且能够抑制微生物e oxygen species, ROS）的活力(Meena et al. 2015)。实验发现，甘露醇瘤菌的亲和性溶质(Fernandez-Aunion et al. 2010)。氨酸 脯氨酸在渗透保护中的重要作用是在渗透调节领域的重大发现ia coli K12 中发现三个与脯氨酸转运有关的基因，putP、 proP 和 p
【参考文献】：
期刊论文
[1]土壤盐碱化的灾害学定义及其风险评价体系[J]. 谷洪彪,姜纪沂. 灾害学. 2013(01)
[2]中国荒漠化防治标准化发展现状与展望[J]. 崔向慧,卢琦. 干旱区研究. 2012(05)
[3]转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用[J]. 祁云霞,刘永斌,荣威恒. 遗传. 2011(11)
[4]骆驼刺幼苗生长特性对不同地下水埋深的响应[J]. 刘波,曾凡江,郭海峰,曾杰. 生态学杂志. 2009(02)
[5]遏制土壤盐碱化、荒漠化的必要性及技术进展[J]. 彭津琴,刘永强,杨玉芳,吴琛. 天津农业科学. 2008(04)
[6]甘肃中西部豆科植物根瘤菌多样性调查研究[J]. 陈卫民,张执欣,张宏昌,韦革宏. 干旱地区农业研究. 2006(01)
[7]原核生物的sigma因子[J]. 杨明,李权胜. 河南医学研究. 1999(01)
[8]夏季灌溉对骆驼刺形态学特征、群落生态结构和天然更新的影响[J]. 张立运,买买提,安尼瓦尔,夏阳. 干旱区研究. 1995(04)
本文编号：3386451
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：117 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图1-1分布于荒漠地区的骆驼刺Fig1-1Adhagispars扣diaindesertarea
4 骆驼刺中慢生根瘤菌 CCNWXJ12-2T盐胁迫转录组分析及与耐盐相关基因功能研究例如脯氨酸、四氢嘧啶、甘氨酸甜菜碱等(Gouffi et al. 2000)。微生物往往能够利用多种亲和性溶质或渗透保护物来应对高渗条件，以便在不同的营养条件下对高渗胁迫做出响应。下面对几种常见亲和性溶质和渗透保护物进行具体介绍。
图 1-3 以葡萄糖为底物合成海藻糖途径Fig 1-3 Trehalose synthesis pathway using glucose as substrate图 1-4 以淀粉为底物合成海藻糖途径Fig 1-4 Trehalose synthesis pathway using starch as substrate露醇 在高盐条件下，Acinetobacter baylyi 能够通过累积谷氨酸及甘外压力。对该菌的进一步研究发现了一个受高盐条件诱导的基，因甘（mltD）基因，该酶能够催化甘露醇的合成。甘露醇不仅对微生物耐，同时也能为微生物的新陈代谢贮存能量，并且能够抑制微生物e oxygen species, ROS）的活力(Meena et al. 2015)。实验发现，甘露醇瘤菌的亲和性溶质(Fernandez-Aunion et al. 2010)。氨酸 脯氨酸在渗透保护中的重要作用是在渗透调节领域的重大发现ia coli K12 中发现三个与脯氨酸转运有关的基因，putP、 proP 和 p
【参考文献】：
期刊论文
[1]土壤盐碱化的灾害学定义及其风险评价体系[J]. 谷洪彪,姜纪沂. 灾害学. 2013(01)
[2]中国荒漠化防治标准化发展现状与展望[J]. 崔向慧,卢琦. 干旱区研究. 2012(05)
[3]转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用[J]. 祁云霞,刘永斌,荣威恒. 遗传. 2011(11)
[4]骆驼刺幼苗生长特性对不同地下水埋深的响应[J]. 刘波,曾凡江,郭海峰,曾杰. 生态学杂志. 2009(02)
[5]遏制土壤盐碱化、荒漠化的必要性及技术进展[J]. 彭津琴,刘永强,杨玉芳,吴琛. 天津农业科学. 2008(04)
[6]甘肃中西部豆科植物根瘤菌多样性调查研究[J]. 陈卫民,张执欣,张宏昌,韦革宏. 干旱地区农业研究. 2006(01)
[7]原核生物的sigma因子[J]. 杨明,李权胜. 河南医学研究. 1999(01)
[8]夏季灌溉对骆驼刺形态学特征、群落生态结构和天然更新的影响[J]. 张立运,买买提,安尼瓦尔,夏阳. 干旱区研究. 1995(04)
本文编号：3386451
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