朝仓花椒CBL基因家族的鉴定及分析

发布时间：2021-09-28 09:30

　　通过NCBI BLAST分析,从朝仓花椒转录组中鉴定获得31条朝仓花椒类钙调磷酸酶B亚基蛋白（Calcineurin B-like protein,CBL）家族的编码基因序列,将其命名为ZpCBL 1-ZpCBL 31。对该基因家族进行分析发现,朝仓花椒的CBL基因家族在进化上可分为4组,每组成员数量分别为16、8、5、2。该家族蛋白等电点均小于7,偏酸性,且较多数为不稳定蛋白。多基因序列比对可知朝仓花椒CBL家族均具有至少1个高度保守的EF-hand结构域。对空间结构的分析发现,ZpCBL蛋白为多链折叠蛋白,以α螺旋为主。 

【文章来源】：种子. 2020,39(11)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

植物CBL蛋白进化树

ZpCBL序列Logo及保守基序

ZpCBL蛋白结构域序列比对

【参考文献】：
期刊论文
[1]朝仓花椒几丁质酶类似基因的克隆及分析[J]. 刘雪薇,赵懿琛,赵德刚.  基因组学与应用生物学. 2018(04)
[2]桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析[J]. 张杰伟,吴婷,任飞,谢华,魏建华.  西南农业学报. 2017(03)
[3]苹果MdCBL3基因的克隆与功能鉴定[J]. 刘亚静,马齐军,李浩浩,路静,郝玉金,由春香.  园艺学报. 2017(01)
[4]朝仓花椒幼芽转录组测序数据组装及基因功能注释[J]. 赵懿琛,刘雪微,李岩,赵德刚.  基因组学与应用生物学. 2016(07)
[5]番茄CBL家族基因的鉴定和遗传进化分析[J]. 刘淑梅,王施慧,刘明毓,纪复勤,李利斌,侯丽霞.  分子植物育种. 2015(10)
[6]苹果生长素响应因子（ARF）基因家族全基因组鉴定及表达分析[J]. 李慧峰,冉昆,何平,王海波,常源升,孙清荣,程来亮,李林光.  植物生理学报. 2015(07)
[7]梨CBL基因家族全基因组序列的鉴定及非生物胁迫下的表达分析[J]. 许园园,蔺经,李晓刚,常有宏.  中国农业科学. 2015(04)
[8]植物CBL-CIPK信号系统的功能及其作用机理[J]. 沈金秋,郑仲仲,潘伟槐,潘建伟.  植物生理学报. 2014(05)

博士论文
[1]小麦TaCBL和TaWRKY基因家族的克隆及功能分析[D]. 许琦.中国农业大学 2014

硕士论文
[1]南瓜CBL和CIPK基因家族的鉴定及表达模式分析[D]. 彭昭雯.华中农业大学 2019
[2]冰叶日中花McCBL1基因的克隆及初步功能分析[D]. 丰宇凯.浙江农林大学 2018
[3]蚬壳花椒种子萌发的差异表达基因初步研究[D]. 杨辉.中南林业科技大学 2015
[4]花椒皮刺分化转录组测序及数据分析[D]. 蒋弘刚.西北农林科技大学 2014



本文编号：3411655