地中海贫血症红细胞谱系发育分化基因筛查及机制研究

发布时间：2021-09-29 06:58

　　地中海贫血症是世界上最常见和发生率最高的一种单基因遗传病。目前临床上地中海贫血症没有可以普遍推广的根治方法。产前诊断在地中海贫血症的预防上有重要贡献。由于产前诊断技术的局限,导致地中海贫血症稀有突变类型不能被检测,不能完全避免地中海贫血症患儿出生。而外显子测序技术有可能弥补这一缺点,因此我们运用外显子测序技术对地中海贫血症基因携带者羊水样本进行检测,既能验证临床产前诊断结果,同时也是为了发现新的变异位点。我们通过外显子测序筛选出1344个共有变异位点。通过对这些共有变异位点进行GO富集分析筛选了26个term,涵盖膜的整体成分、跨膜信号受体活性、细胞外基质结构成分、钙离子结合等;通过KEGG富集分析筛选了13条信号通路,包括糖酵解/糖异生、ECM受体相互作用、补体与凝血级联反应等。这些基因和信号通路可能与地中海贫血症的发病机制密切相关,其结果需要进一步验证。另一方面,珠蛋白基因缺陷影响红细胞发育过程。红细胞的发育起源于造血干细胞,对造血干细胞的机理研究是根治地中海贫血症等一系列血液疾病的潜在突破口。我们利用磁珠分选和流式分选的方法从脐带血样本分离纯化CD34阳性细胞,在体外运用多种细胞... 

【文章来源】：哈尔滨工业大学黑龙江省 211工程院校 985工程院校

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【学位级别】：硕士

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外显子测序分析流程图

哈尔滨工业大学理学硕士论文-38-表3-2地中海贫血样本SNP-InDel统计表样本来源SNPnumberInDelnumberCYMZQYLWLCLZGCL477924819047697473474786940974048396940534068SNP变异和InDel变异检测统计包括变异发生在基因组位置的信息和变异导致功能上的改变的信息。由图3-2展示的结果，SNP在基因组上发生的主要位置集中在外显子区域（橙色部分）和内含子区域（灰绿色部分），两者占据SNP总量的80%以上，总体分布比较均匀。图3-2SNP基因位置信息统计图InDel在基因组上发生的位置与SNP不同，由图3-3可知，主要集中在内含子区域（草绿色部分），占据了全部InDel数量的60%到70%。推测是因为InDel变异发生在外显子区域对基因的编码表达影响较大，大概率造成不良后果，不容易遗传保留下来。

哈尔滨工业大学理学硕士论文-39-图3-3InDel基因位置信息统计图发生在编码区域的SNP变异对编码基因有不同类型的影响。由图3-4可知，主要的结果是引起非同义突变（红色部分）和同义突变（蓝色部分），二者占比超过了98%。还有小于1%的终止突变类型（绿色部分），部分突变功能未知。图3-4编码区域SNP基因功能信息统计图


本文编号：3413264