基于TCGA数据库的吸烟相关肺腺癌基因表达差异及临床意义

发布时间：2021-10-09 06:58

　　目的:我们探究了吸烟对肺腺癌患者的mRNA及miRNA的表达影响,获得与生存紧密相关的mRNA及miRNA,进一步探讨其指导肺腺癌的诊断、治疗及评价预后的临床应用价值。方法:本研究利用TCGA数据库,从中获取肺腺癌样本的mRNA和miRNA表达谱数据及与临床预后相关的数据,对数据进行筛选选出有完整的吸烟和预后信息数据的样本进行下一步分析。（1）我们通过利用R语言统计软件中的limma包对mRNA表达数据进行差异分析,获取与吸烟相关的差异表达mRNA,将筛选条件设为P.Value<0.001,adj.P.Val<0.001,logFC>2。利用SPSS 20.0软件对筛选出的差异mRNA进行Kaplan-Meier生存分析,P<0.05说明该mRNA在肺腺癌中的表达对病人生存期存在显著影响。利用DAVID软件探究对生存具有显著影响的吸烟相关肺腺癌差异mRNA存在的KEGG_PATHWAY信号通路。（2）我们同样利用R语言的limma包对miRNA表达数据进行差异分析,获取在吸烟与不吸烟样本中存在差异表达的miRNA,筛选条件为P.Value&l... 

【文章来源】：大连医科大学辽宁省

【文章页数】：46 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

在cBioPortal中获取肺腺癌mRNA表达数据及临床信息

图 3.具有显著生存差异的 8 个 miRNA(A.hsa-mir-4709，B.hsa-mir-99a，C.hsa-mir-30e，D.hsa-mir-1976，E.hsa-mir-181c，F.hsa-mir-101-2，G.hsa-mir-101-1，H.hsa-let-7c)（四）讨论恶性肿瘤中肺癌是发病率和死亡率都高的肿瘤，对人们的社会生活造成严重经济负担，对人类的生命健康造成严重影响。肺癌中有 80%为非小细胞癌，包括肺鳞癌、肺腺癌、大细胞癌三种类型。吸烟是肺癌主要的致癌因素，通常肺鳞癌被认为与吸烟关系密切，但近年来调查显示肺鳞癌的比例较前下降，而肺腺癌的比例上升，中国目前的吸烟人口仍处于较高水平，控烟难度大，肺腺癌人数的上升可能与过滤嘴香烟的普及有关，肺腺癌与吸烟之间的关系需要重新审视。肺腺癌相比肺鳞癌具有发展迅速、转移早、预后差等特点，随着对肺癌的分子病因学的深入了解及分子靶向药物治疗在分子机制水平针对性较强，有着高效、安全的特点，探索更多

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3425869