基于TCGA数据库数据NME基因家族生物学功能、在肝癌诊断和预后预测中的应用分析

发布时间：2021-10-10 19:20

　　目的基于TCGA数据库数据分析肿瘤转移相关（NME）基因家族（NME 1、2、3、4、5、6、7）生物学功能、相关信号通路,并探讨NME基因家族成员对肝癌的诊断、预测预后效能及其与肝癌患者预后的关系。方法从TCGA数据库获取NME基因家族在肝癌组织和癌旁组织中的表达水平和肝癌患者临床病理资料。对NME基因进行基因本体论（GO）及KEGG代谢通路分析。比较肝癌组织与癌旁组织中NME基因的表达。应用ROC评价NME基因对肝癌的诊断效能。采用单因素生存分析、Log-rank检验和多因素COX生存分析法分析NME基因家族与肝癌患者预后的关系。结果 NME基因主要参与调节核苷二磷酸激酶活性、细胞凋亡、发育等生物学过程,主要涉及新陈代谢、抗生素合成、嘌呤和嘧啶代谢途径等相关通路。肝癌组织中NME1、NME2、NME3、NME6、NME7水平均高于癌旁组织（t分别为8.927、7.044、5.267、8.370、4.349,P均<0.000 1）,肝癌组织中NME5水平低于癌旁组织（t=4.306,P <0.000 1）,肝癌组织及癌旁组织中NME4水平比较,t=1.403,P=0.16... 

【文章来源】：山东医药. 2020,60(27)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 数据获取
    1.2 NME基因家族的生物功能分析
    1.3 肝癌组织和癌旁组织NME基因的表达观察
    1.4 NME基因家族对肝癌的诊断效能评价
    1.5 NME基因家族对肝癌预后的预测分析
2 结果
    2.1 NME基因家族的生物学功能及信号通路
    2.2 肝癌组织及癌旁组织中NME基因家族的表达比较
    2.3 NME基因家族对肝癌的诊断效能
    2.4 NME家族基因表达与肝癌患者预后相关性
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]WTX与NME1在结直肠癌组织中的表达变化及其关系探讨[J]. 陈文静,徐家辉,徐阳微,张庆玲.  山东医药. 2016(34)
[2]nm23基因在原发性乳腺癌组织中的表达及意义[J]. 马燕飞,浦涧,卢冠铭,陈永诚,覃强,黄剑.  医学临床研究. 2015 (08)
[3]骨髓间质干细胞与肿瘤细胞中FN1、NME2、TIMP3基因表达检测[J]. 曹维克,许文荣,朱伟,姜润秋,钱晖.  临床检验杂志. 2006(02)



本文编号：3429001