柑橘溃疡病抗性SNP标记验证及关联基因表达分析
发布时间：2021-10-17 18:03
柑橘溃疡病是由柑橘黄单胞菌柑橘亚种（Xanthomonas citri subsp.Citri.,,Xcc）引起的检疫性病害之一,会导致落叶落果,甚至整树枯死,严重影响世界柑橘产业的健康发展。培育抗病品种是防控柑橘溃疡病最根本、最有效的方法。由于传统的杂交育种方法育种效率低,转基因柑橘的存在食品安全问题,所以亟待一种更高效、安全的育种方式。分子标记辅助选择（Marker-assisted Selection,MAS）是一种基于基因型选择的育种方法,选择准确性高,不受环境条件影响,可极大地提高选择效率,缩短育种年限。因此,开发与柑橘溃疡病抗性关联的分子标记,对加快柑橘溃疡病抗性品种选育具有重要意义。本研究室之前从金柑、四季桔、台湾椪柑和纽荷尔的转录组数据中挖掘出170多个差异表达且存在单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）的激酶基因,并以100多个柑橘品种（自然群体）为材料进行溃疡抗性鉴定和SNP分型,通过关联分析筛选到14个与柑橘溃疡病抗性关联的SNP。为进一步验证这些SNP的准确性,本研究将利用耐/感柑橘品种的杂交F1群体为材料,采用离...
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
DNA分子1与DNA分子2在同一位点上碱基对不同Fig.1DifferentsinglebasepairatthesamesiteoftwoDNAmolecules.
西南大学硕士学位论文26 第4章结果与分析4.1F1群体溃疡病抗性鉴定采用针刺接种法对143个供试材料进行溃疡病抗性离体鉴定，接菌10d后拍照统计计算病斑面积，以敏感品种’冰糖橙’和高抗品种‘金弹’作对照，根据病斑面积大小分级，计算材料的病情指数（表11）。结果显示，143供试材料病斑面积在0.75–3.29mm2之间；而‘金弹’病斑面积为0.5mm2，‘冰糖橙’病斑面积为3.69mm2。杂交F1群体的病情指数在30.2–100之间，对照‘金弹’的病情指数为11.1，‘冰糖橙’为100如表一。不同组合的F1群体间抗性差异较大，同一组合后代不同个体间的抗性也存在差异。发病程度较低的杂交后代，其亲本至少有1个为耐病性品种，母本耐病性强的居多,如清见♀（中抗）×冰糖橙♂（敏感）（图3）。但母本对溃疡病敏感而父本耐病性强的杂交组合其F1代表现耐病性强的也不少，如沃柑♀（敏感）×南丰蜜桔♂（高抗）等杂交组合，其F1代中抗性表型为中抗以上的占到近1/3（图4）。根据病情指数分级，140个杂交材料中对溃疡病抗性表型为免疫的0个，高抗17个，中抗30个，中感38个，高度敏感的55个（图2）。图2.140个杂交材料溃疡病病情指数和病斑面积分布图Fig2.Diseaseindexdistributionandlesionareaof143testedmaterials
第4章结果与分析27 图3.清见♀×冰糖橙♂杂交后代溃疡病病斑面积和病情指数分布图Fig3.Diseaseindexdistributionandlesionareaof‘QingJian’בBingtangOrange’图4.沃柑♀（敏感）×南丰蜜桔♂（高抗）杂交后代溃疡病病斑面积和病情指数分布图Fig4.Diseaseindexdistributionandlesionareaof‘WoGan’בNanFengMiJv’
【参考文献】：
期刊论文
[1]分子标记辅助选择在大豆育种中的应用[J]. 王欣,李长锁. 现代化农业. 2017(12)
[2]对防治柑橘溃疡病几个问题的思考[J]. 陈长福. 南方农业. 2017(16)
[3]柑桔溃疡病的为害症状及防治对策[J]. 朱雪梅. 现代园艺. 2017(05)
[4]参与植物天然免疫的LRR型蛋白[J]. 张肖晗,赵芊,谢晨星,靳晓扬,宋水山. 基因组学与应用生物学. 2016(09)
[5]柑橘品种对不同基因型柑橘衰退病毒的抑制及变异的影响[J]. 唐萌,金鑫,周常勇,李中安,陶珍珍,周彦. 园艺学报. 2016(01)
[6]分子标记辅助选择选育高抗性淀粉水稻新品种[J]. 杨瑞芳,白建江,方军,曾威,朴钟泽,李刚夑. 核农学报. 2015(12)
[7]广西柑橘病虫害综合防治及其应用[J]. 兰中举. 南方农业. 2015(33)
[8]柑橘黄化脉明病毒DTBIA检测方法的建立[J]. 宾羽,宋震,李中安,周常勇. 园艺学报. 2015(09)
[9]不同柑橘属种质对柑橘褐斑病菌的抗性评价[J]. 胡军华,刘荣萍,王雪莲,周娜,洪棋斌,姚廷山,李太盛,江东,曹立,李鸿筠. 果树学报. 2015(04)
[10]基于复杂性测度的柑橘病虫害识别[J]. 温芝元,曹乐平. 中国农学通报. 2015(10)
博士论文
[1]弓形虫钙依赖性蛋白激酶的功能及免疫保护性研究[D]. 王金磊.中国农业科学院 2017
[2]拟南芥和烟草LRR受体激酶家族及其在调控叶片衰老中作用研究[D]. MADIHA HAMYAT.中国农业科学院 2016
硕士论文
[1]酸橙与甜橙的遗传起源及柑橘糖酸变化初探[D]. 何发.华中农业大学 2017
[2]小麦SNP标记与SSR标记整合高密度遗传图谱的构建[D]. 陈成.南京农业大学 2016
[3]柑橘种质资源抗溃疡病评价[D]. 胡青波.湖南农业大学 2010
[4]安全合理使用农药防治柑橘病虫害计算机咨询系统[D]. 高松.浙江大学 2003
本文编号：3442189
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
DNA分子1与DNA分子2在同一位点上碱基对不同Fig.1DifferentsinglebasepairatthesamesiteoftwoDNAmolecules.
西南大学硕士学位论文26 第4章结果与分析4.1F1群体溃疡病抗性鉴定采用针刺接种法对143个供试材料进行溃疡病抗性离体鉴定，接菌10d后拍照统计计算病斑面积，以敏感品种’冰糖橙’和高抗品种‘金弹’作对照，根据病斑面积大小分级，计算材料的病情指数（表11）。结果显示，143供试材料病斑面积在0.75–3.29mm2之间；而‘金弹’病斑面积为0.5mm2，‘冰糖橙’病斑面积为3.69mm2。杂交F1群体的病情指数在30.2–100之间，对照‘金弹’的病情指数为11.1，‘冰糖橙’为100如表一。不同组合的F1群体间抗性差异较大，同一组合后代不同个体间的抗性也存在差异。发病程度较低的杂交后代，其亲本至少有1个为耐病性品种，母本耐病性强的居多,如清见♀（中抗）×冰糖橙♂（敏感）（图3）。但母本对溃疡病敏感而父本耐病性强的杂交组合其F1代表现耐病性强的也不少，如沃柑♀（敏感）×南丰蜜桔♂（高抗）等杂交组合，其F1代中抗性表型为中抗以上的占到近1/3（图4）。根据病情指数分级，140个杂交材料中对溃疡病抗性表型为免疫的0个，高抗17个，中抗30个，中感38个，高度敏感的55个（图2）。图2.140个杂交材料溃疡病病情指数和病斑面积分布图Fig2.Diseaseindexdistributionandlesionareaof143testedmaterials
第4章结果与分析27 图3.清见♀×冰糖橙♂杂交后代溃疡病病斑面积和病情指数分布图Fig3.Diseaseindexdistributionandlesionareaof‘QingJian’בBingtangOrange’图4.沃柑♀（敏感）×南丰蜜桔♂（高抗）杂交后代溃疡病病斑面积和病情指数分布图Fig4.Diseaseindexdistributionandlesionareaof‘WoGan’בNanFengMiJv’
【参考文献】：
期刊论文
[1]分子标记辅助选择在大豆育种中的应用[J]. 王欣,李长锁. 现代化农业. 2017(12)
[2]对防治柑橘溃疡病几个问题的思考[J]. 陈长福. 南方农业. 2017(16)
[3]柑桔溃疡病的为害症状及防治对策[J]. 朱雪梅. 现代园艺. 2017(05)
[4]参与植物天然免疫的LRR型蛋白[J]. 张肖晗,赵芊,谢晨星,靳晓扬,宋水山. 基因组学与应用生物学. 2016(09)
[5]柑橘品种对不同基因型柑橘衰退病毒的抑制及变异的影响[J]. 唐萌,金鑫,周常勇,李中安,陶珍珍,周彦. 园艺学报. 2016(01)
[6]分子标记辅助选择选育高抗性淀粉水稻新品种[J]. 杨瑞芳,白建江,方军,曾威,朴钟泽,李刚夑. 核农学报. 2015(12)
[7]广西柑橘病虫害综合防治及其应用[J]. 兰中举. 南方农业. 2015(33)
[8]柑橘黄化脉明病毒DTBIA检测方法的建立[J]. 宾羽,宋震,李中安,周常勇. 园艺学报. 2015(09)
[9]不同柑橘属种质对柑橘褐斑病菌的抗性评价[J]. 胡军华,刘荣萍,王雪莲,周娜,洪棋斌,姚廷山,李太盛,江东,曹立,李鸿筠. 果树学报. 2015(04)
[10]基于复杂性测度的柑橘病虫害识别[J]. 温芝元,曹乐平. 中国农学通报. 2015(10)
博士论文
[1]弓形虫钙依赖性蛋白激酶的功能及免疫保护性研究[D]. 王金磊.中国农业科学院 2017
[2]拟南芥和烟草LRR受体激酶家族及其在调控叶片衰老中作用研究[D]. MADIHA HAMYAT.中国农业科学院 2016
硕士论文
[1]酸橙与甜橙的遗传起源及柑橘糖酸变化初探[D]. 何发.华中农业大学 2017
[2]小麦SNP标记与SSR标记整合高密度遗传图谱的构建[D]. 陈成.南京农业大学 2016
[3]柑橘种质资源抗溃疡病评价[D]. 胡青波.湖南农业大学 2010
[4]安全合理使用农药防治柑橘病虫害计算机咨询系统[D]. 高松.浙江大学 2003
本文编号：3442189
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