利用蛋白组学挖掘小麦赤霉病抗性相关基因
发布时间：2021-10-19 13:05
赤霉病是一种毁坏性的小麦病害,可导致减产并影响籽粒品质。高通量的蛋白组学技术的发展,使得鉴定抗病相关基因成为可能。由于采用单一基因型为背景材料,前人在小麦与赤霉菌互作蛋白组学方面的研究具有一定的局限性。本研究使用了非标蛋白组学技术,针对混池的小麦穗轴,鉴定了多个基因型背景下四个混合样品池的蛋白表达水平:抗病接种池（RF）,抗病对照池（RC）,感病接种池（SF）和感病对照池（SC）。比较蛋白组学发现,RF与RC之间有126个差异蛋白,SF与SC之间133个,RF与SF之间115个。通过将鉴定到的所有蛋白比对至中国春参考基因组,同时搜索文献数据库,本研究构建了 17小麦赤霉病一致性抗病QTL（quantitative traitlocus）图谱,并将蛋白映射到这些区间中,共404个蛋白落入对应的QTL区间,其中有38个差异表达蛋白,这些蛋白为克隆相关QTL提供候选基因。本研究利用加权基因共表达网络（Weightedcorrelation network analysis,WGCNA）对蛋白表达数据进行了分析,以期发现与抗、感病关联的核心调控蛋白。结果共构建了 23个蛋白表达模块,蓝色模块中...
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：54 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
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２．３．３非标记蛋白鉴定??Ｌａｂｅｌ－Ｆｒｅｅ非标记蛋白定量技术共鉴定到超过４５００个小麦族蛋白，其中有定量数据的??共３５５０个。大部分蛋白的肽段覆盖率都在３０％以下，分子量集中在１０－６０ｋＤａ?（图３〉。从??ｍａｒｋｅｒ?ＲＣ１?ＲＣ２?ＲＣ３?ＳＣＩ?ＳＣ２?ＳＣ３?ＲＦ１?ＲＦ２?ＲＦ３?ｍａｒｋｅｒ?ＳＦ１?ＳＦ２?ＳＦ３??：：＿脚１｜｜?：?“??２〇ｋｄ?９ＨＢ??＾１３，２議隳Ｓ鶼??一漏?Ｓ￡ｆＳ?灘驅，１ＳＫＤ（１ｉ??騰％？??１０ＫＤ???图２样品ＳＤＳ－ＰＡＧＥ电泳图??Ｆｉｇｕｒｅ?２?ＳＤＳ－ＰＡＧＥ?ｆｏｒ?ｓａｍｐｌｅｓ??Ａ－ｉ?８２３?ｂ，ｍｏ］?－??ｓ：ｉｉｊｉｉｉ，＾ｉ７?Ｉ：?ｉｉｉｉｉｎ?ｉ??Ｈｌ．ｌ丨刚购＾ｌｉｌｌｌｌｌｌｌｌｌｉｔｌ??肽段覆ｓ率（％）?分子量＜ｋＤａ）??ＩＣ?Ｄ，〇〇〇，．－??１６００?■?Ｉ??ｊｔｔ??［ｌｉｎｉｉＬ．??１?２?３?４?５?６－９?１０－１９?２０－２９?＞３０?＼?２?３－４?５－６?７－８?９－１０?１１－１２?１３－１４?１５－１６?１７－３３??匹配肽段数?唯一肽段数??图３非标蛋白定量分布。Ａ，肽段覆盖率分布；Ｂ：分子量分布；Ｃ，匹配肽段数分布；Ｄ，蛋白唯??一肽段数分布。??Ｆｉｇｕｒｅ?３?Ｌａｂｅｌ－ｆｒｅｅ?ｑｕａｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ．?Ａ
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【参考文献】：
期刊论文
[1]中国小麦品种抗赤霉病基因Fhb1的鉴定与溯源[J]. 朱展望,徐登安,程顺和,高春保,夏先春,郝元峰,何中虎. 作物学报. 2018(04)
[2]植物热激蛋白90的分子作用机理及其利用研究进展[J]. 裴丽丽,徐兆师,尹丽娟,李连城,陈明,郭玉华,马有志. 植物遗传资源学报. 2013(01)
[3]中国小麦赤霉病的危害及抗性遗传改良[J]. 程顺和,张勇,别同德,高德荣,张伯桥. 江苏农业学报. 2012(05)
[4]应用荧光光谱法研究植物LEA3蛋白11-氨基酸基序的保护功能[J]. 刘昀,邓银霞,张玉芹,徐宏,郑易之. 光谱学与光谱分析. 2011(06)
[5]植物细胞色素P450基因与功能研究进展[J]. 贺丽虹,赵淑娟,胡之璧. 药物生物技术. 2008(02)
[6]植物中活性氧的产生及清除机制[J]. 杜秀敏,殷文璇,赵彦修,张慧. 生物工程学报. 2001(02)
[7]植物胚胎发育后期富集（LEA）蛋白的研究进展[J]. 汤学军,傅家瑞. 植物学通报. 1997(01)
本文编号：3444929
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：54 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２样品ＳＤＳ－ＰＡＧＥ电泳图??Ｆｉｇｕｒｅ?２?ＳＤＳ－ＰＡＧＥ?ｆｏｒ?ｓａｍｐｌｅｓ??
２．３．３非标记蛋白鉴定??Ｌａｂｅｌ－Ｆｒｅｅ非标记蛋白定量技术共鉴定到超过４５００个小麦族蛋白，其中有定量数据的??共３５５０个。大部分蛋白的肽段覆盖率都在３０％以下，分子量集中在１０－６０ｋＤａ?（图３〉。从??ｍａｒｋｅｒ?ＲＣ１?ＲＣ２?ＲＣ３?ＳＣＩ?ＳＣ２?ＳＣ３?ＲＦ１?ＲＦ２?ＲＦ３?ｍａｒｋｅｒ?ＳＦ１?ＳＦ２?ＳＦ３??：：＿脚１｜｜?：?“??２〇ｋｄ?９ＨＢ??＾１３，２議隳Ｓ鶼??一漏?Ｓ￡ｆＳ?灘驅，１ＳＫＤ（１ｉ??騰％？??１０ＫＤ???图２样品ＳＤＳ－ＰＡＧＥ电泳图??Ｆｉｇｕｒｅ?２?ＳＤＳ－ＰＡＧＥ?ｆｏｒ?ｓａｍｐｌｅｓ??Ａ－ｉ?８２３?ｂ，ｍｏ］?－??ｓ：ｉｉｊｉｉｉ，＾ｉ７?Ｉ：?ｉｉｉｉｉｎ?ｉ??Ｈｌ．ｌ丨刚购＾ｌｉｌｌｌｌｌｌｌｌｌｉｔｌ??肽段覆ｓ率（％）?分子量＜ｋＤａ）??ＩＣ?Ｄ，〇〇〇，．－??１６００?■?Ｉ??ｊｔｔ??［ｌｉｎｉｉＬ．??１?２?３?４?５?６－９?１０－１９?２０－２９?＞３０?＼?２?３－４?５－６?７－８?９－１０?１１－１２?１３－１４?１５－１６?１７－３３??匹配肽段数?唯一肽段数??图３非标蛋白定量分布。Ａ，肽段覆盖率分布；Ｂ：分子量分布；Ｃ，匹配肽段数分布；Ｄ，蛋白唯??一肽段数分布。??Ｆｉｇｕｒｅ?３?Ｌａｂｅｌ－ｆｒｅｅ?ｑｕａｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ．?Ａ
２．３．４比较蛋白组学??２．３．４．?１接种混池和对照混池的比较??抗病接种组ＲＦ和抗病对照组ＲＣ之间的差异蛋白共１２６个（图４），其中９９个蛋白??ｍｍ??ＲＦ?ｖａ．?ＲＣ?ＳＦ?？＞．?ＳＣ?ＲＣ?ＳＣ?ＲＦ?ｖ．ｖ．?ＳＦ??图４差异蛋白的韦恩图。ＲＦｖ５．?ＲＣ：?ＲＦ池和ＲＣ池间的比较；ＳＦｖ＆ＳＣ：?ＳＦ池和ＳＣ池间的比??较；ＲＣｗ．ＳＣ：?ＲＣ池和ＳＣ池间的比较；ＲＦｖ＾．ＳＦ：?ＲＦ池和ＳＦ池间的比较??Ｆｉｇｕｒｅ?４?Ｖｅｎｎ?ｄｉａｇｒａｍ?ｄｅｐｉｃｔｉｎｇ?ｔｈｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ａｃｃｕｍｕｌａｔｅｄ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ．?ＲＦ?ｖｓ．?ＲＣ：??Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ＲＦ?ａｎｄ?ＲＣ；?ＳＦ?ｖｓ．?ＳＣ：?Ｃｏｍ
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国小麦品种抗赤霉病基因Fhb1的鉴定与溯源[J]. 朱展望,徐登安,程顺和,高春保,夏先春,郝元峰,何中虎. 作物学报. 2018(04)
[2]植物热激蛋白90的分子作用机理及其利用研究进展[J]. 裴丽丽,徐兆师,尹丽娟,李连城,陈明,郭玉华,马有志. 植物遗传资源学报. 2013(01)
[3]中国小麦赤霉病的危害及抗性遗传改良[J]. 程顺和,张勇,别同德,高德荣,张伯桥. 江苏农业学报. 2012(05)
[4]应用荧光光谱法研究植物LEA3蛋白11-氨基酸基序的保护功能[J]. 刘昀,邓银霞,张玉芹,徐宏,郑易之. 光谱学与光谱分析. 2011(06)
[5]植物细胞色素P450基因与功能研究进展[J]. 贺丽虹,赵淑娟,胡之璧. 药物生物技术. 2008(02)
[6]植物中活性氧的产生及清除机制[J]. 杜秀敏,殷文璇,赵彦修,张慧. 生物工程学报. 2001(02)
[7]植物胚胎发育后期富集（LEA）蛋白的研究进展[J]. 汤学军,傅家瑞. 植物学通报. 1997(01)
本文编号：3444929
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