薄皮甜瓜（Cucumis melo L. var. chinensis Pangalo）果皮花斑的遗传分析及基因定位

发布时间：2021-10-20 10:43

　　甜瓜（Cucumis melo L.）,属葫芦科甜瓜属（2n=2x=24）,是一年生的蔓性草本植物,我国甜瓜的播种面积居世界第一。薄皮甜瓜是中国特色品种,因为具有较好的经济效益,种植的面积逐年增长。本试验以薄皮甜瓜（Cucumis melo L.var.chinensis Pangalo）材料IM16559（P₁,无斑）、IM16553（P₂,有斑）及其配制的F₁（正交）、F’₁（反交）、F₂群体、BC₁P₁群体和BC₁P₂群体为材料,将六世代群体田间调查结果和F₂群体有斑、无斑DNA混池测序结果相结合,得到薄皮甜瓜果皮花斑基因的初步候选区间。又扩大群体,通过重组单株的筛选和分子标记的加密进一步缩小区间,挖掘与基因连锁的分子标记并进行候选区间的分析。本试验的研究结果如下:1.薄皮甜瓜果皮花斑的遗传分析田间调查发现,P₂、F₁（... 

【文章来源】：中国农业科学院北京市

【文章页数】：53 页

【学位级别】：硕士

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士学位论文 第二章 薄皮甜瓜果第二章 薄皮甜瓜果皮花斑的遗传分析性状是甜瓜重要的外观品质之一，目前国内外对于甜瓜果皮花群体进行性状的遗传分析在植物中有广泛的应用，如黄瓜（申，2012）、甘蓝（Han et al., 2015）等。本研究采用薄皮甜瓜（C）构建的六世代群体为材料，通过表型的调查和分析来明确果皮础研究进行了一定的补充。法验材料是 2 份薄皮甜瓜（Cucumis melo L. var. chinensis Pangal绿色点状花斑的 IM16553 及其构建的六世代群体。亲本及杂交验材料均由中国农业科学院蔬菜花卉研究所西甜瓜课题组提供

业科学院硕士学位论文 第三章 薄皮甜瓜果皮花斑基因 CmSp-1 的 测序数据的质控于测序起点处存在少量 DNA 簇的重叠，分析软件在对重叠区进行分析时 5′ 端前误率相对较高。由于测序过程中化学试剂的消耗，测序错误率会随着序列长度的增而在对碱基测序质量进行分析时，样品中分布在前 4 个碱基和后十几个碱基的质量测序碱基。错误率分布如图 3.2 所示，横坐标为 reads 的碱基位置，纵坐标为单碱151 bp为双端测序序列的第一端测序reads的错误率分布情况，后151 bp为另一端测率分布情况。由图 3.2 可以看出，测序序列碱基质量分布在前 4 个碱基和后十几个会低于中间测序碱基，但其质量值都高于 Q30，表明测序序列正确率高于 99.9%，分析。碱基类型分布用于检测有无 AT、GC 分离现象（图 3.3），根据碱基互补配对T 和 C 与 G 的含量分别是一致的，图中横坐标为 reads 的碱基位置，纵坐标为碱基所色、蓝色、红色、紫色分别代表碱基 G、C、A、T，灰色代表测序中识别不出的碱1 bp 为双端测序序列的第一端测序 reads 的碱基分布，后 151 bp 为另一端测序 reads结果显示 AT、CG 碱基基本不发生分离且曲线较平缓，说明测序结果正常。


本文编号：3446766