miR-4472的靶基因预测及生物信息学分析

发布时间：2021-10-25 06:08

　　目的应用生物信息学分析方法预测miR-4472的靶基因及信号通路。方法利用miRBase数据库分析miR-4472的物种保守性;利用Targetscan、miRDB数据库进行靶基因预测,再用DAVID数据库将miR-4472的预测靶基因集合进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）生物通路富集分析。结果 miR-4472预测的交集靶基因共378个。GO分析结果显示,miR-4472的靶基因主要参与转录的正负调节、细胞凋亡、蛋白质磷酸化等生物过程（均P<0.01）。KEGG信号通路分析结果显示,miR-4472的靶基因显著富集于PI3K-Akt信号通路、胰高血糖素相关信号通路、心肌细胞中的肾上腺素能信号传导通路、醛固酮的合成和分泌相关信号通路（均P<0.05）。结论 miR-4472靶基因富集的信号通路均与新生儿缺氧缺血性脑病密切相关,尤其是P13K/AKt信号通路。 

【文章来源】：浙江医学. 2020,42(13)

【文章页数】：4 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 miR-4472的物种保守性分析
    1.2 miR-4472的靶基因预测
    1.3 miR-4472预测靶基因的生物功能及信号通路富集分析
2 结果
    2.1 miR-4472的物种保守性分析
    2.2 miR-4472的靶基因预测
    2.3 miR-4472预测靶基因的生物功能及信号通路分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3456805