小麦粒重QTL侧翼标记开发和粒型同源基因GLW7的结构和表达分析
发布时间:2021-10-29 03:19
千粒重(Thousand Grain Weigh,TGW)是构成小麦产量的三因素之一。本课题组先前利用西藏半野生小麦Q1028(Q1028)和郑麦9023(ZM9023)构建的重组自交系(RIL)群体,鉴定出一个位于小麦2D染色体上控制千粒重的主效数量性状基因座(Quantitative Trait Locus,QTL)(QTgw.sau-2D),该QTL的加性效应来自郑麦9023。本研究利用比较基因组学对QTgw.sau-2DQTL进行分子标记的开发和验证以及遗传图谱的密化,为QTL的精细定位及其分子辅助育种奠定了基础。OsGLW7是在水稻中正向调节籽粒大小和粒重的重要基因。而我们对其在小麦中的同源基因TaGLW7知之甚少。本研究对TaGLW7基因进行了基因结构分析、蛋白结构分析、进化分析、启动子区域分析以及表达模式分析。此外,本研究对大麦(Hordeum vulgare,HvGLW7)、水稻(Oryza sativa,OsGLW7)、短柄草(Brachypodium distachyon,BdGLW7)、野生二粒小麦(Triticum turgidum,TtGLW7)、乌拉尔图小麦...
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:97 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
本实验用到的材料Fig.2-1Thematerialsusedinthisexperiment
确定千粒重的目标区间在 478111860~585677005 范围内,并且在目标间内总共检测到 100 个基因(图 2-2,附表 2-1)。经过进一步的筛选,得到了 32 个单拷贝基因用于检测 Q1028 和 ZM023 之间存在的多态性(图 2-2;附表 2-2)。由于启动子序列多态性往往较高,本试验在各个基因编码序列起始密码子的 5’端前选择了 1500bp 启动子序列来检测 32 个基因在 Q1028 和 ZM9023 亲本之间的多态性。最后选取了 11 个在“中国春”小麦的 2A、2B、2D 三条同源染色体中同源性较高的基因。
19图2-3SCAR标记的PCR的检测,“M”表示Maker,红色框内为目的片段Fig.2-3DetectionofSCARmarkersbyPCR,“M”standsforMaker,andtheredframeisthetargetsegment.2.3.3开发的HRM标记本实验经过对11个同源性较好的基因进行克隆测序后发现3个基因具有多态性,总共检测到了11个SNP(表2-2;图2-3)。我们根据这些SNP设计了11对HRM引物(表S4),其中两对引物(0C98-411、09AE-590)在Q1028和ZM9023两个亲本中检测到了多态性(表2-3)。再利用这两对HRM引物进一步对Q1028和ZM9023的RIL群体进行基因分型以构建完整的遗传图谱。最终0C98-411标记成功连锁到了遗传图谱上(图2-3)。
本文编号:3463857
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:97 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
本实验用到的材料Fig.2-1Thematerialsusedinthisexperiment
确定千粒重的目标区间在 478111860~585677005 范围内,并且在目标间内总共检测到 100 个基因(图 2-2,附表 2-1)。经过进一步的筛选,得到了 32 个单拷贝基因用于检测 Q1028 和 ZM023 之间存在的多态性(图 2-2;附表 2-2)。由于启动子序列多态性往往较高,本试验在各个基因编码序列起始密码子的 5’端前选择了 1500bp 启动子序列来检测 32 个基因在 Q1028 和 ZM9023 亲本之间的多态性。最后选取了 11 个在“中国春”小麦的 2A、2B、2D 三条同源染色体中同源性较高的基因。
19图2-3SCAR标记的PCR的检测,“M”表示Maker,红色框内为目的片段Fig.2-3DetectionofSCARmarkersbyPCR,“M”standsforMaker,andtheredframeisthetargetsegment.2.3.3开发的HRM标记本实验经过对11个同源性较好的基因进行克隆测序后发现3个基因具有多态性,总共检测到了11个SNP(表2-2;图2-3)。我们根据这些SNP设计了11对HRM引物(表S4),其中两对引物(0C98-411、09AE-590)在Q1028和ZM9023两个亲本中检测到了多态性(表2-3)。再利用这两对HRM引物进一步对Q1028和ZM9023的RIL群体进行基因分型以构建完整的遗传图谱。最终0C98-411标记成功连锁到了遗传图谱上(图2-3)。
本文编号:3463857
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3463857.html
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