基于高密度遗传图谱构建的葡萄抗寒性QTL定位及候选基因筛选研究

发布时间：2021-11-04 19:35

　　本研究以葡萄品种‘赤霞珠’ב左优红’及它们的200株杂交后代为试材,利用SSR分子标记进行真假杂种鉴定,得到真杂种单株181株,以该群体及其杂交后代一年生枝条为试材,利用差热分析（Differential Thermal Analysis,DTA）系统对葡萄枝条抗寒性进行表型鉴定,并进行简化基因组RAD测序,构建了含有大量SNP标记的高密度分子遗传图谱,结合3年抗寒性表型数据进行葡萄抗寒性QTL定位研究,得到葡萄抗寒相关QTL计算其贡献率,并根据定位出的QTL筛选出于抗寒性相关的候选基因,本试验获得如下主要结果:1.采用SSR分子标记法结合聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定‘赤霞珠’ב左优红’后代杂种真实性,从现有SSR引物中筛选出两对具有清晰条带且为ab×cd带型的引物,利用亲本对这两对引物的最佳退火温度进行筛选,在最适温度下利用这两对引物鉴定了200株后代的杂种真实性,鉴定出真杂种181株,真杂种率为90.5%,将这181株真杂种单株用于后期简化基因组RAD测序。2.利用低温差热分析系统对‘赤霞珠’ב左优红’亲本及其杂交后代一年生枝条进行抗寒性进行低温放热分析（LTE）,得到枝条温度-伤... 

【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省

【文章页数】：61 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
    1.1 葡萄抗寒机制研究进展
        1.1.1 葡萄抗寒生理机制研究进展
        1.1.2 葡萄抗寒遗传机制研究进展
        1.1.3 葡萄抗寒分子机制研究进展
    1.2 简化基因组测序技术在葡萄中的应用
    1.3 葡萄遗传图谱构建及抗寒性QTL定位研究进展
        1.3.1 葡萄遗传图谱构建研究进展
        1.3.2 抗寒性QTL定位
    1.4 葡萄抗寒性鉴定与评价
        1.4.1 DTA系统鉴定葡萄抗寒性
        1.4.2 葡萄抗寒性的评价
    1.5 本研究的目的与意义
第二章 基于RAD测序的葡萄遗传图谱构建
    2.1 试验材料
    2.2 试验方法
        2.2.1 DNA的提取
        2.2.2 DNA浓度与质量检测
        2.2.3 SSR反应体系、PCR扩增及产物检测
        2.2.4 用于假杂种鉴定的SSR引物筛选
        2.2.5 RAD-seq的主要技术流程
        2.2.6 RAD-seq数据分析
        2.2.7 遗传图谱构建
    2.3 结果与分析
        2.3.1 DNA提取浓度与纯度检测
        2.3.2 SSR引物筛选
        2.3.3 杂交群体的真假杂种鉴定
        2.3.4 RAD-seq数据分析及SNP标记开发
        2.3.5 葡萄高密度遗传图谱的构建
        2.3.6 遗传图谱的评价
    2.4 讨论
        2.4.1 作图亲本的选择
        2.4.2 杂种鉴定
        2.4.3 RAD-seq图谱构建与误差来源
第三章 作图群体抗寒性QTL定位及候选基因筛选
    3.1 试验材料
    3.2 试验方法
        3.2.1 试验仪器
        3.2.2 试验材料准备
        3.2.3 葡萄枝条LTE测定
        3.2.4 数据分析
        3.2.5 葡萄抗寒性QTL定位
    3.3 结果与分析
        3.3.1 葡萄抗寒性LT-I分析
        3.3.2 杂交后代群体抗寒性分析
        3.3.3 杂交群体后代抗寒性遗传分析
        3.3.4 抗寒性QTL位点检测
        3.3.5 抗寒性候选基因筛选
    3.4 讨论
        3.4.1 葡萄抗寒性的鉴定与评价
        3.4.2 抗寒性QTL位点分布
        3.4.3 抗寒性相关候选基因
第四章 结论
参考文献
致谢


【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3476323