2016年6月至2017年4月辽宁省人感染H7N9禽流感病毒HA和NA基因特征分析

发布时间：2021-11-06 00:55

　　目的本文对2016-2017年辽宁省人感染H7N9禽流感病毒血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）基因遗传进化特征分析。方法使用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）对选取的4株H7N9禽流感病毒株HA和NA基因进行扩增并测序,用生物信息学软件分析其基因进化变异特征。结果 2016年6月至2017年4月辽宁省4株毒株的HA和NA基因与WHO最新推荐的A/Hunan/02650/2016疫苗株的同源性最高,其HA基因的核苷酸和蛋白氨基酸序列同源性分别为99.3%～99.6%,99.8%～100%;NA基因的核苷酸和蛋白氨基酸序列同源性分别为97.7%～99.7%;98.3%～99.6%。本省所有毒株均属长江三角洲谱系,但主要聚集在两个次分支。4株病毒HA蛋白裂解位点333-342氨基酸序列均为PEIPKGR↓GLF,在338-339位点无连续的多个氨基酸插入（KRTA）,属于低致病性禽流感病毒分子特征。HA受体结合位点均出现S138A、G186V、Q226L、T221P氨基酸的突变,NA茎部区均出现"QISNT"缺失,且NA蛋白上相关耐药位点上的氨基酸并未发生突变,3株毒株NA蛋白上糖基化位点第... 

【文章来源】：现代预防医学. 2020,47(23)北大核心

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【部分图文】：

2016-2017年辽宁省人感染H7N9禽流感病毒HA基因遗传进化树

通过序列比对分析发现辽宁省4株毒株HA蛋白上裂解位点338-339位点无连续的多个氨基酸插入(KRTA),属于低致病性禽流感病毒分子特征。4株毒株HA蛋白上受体结合关键位点氨基酸均发生变异,其关键位点氨基酸变异见表3,糖基化位点分别是30NGTK,46NATE,249NDTV,421NWTR,493NNTY,较以往H7N9禽流感病毒比较在数目和位置上并未发生改变。通过序列比对辽宁省4株人感染H7N9禽流感病毒NA蛋白关键位点氨基酸发现,所有毒株在NA蛋白茎区69-73位出现“QISNT”氨基酸的缺失。所有毒株NA蛋白上神经氨酸酶抑制剂相关的耐药位点氨基酸均未发生突变,NA蛋白关键位点氨基酸特征见表3。本研究中2017年分离3株毒株NA蛋白上糖基化位点较以往毒株在第42位发生氨基酸序列NCSH→NCTH突变,剩余毒株糖基化位点未发生改变,分别是42NCSH,52NTSQ,63NETN,66NITN,82NLTK,142NGTI,197NASA。

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3478843