人参MFSs生物信息学分析及质体ATP/ADP转运蛋白基因转化胡萝卜的研究
发布时间：2021-11-06 17:22
质体ATP/ADP转运蛋白是真核生物中的一大腺苷酸转运系统,位于细胞的质体内膜上,负责能量的运输,为质体中的各种物质代谢反应提供能量,可影响植物中淀粉和脂质的含量等。本研究用实验室构建的吉林人参248,993 Unigenes数据库,筛选出199条具有完整保守域的吉林人参MFS Unigenes（PgMFSs）,利用生物信息学手段,分别从基因筛选、功能注释、表达分析和进化起源等方面,挖掘并分析吉林人参中的主要协同转运蛋白超家族（Major Facilitator Superfamily,MFS）。从中筛选出PgMFS060基因,并以农杆菌介导法成功转化胡萝卜,为该基因的功能验证奠定基础,研究结果如下:1、199条PgMFSs长度大约分布在1000 bp-3000 bp之间;在Level 2水平上,一共注释到了10条GO亚功能,且富集分析显示,转运活性、膜、细胞部分、细胞器部分、膜部分这五个亚功能存在极显著差异。2、利用NJ法绘制进化树,显示具有完整保守域的来自不同转录本下合并的141条PgMFSs被分成8个亚家族,相同家族的基因基本聚类在一起,在进化上大都具有保守性。3、分析了PgMF...
【文章来源】：吉林农业大学吉林省
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
MVA途径和MEP途径Fig.1.1MVApathwayandMEPpathway
图 1.2 类胡萝卜素的合成途径Fig.1.2 Carotenoid biosynthetic pathway与意义TP/ADP 转运蛋白位于细胞的质体内膜上负责能量的运输，参与质应。目前在植物中淀粉和脂质代谢途径研究较为深入，而在人参皂究报道，推测在位于质体的人参皂苷合成途径的 MEP 途径中，为量。本研究用实验室构建的吉林人参 248,993 Unigenes 数据库，利别从基因筛选、功能注释、表达分析和进化起源等方面，挖掘并分同转运蛋白超家族，并筛选出一条与皂苷合成相关的质体 ATP/A0），以胡萝卜为受体，克隆 PgMFS060 并进行异源受体转化，为该础。本研究充实了人参中基因家族分析平台，为人参中重要的新基新皂苷生产方式和创新种质资源奠定基础。
S 超基因家族生物信息学分析Ss 的筛选BI 上下载所有植物中 MFS 超家族的 mRNA 序列，共获得 17,631 条构建的吉林人参 248,993 Unigenes 数据库进行本地 Blast 异源比对序列；通过 Blast 2GO 软件在线与 NCBI 比对，删除没有注释到 M域的序列，获得 437 条基因；利用 Vector 软件对同一转录本下的序获得 199 条基因，并对这些基因进行后续统计分析。Ss 功能注释与富集分析MFSs GO 功能注释结果统计分析last 2GO 软件，将最终获得的 199 条 PgMFSs 序列进行在线比对分的长度大都分布在 1000 bp-3000 bp 之间（图 3.1），且序列在 GO 水evel 2 到 level 6 水平上（图 3.2）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]人参化学成分及药理作用研究[J]. 姚梦杰,吕金朋,张乔,张辉,孙佳明. 吉林中医药. 2017(12)
[2]溶质转运蛋白超家族的功能及结构研究进展[J]. 王月,徐冰红,刘虎,姬朝光,严汉池. 现代生物医学进展. 2017(24)
[3]A plastidic ATP/ADP transporter gene, IbAATP, increases starch and amylose contents and alters starch structure in transgenic sweetpotato[J]. WANG Yan-nan,LI Yan,ZHANG Huan,ZHAI Hong,LIU Qing-chang,HE Shao-zhen. Journal of Integrative Agriculture. 2016(09)
[4]人参活性成分及人参复方制剂对细胞色素P450酶调节作用的研究进展[J]. 吴德琳,刘娟,郑思道. 中西医结合心脑血管病杂志. 2016(16)
[5]人参皂苷Rh2和Rg3抗肿瘤作用研究进展[J]. 黄月云,夏婷,赵成国,陈素云,张裔辉. 实用中医药杂志. 2016(08)
[6]胡萝卜遗传转化研究进展[J]. 张琳,李翔宇,林彦萍,王康宇,王义,张美萍. 北方园艺. 2016(13)
[7]MFS超家族转运蛋白结构基础及转运机制[J]. 邓东,颜宁. 科学通报. 2015(08)
[8]玉米ZmAATP基因的克隆及遗传转化载体的构建[J]. 于林卉,刘保申,李文兰,张宪省,赵翔宇. 山东农业大学学报(自然科学版). 2012(03)
[9]植物吸收和转运磷素的分子机理研究进展[J]. 孙传范,肖凯,韩胜芳,赵芳华,鲍金香. 中国农业科技导报. 2011(02)
[10]人参的词源学、生药学、产品及市场的现代评价[J]. 徐哲,贾力,赵余庆. 现代药物与临床. 2011(02)
博士论文
[1]人参皂苷Rg1调控经典Wnt信号通路延缓造血干/祖细胞衰老的机制研究[D]. 李静.重庆医科大学 2017
[2]甘薯淀粉合成相关基因IbAATP和IbSSI的克隆及功能分析[D]. 王雁楠.中国农业大学 2015
[3]人乳铁蛋白基因在胡萝卜（Daucus carota L.）中的表达及其功能研究[D]. 郑回勇.福建农林大学 2002
硕士论文
[1]人参中高极性人参皂苷类成分的研究[D]. 张佳音.吉林大学 2017
[2]干扰人参CS基因的表达对人参三萜成分含量的影响[D]. 何沐阳.吉林大学 2013
[3]利用抑制剂对人参皂苷生物合成途径MVA与MEP的研究[D]. 刘丽.吉林大学 2012
[4]转ATP/ADP转运蛋白基因水稻的获得及其初步研究[D]. 黄伟奇.福建农林大学 2005
本文编号：3480228
【文章来源】：吉林农业大学吉林省
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
MVA途径和MEP途径Fig.1.1MVApathwayandMEPpathway
图 1.2 类胡萝卜素的合成途径Fig.1.2 Carotenoid biosynthetic pathway与意义TP/ADP 转运蛋白位于细胞的质体内膜上负责能量的运输，参与质应。目前在植物中淀粉和脂质代谢途径研究较为深入，而在人参皂究报道，推测在位于质体的人参皂苷合成途径的 MEP 途径中，为量。本研究用实验室构建的吉林人参 248,993 Unigenes 数据库，利别从基因筛选、功能注释、表达分析和进化起源等方面，挖掘并分同转运蛋白超家族，并筛选出一条与皂苷合成相关的质体 ATP/A0），以胡萝卜为受体，克隆 PgMFS060 并进行异源受体转化，为该础。本研究充实了人参中基因家族分析平台，为人参中重要的新基新皂苷生产方式和创新种质资源奠定基础。
S 超基因家族生物信息学分析Ss 的筛选BI 上下载所有植物中 MFS 超家族的 mRNA 序列，共获得 17,631 条构建的吉林人参 248,993 Unigenes 数据库进行本地 Blast 异源比对序列；通过 Blast 2GO 软件在线与 NCBI 比对，删除没有注释到 M域的序列，获得 437 条基因；利用 Vector 软件对同一转录本下的序获得 199 条基因，并对这些基因进行后续统计分析。Ss 功能注释与富集分析MFSs GO 功能注释结果统计分析last 2GO 软件，将最终获得的 199 条 PgMFSs 序列进行在线比对分的长度大都分布在 1000 bp-3000 bp 之间（图 3.1），且序列在 GO 水evel 2 到 level 6 水平上（图 3.2）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]人参化学成分及药理作用研究[J]. 姚梦杰,吕金朋,张乔,张辉,孙佳明. 吉林中医药. 2017(12)
[2]溶质转运蛋白超家族的功能及结构研究进展[J]. 王月,徐冰红,刘虎,姬朝光,严汉池. 现代生物医学进展. 2017(24)
[3]A plastidic ATP/ADP transporter gene, IbAATP, increases starch and amylose contents and alters starch structure in transgenic sweetpotato[J]. WANG Yan-nan,LI Yan,ZHANG Huan,ZHAI Hong,LIU Qing-chang,HE Shao-zhen. Journal of Integrative Agriculture. 2016(09)
[4]人参活性成分及人参复方制剂对细胞色素P450酶调节作用的研究进展[J]. 吴德琳,刘娟,郑思道. 中西医结合心脑血管病杂志. 2016(16)
[5]人参皂苷Rh2和Rg3抗肿瘤作用研究进展[J]. 黄月云,夏婷,赵成国,陈素云,张裔辉. 实用中医药杂志. 2016(08)
[6]胡萝卜遗传转化研究进展[J]. 张琳,李翔宇,林彦萍,王康宇,王义,张美萍. 北方园艺. 2016(13)
[7]MFS超家族转运蛋白结构基础及转运机制[J]. 邓东,颜宁. 科学通报. 2015(08)
[8]玉米ZmAATP基因的克隆及遗传转化载体的构建[J]. 于林卉,刘保申,李文兰,张宪省,赵翔宇. 山东农业大学学报(自然科学版). 2012(03)
[9]植物吸收和转运磷素的分子机理研究进展[J]. 孙传范,肖凯,韩胜芳,赵芳华,鲍金香. 中国农业科技导报. 2011(02)
[10]人参的词源学、生药学、产品及市场的现代评价[J]. 徐哲,贾力,赵余庆. 现代药物与临床. 2011(02)
博士论文
[1]人参皂苷Rg1调控经典Wnt信号通路延缓造血干/祖细胞衰老的机制研究[D]. 李静.重庆医科大学 2017
[2]甘薯淀粉合成相关基因IbAATP和IbSSI的克隆及功能分析[D]. 王雁楠.中国农业大学 2015
[3]人乳铁蛋白基因在胡萝卜（Daucus carota L.）中的表达及其功能研究[D]. 郑回勇.福建农林大学 2002
硕士论文
[1]人参中高极性人参皂苷类成分的研究[D]. 张佳音.吉林大学 2017
[2]干扰人参CS基因的表达对人参三萜成分含量的影响[D]. 何沐阳.吉林大学 2013
[3]利用抑制剂对人参皂苷生物合成途径MVA与MEP的研究[D]. 刘丽.吉林大学 2012
[4]转ATP/ADP转运蛋白基因水稻的获得及其初步研究[D]. 黄伟奇.福建农林大学 2005
本文编号：3480228
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