小麦小分子RNA TaMIR1119/5086和转录因子基因TaNF-YB6;1分子特征和耐逆功能
发布时间:2021-11-09 09:29
干旱和盐分等非生物逆境胁迫是全球范围内限制作物生长及产量形成的重要因素。揭示植物应答和抵御干旱和盐分胁迫的分子机制对于作物耐逆的遗传改良和生产实践具有重要实践意义。本研究在实验室前期工作积累基础上,对应答干旱胁迫的小麦miRNA家族成员TaMIR1119、TaMIR5086和应答盐分和干旱逆境胁迫的转录因子基因TaNF-YB6;1的分子特征及其耐逆功能进行了研究。主要研究结果如下:1.TaMIR1119的前体序列长度为176 nt,成熟序列位于84 nt至107 nt,长度为24 nt。该小分子RNA通过自身碱基互补序列形成二级茎环结构。TaMIR1119作用的靶基因有为6个,功能上分属于转录调控、RNA和生化代谢、运输和氧化胁迫逆境抵御等类别。2.干旱胁迫下,TaMIR1119及其烟草同源基因NtMIR1119在根系中呈上调表达。超表达TaMIR1119的转基因烟草植株,干旱胁迫条件下植株的生长特性得到明显改善,植株形态增大,干物质量增多,叶片光合碳同化能力增强,植株体内SOD、POD、CAT的抗氧化酶活性明显提高,表明该小麦种属miRNA成员通过内在生理生化过程改善和活性氧清除能力...
【文章来源】: 史桂清 河北农业大学
【文章页数】:59 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
TaMIR1119和NtMIR1119的前体序列比对结果
图 3-3 TaMIR1119 与其作用靶基因的碱igure 3-3 Base pairing characterization between TaMIR6 的分子特征前体序列长度为 126 nt,成熟小分子序列GGAAGGCGUGGUA-3′)。该小分子 RNA 通 所示。以干旱处理烟草的根系 cDNA 为模物(NtMIR5086)经测序结果表明与 TaM征。源于小麦和烟草的 miR5086 前体序列图 3-4 TaMIR5086 前体序列形成的茎环3-4 Characteristics of stem-loop structure formed by T
图 3-5 TaMIR5086 和 NtMIR5086 的前体序列比对结果Figure 3-5Alignment of TaMIR5086 and NtMIR5086 precursor sequencestMIR5086,下列为 TaMIR5086。预测植物种属miRNA作用靶基因的在线预测工具对 TaMIR5086 可能作用的如表 3-1 所示。TaMIR5086 作用 6 个靶基因。上述靶基因包括 2 个全基因组体 chr4 scaffold_6 基因(登录号 TC424860),二是染色体 chr7 scaffold_20 基3);2 个蛋白质因子基因,一是粳稻中 Os10g0131000 蛋白质基因(登录号 CJ5Os09g0407700 蛋白质基因(登录号 TC371590);1 个延长因子基因(一个丝氨酸蛋白酶抑制剂基因(登录号 TC377686)。TaMIR5086 通过调控上能的靶基因,在介导植株响应干旱胁迫逆境中可能发挥着重要功能。表 3-1 TaMIR5086 作用的靶基因及生物学功能Table 3-1 The target genes of TaMIR5086 and their biological functionsTarget Acc.SequencelengthExpectation(E)Target Accessibility(UPE)Target Descript
【参考文献】:
期刊论文
[1]低夜温下番茄ABA缺失突变体和野生型叶片中miRNA差异表达分析[J]. 王孝,刘阳,陈海银,刘琨,齐明芳,李天来,刘玉凤. 园艺学报. 2016(12)
[2]陆地棉种子发育过程中microRNA的挖掘与功能研究[J]. Wang Gaskin,余道乾,杜雄明. 棉花学报. 2014(01)
[3]核因子Y在植物中的分类及其功能概述[J]. 李文滨,李胜畅,王志坤. 东北农业大学学报. 2012(01)
[4]植物microRNA对重金属胁迫响应的调控[J]. 丁艳菲,朱诚,王珊珊,刘海丽. 生物化学与生物物理进展. 2011(12)
[5]转录因子与植物抗逆性研究进展[J]. 刘欣,李云. 中国农学通报. 2006(04)
[6]植物转录因子的结构与调控作用[J]. 刘强,张贵友,陈受宜. 科学通报. 2000(14)
硕士论文
[1]谷子耐盐相关基因SiNF-YA5和SiATG4的功能分析及调控途径解析[D]. 黄锁.中国农业科学院 2016
[2]玉米自交系盐胁迫响应miRNA及其靶基因的鉴定研究[D]. 付蓉.南通大学 2016
本文编号:3485072
【文章来源】: 史桂清 河北农业大学
【文章页数】:59 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
TaMIR1119和NtMIR1119的前体序列比对结果
图 3-3 TaMIR1119 与其作用靶基因的碱igure 3-3 Base pairing characterization between TaMIR6 的分子特征前体序列长度为 126 nt,成熟小分子序列GGAAGGCGUGGUA-3′)。该小分子 RNA 通 所示。以干旱处理烟草的根系 cDNA 为模物(NtMIR5086)经测序结果表明与 TaM征。源于小麦和烟草的 miR5086 前体序列图 3-4 TaMIR5086 前体序列形成的茎环3-4 Characteristics of stem-loop structure formed by T
图 3-5 TaMIR5086 和 NtMIR5086 的前体序列比对结果Figure 3-5Alignment of TaMIR5086 and NtMIR5086 precursor sequencestMIR5086,下列为 TaMIR5086。预测植物种属miRNA作用靶基因的在线预测工具对 TaMIR5086 可能作用的如表 3-1 所示。TaMIR5086 作用 6 个靶基因。上述靶基因包括 2 个全基因组体 chr4 scaffold_6 基因(登录号 TC424860),二是染色体 chr7 scaffold_20 基3);2 个蛋白质因子基因,一是粳稻中 Os10g0131000 蛋白质基因(登录号 CJ5Os09g0407700 蛋白质基因(登录号 TC371590);1 个延长因子基因(一个丝氨酸蛋白酶抑制剂基因(登录号 TC377686)。TaMIR5086 通过调控上能的靶基因,在介导植株响应干旱胁迫逆境中可能发挥着重要功能。表 3-1 TaMIR5086 作用的靶基因及生物学功能Table 3-1 The target genes of TaMIR5086 and their biological functionsTarget Acc.SequencelengthExpectation(E)Target Accessibility(UPE)Target Descript
【参考文献】:
期刊论文
[1]低夜温下番茄ABA缺失突变体和野生型叶片中miRNA差异表达分析[J]. 王孝,刘阳,陈海银,刘琨,齐明芳,李天来,刘玉凤. 园艺学报. 2016(12)
[2]陆地棉种子发育过程中microRNA的挖掘与功能研究[J]. Wang Gaskin,余道乾,杜雄明. 棉花学报. 2014(01)
[3]核因子Y在植物中的分类及其功能概述[J]. 李文滨,李胜畅,王志坤. 东北农业大学学报. 2012(01)
[4]植物microRNA对重金属胁迫响应的调控[J]. 丁艳菲,朱诚,王珊珊,刘海丽. 生物化学与生物物理进展. 2011(12)
[5]转录因子与植物抗逆性研究进展[J]. 刘欣,李云. 中国农学通报. 2006(04)
[6]植物转录因子的结构与调控作用[J]. 刘强,张贵友,陈受宜. 科学通报. 2000(14)
硕士论文
[1]谷子耐盐相关基因SiNF-YA5和SiATG4的功能分析及调控途径解析[D]. 黄锁.中国农业科学院 2016
[2]玉米自交系盐胁迫响应miRNA及其靶基因的鉴定研究[D]. 付蓉.南通大学 2016
本文编号:3485072
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3485072.html
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