糖尿病足溃疡相关基因与免疫细胞特征分析

发布时间：2021-12-17 22:35

　　目的·探究糖尿病足溃疡（diabetic foot ulceration,DFU）相关基因的表达以及免疫细胞的特征。方法·从GEO数据库下载基因表达数据集GSE80178,利用其中6个DFU样本及3个糖尿病足皮肤（diabetic foot skin,DFS）样本,鉴别DFU与DFS的差异表达基因（differentially expressed gene,DEG）,以基因本体论（Gene Ontology,GO）注释DEG可能涉及的生物过程及细胞成分,并利用反卷积方法计算并比较DFU、DFS及非糖尿病足部皮肤（non-diabetic foot skin,nDFS）的免疫细胞相对比例差异。结果·共获得296个DFU与DFS的DEG,包括80个上调基因和216个下调基因。GO分析发现,DEG在细胞成分上主要富集于细胞外泌体和细胞外空间;在生物过程中,DEG富集于角质形成细胞分化、角质化、中性粒细胞趋化等。DFS与nDFS比较,未发现免疫细胞比例差异;而DFU与DFS比较,DFU中活化肥大细胞、静息自然杀伤细胞、CD8⁺ T细胞、单核细胞比例增加。结论·DFU发病过... 

【文章来源】：上海交通大学学报(医学版). 2020,40(10)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

DFU、DFS和nDFS中免疫细胞的相对比例

DFU、DFS和nDFS中免疫细胞相对比例的比较

DFU和DFS之间的DEG


本文编号：3541078