基因芯片应用效果评价及耐药基因突变与治疗结局关联研究
发布时间：2022-01-05 15:28
研究背景与目的中国是全球30个结核病高负担国家之一,据WHO最新报告结果显示结核病估算新发病人数为88.9万,发病人数位于高负担国家的第二位。2017年,全球有近60万利福平耐药/耐多药患者（RR/MDR-TB）,其中MDR-TB 45.7万例,MDR-TB已成为控制结核病流行的主要难点之一。根据WHO公布数据2017年中国估算新发MDR/RR-TB患者7.3万人,仅次于印度,位居全球第二,约占到全球估算总数的13.1%。但是我国的RR/MDR-TB患者登记数只有近1万人,仅占估算数的17%,在金砖五国中排末位,中国极低的MDR-TB发现率已成为MDR-TB疫情居高不下的关键因素。传统药敏耗时较长,灵敏度和时效性较差,严重影响了 MDR-TB的早期发现。为了提高耐药诊断速度,世界卫生组织2007-2015年陆续推荐了多种基因检测技术。基因芯片技术是基于多重PCR并结合反向杂交的耐多药基因检测试剂盒,该技术能根据检测位点的突变情况快速检测出利福平与异烟肼耐药结果,并判断结核分枝杆菌耐多药情况,既往研究显示该方法的灵敏度和特异度都很高。根据国家结核病“十三五”规划要求,全国将逐步推广MDR...
【文章来源】：东南大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１?ｒｐｏＢ基因片段的ＰＣＲ扩增部分电泳图??条带从下分别为?１５００、１０００、９００、８００、７００、６００、５００、４００、３００、２００、??
ＧＧＴＣＴＧＴＣＡＣＧＴＧＡＧＣＧＴＧＣＣＧＧ＞２９７??１９８＞ＴＧＡＧＣＣＡＡＴＴＯｌＴＧＧＡＣＣＡＧＡＡＣＡＡＣＣＣＧＣＴＧＴＣＧＧＧＧＴＴＧＡＣＣＣＡＣＡＡＧＣＧＣＣＧＡａＧＴｇＧＧＣＧＣＴＧＧＧＧＣＣＣＧＧＣＧＧＴａＧＴＣＡＣＧＴＧＡＧＣＧＴＧＣＣＧＧ＞２９７??１９８＞ＴＧＡＧＣＣＡＡＴＴＣＡＴＧＧＡＣＣＡＧＡＡＣＡＡＣＣＣＧＣＴＧＴＣＧＧＧＧＴＴＧＡＣＣＣＢＣＡＡＧＣＧＣＣＧＡＣＴＧＴＣＧＧＣＧＣＴＧＧＧＧＣＣＣＧＧＣＧＧＴＣＴＧＴＣＡＣＧＴＧＡＧＣＧＴＧＣＣＧＧ＞２９７??图２－２利福平耐药基因ｒｐｏＢ的主要突变结果ＤＮＡ测序比对图??表５?利福平耐药基因ｒｐｏＢ在各位点的突变情况??ｒｐｏＢ?密码子变更氨基频数??４５９?ＣＴＧ－ＣＧＧ?ＬｅＴ－Ａｒｇ?１??４６３?ＣＡＧ－ＣＡＣ?Ｇｌｎ－ＩＩｉｓ?１??５１１?ＣＴＧ－ＣＣＧ?ＬｅＴ－Ｐｒｏ?５??５１３?ＣＡＡ－ＣＣＡ?Ｇｉｎ－Ｐｒｏ?１??ＣＡＡ－ＣＴＡ?Ｇｌｎ－ＬｅＴ?１??５１５?ＡＴＧ－ＣＴＧ?Ｍｅｔ－ＬｅＴ?１??５１６?ＧＡＣ－ＴＡＣ?Ａｓｐ－Ｔｙｒ?２??ＧＡＣ－ＧＴＣ?Ａｓｐ－Ｖａｌ?５??５２２?ＴＣＧ－ＴＴＧ?Ｓｅｒ－Ｌｅｔ?２??５２６?ＣＡＣ－ＴＡＣ?Ｉｌｉｓ－Ｔｙｒ?２??ＣＡＣ－ＡＡＣ?Ｉｌｉｓ－Ａｓｎ?３??ＣＡＣ－ＧＡＣ?Ｉｌｉｓ－Ａｓｐ?２??ＣＡＣ－ＣＧＣ?Ｉｌｉｓ－Ａｒｇ?２??ＣＡＣ－ＣＴＣ?Ｉｌｉｓ－ＬｅＴ?３??ＣＡＣ－ＣＡＧ?Ｉｌｉｓ－Ｇｌｎ?１??５３１?ＴＣＧ－ＴＴＧ?Ｓｅｒ－ＬｅＴ?４１??５３３?ＣＴＧ
?东南大领士学位论文???（２）异烟肼耐药基因测序结果??异烟肼的耐药基因谱广泛，本次仅对异烟肼的耐药基因ｋａｔＧ以及ＩｎｈＡ启动??子区域进行测序，还可对异烟肼的其他耐药基因，如ｏｘｙＲ、ｏｘｙＲ－ａｈｐＣ基因间??区等进行筛查ＰＩ??异烟肼耐药基囡ｋａｔＧ突变５０例，突变率７０．４％?（５０／７１）?ａ没有发生任意位??点的联合突变，也均为单碱基突变《突变率最高的位点是ｋａｔＧ３１５，在该位点突??变４７例（９４％，４７／５０），最重要的检测耐多药患者的高频位点（见图２－３、表６）。??异烟肼耐药基因ＩｎｈＡ突变８例，突变形式主要为ＡＣＧＩｎｈＡ－１５ＡＴＧ，其中有３??例联合ｋａｔＧ３１５突变。ｋａｔＧ与ＩｎｈＡ共检测出耐异烟肼患者５５例（７７．４６％，５５／７１?），??联合ｒｐｏＢ基国共检测出５３例耐多药患者，基囡型检测与表型耐药鉴定在异烟肼??耐药性方面的一致率达７４．６％?（见图２－４、表７）。??Ｖ?Ｋ?ｊｙ?ｊ?ＴＳ?Ｖ?Ｔｌ?Ｖ?Ｖ?Ｖ?ＩＳ??４０１?＞ＡＡＣＣＧＧＴＡＡＧＧＡＣＧＣＧＡＴＣＡＣＣ＾＾ＧＣＡＴＣＧＡＧＧＴＣＧＴＡＴＧＧＡＣＧＡＡＣＡＣＣＣＣＧＡＣＧＡａＡＴＧＧＧＡＣＡＡＣＡＧＴＴＴＣＣＴＣＧＡＧＡＴＣＣＴＧＴＡＣ??８７＜ＡＡＣＣＧＧＴＡＡＧＧＡＣＧＣＧＡＴＣＡＣＣＡｇｃＧＧＣＡＴＣＧＡＧＧＴＣＧＴＡＴＧＧＡＣＧＡＡＣＡＣＣＣＣＧＡＣＧＡＡＡＴＧＧＧＡＣＡＡＣＡＧＴＴＴＣＣＴＣＧＡＧＡＴＣＣＴ???８６＜ＡＡＣＣＧＧＴＡＡＧＧＡＣＧＣＧＡＴＣＡＣＧ？ＣＧＧａｉＴＣＧＡＧＧＴＣＧＴＡＴＧＧＡＣＧＡＡＣＡＣＣＣＣＧＡＣＧＡＡＡＴＧＧＧＡＣＡＡＣＡＧＴＴＴＣＣＴＣＧｆｔＧ
【参考文献】：
期刊论文
[1]基因芯片技术检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药性临床应用评价[J]. 许榕青,李丹,林银霞,黄明翔,陈新朝. 中国人兽共患病学报. 2017(01)
[2]耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因突变特征分析[J]. 孟庆琳,王玉峰,逄宇,赵雁林. 中国防痨杂志. 2016 (02)
[3]我国耐多药结核病控制策略概述[J]. 徐彩红,王黎霞,李仁忠,阮云洲,苏伟,富韵婷,陈明亭. 中国防痨杂志. 2015 (11)
[4]结核分枝杆菌对抗结核药物耐受机制的研究进展[J]. 张俊仙,吴雪琼. 中国防痨杂志. 2015 (11)
[5]复治耐多药肺结核患者临床治疗效果分析[J]. 陶满意,张雷,杜凤华,李玉勤. 安徽医学. 2014(03)
[6]基因芯片结核分枝杆菌耐多药检测在地市级实验室的应用性评估[J]. 赵冰,时金艳,逄宇,夏辉,李强,欧喜超,宋媛媛,王玉峰,池俊英,赵雁林. 中国防痨杂志. 2013(09)
[7]基因芯片检测技术检测结核分枝杆菌异烟肼和利福平耐药的实际应用效果评价[J]. 李卫彬,李新旭,张彤群,屈亚虹,马振亚,李仁忠. 中华临床医师杂志(电子版). 2012(16)
[8]结核分枝杆菌对异烟肼和利福平的耐药水平与其耐药基因突变的相关性研究[J]. 李桂莲,张敬蕊,赵秀芹,杨骜,连璐璐,万康林. 中国防痨杂志. 2012(06)
[9]基因芯片诊断耐多药结核病的临床多中心研究[J]. 周杨,欧喜超,乐军,谭耀驹,王胜芬,逄宇,李强,姜广路,赵冰,赵雁林. 中华检验医学杂志. 2011 (09)
[10]结核分枝杆菌耐药分子机制及耐药基因检测方法研究进展[J]. 李国利. 中国医师杂志. 2002(04)
博士论文
[1]武汉地区结核分枝杆菌药物敏感性及氟喹诺酮耐药分子机制研究[D]. 陈军.华中科技大学 2011
硕士论文
[1]耐药结核快速诊断方法评价及治疗效果分析[D]. 丰燕.南京医科大学 2014
本文编号：3570599
【文章来源】：东南大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１?ｒｐｏＢ基因片段的ＰＣＲ扩增部分电泳图??条带从下分别为?１５００、１０００、９００、８００、７００、６００、５００、４００、３００、２００、??
ＧＧＴＣＴＧＴＣＡＣＧＴＧＡＧＣＧＴＧＣＣＧＧ＞２９７??１９８＞ＴＧＡＧＣＣＡＡＴＴＯｌＴＧＧＡＣＣＡＧＡＡＣＡＡＣＣＣＧＣＴＧＴＣＧＧＧＧＴＴＧＡＣＣＣＡＣＡＡＧＣＧＣＣＧＡａＧＴｇＧＧＣＧＣＴＧＧＧＧＣＣＣＧＧＣＧＧＴａＧＴＣＡＣＧＴＧＡＧＣＧＴＧＣＣＧＧ＞２９７??１９８＞ＴＧＡＧＣＣＡＡＴＴＣＡＴＧＧＡＣＣＡＧＡＡＣＡＡＣＣＣＧＣＴＧＴＣＧＧＧＧＴＴＧＡＣＣＣＢＣＡＡＧＣＧＣＣＧＡＣＴＧＴＣＧＧＣＧＣＴＧＧＧＧＣＣＣＧＧＣＧＧＴＣＴＧＴＣＡＣＧＴＧＡＧＣＧＴＧＣＣＧＧ＞２９７??图２－２利福平耐药基因ｒｐｏＢ的主要突变结果ＤＮＡ测序比对图??表５?利福平耐药基因ｒｐｏＢ在各位点的突变情况??ｒｐｏＢ?密码子变更氨基频数??４５９?ＣＴＧ－ＣＧＧ?ＬｅＴ－Ａｒｇ?１??４６３?ＣＡＧ－ＣＡＣ?Ｇｌｎ－ＩＩｉｓ?１??５１１?ＣＴＧ－ＣＣＧ?ＬｅＴ－Ｐｒｏ?５??５１３?ＣＡＡ－ＣＣＡ?Ｇｉｎ－Ｐｒｏ?１??ＣＡＡ－ＣＴＡ?Ｇｌｎ－ＬｅＴ?１??５１５?ＡＴＧ－ＣＴＧ?Ｍｅｔ－ＬｅＴ?１??５１６?ＧＡＣ－ＴＡＣ?Ａｓｐ－Ｔｙｒ?２??ＧＡＣ－ＧＴＣ?Ａｓｐ－Ｖａｌ?５??５２２?ＴＣＧ－ＴＴＧ?Ｓｅｒ－Ｌｅｔ?２??５２６?ＣＡＣ－ＴＡＣ?Ｉｌｉｓ－Ｔｙｒ?２??ＣＡＣ－ＡＡＣ?Ｉｌｉｓ－Ａｓｎ?３??ＣＡＣ－ＧＡＣ?Ｉｌｉｓ－Ａｓｐ?２??ＣＡＣ－ＣＧＣ?Ｉｌｉｓ－Ａｒｇ?２??ＣＡＣ－ＣＴＣ?Ｉｌｉｓ－ＬｅＴ?３??ＣＡＣ－ＣＡＧ?Ｉｌｉｓ－Ｇｌｎ?１??５３１?ＴＣＧ－ＴＴＧ?Ｓｅｒ－ＬｅＴ?４１??５３３?ＣＴＧ
?东南大领士学位论文???（２）异烟肼耐药基因测序结果??异烟肼的耐药基因谱广泛，本次仅对异烟肼的耐药基因ｋａｔＧ以及ＩｎｈＡ启动??子区域进行测序，还可对异烟肼的其他耐药基因，如ｏｘｙＲ、ｏｘｙＲ－ａｈｐＣ基因间??区等进行筛查ＰＩ??异烟肼耐药基囡ｋａｔＧ突变５０例，突变率７０．４％?（５０／７１）?ａ没有发生任意位??点的联合突变，也均为单碱基突变《突变率最高的位点是ｋａｔＧ３１５，在该位点突??变４７例（９４％，４７／５０），最重要的检测耐多药患者的高频位点（见图２－３、表６）。??异烟肼耐药基因ＩｎｈＡ突变８例，突变形式主要为ＡＣＧＩｎｈＡ－１５ＡＴＧ，其中有３??例联合ｋａｔＧ３１５突变。ｋａｔＧ与ＩｎｈＡ共检测出耐异烟肼患者５５例（７７．４６％，５５／７１?），??联合ｒｐｏＢ基国共检测出５３例耐多药患者，基囡型检测与表型耐药鉴定在异烟肼??耐药性方面的一致率达７４．６％?（见图２－４、表７）。??Ｖ?Ｋ?ｊｙ?ｊ?ＴＳ?Ｖ?Ｔｌ?Ｖ?Ｖ?Ｖ?ＩＳ??４０１?＞ＡＡＣＣＧＧＴＡＡＧＧＡＣＧＣＧＡＴＣＡＣＣ＾＾ＧＣＡＴＣＧＡＧＧＴＣＧＴＡＴＧＧＡＣＧＡＡＣＡＣＣＣＣＧＡＣＧＡａＡＴＧＧＧＡＣＡＡＣＡＧＴＴＴＣＣＴＣＧＡＧＡＴＣＣＴＧＴＡＣ??８７＜ＡＡＣＣＧＧＴＡＡＧＧＡＣＧＣＧＡＴＣＡＣＣＡｇｃＧＧＣＡＴＣＧＡＧＧＴＣＧＴＡＴＧＧＡＣＧＡＡＣＡＣＣＣＣＧＡＣＧＡＡＡＴＧＧＧＡＣＡＡＣＡＧＴＴＴＣＣＴＣＧＡＧＡＴＣＣＴ???８６＜ＡＡＣＣＧＧＴＡＡＧＧＡＣＧＣＧＡＴＣＡＣＧ？ＣＧＧａｉＴＣＧＡＧＧＴＣＧＴＡＴＧＧＡＣＧＡＡＣＡＣＣＣＣＧＡＣＧＡＡＡＴＧＧＧＡＣＡＡＣＡＧＴＴＴＣＣＴＣＧｆｔＧ
【参考文献】：
期刊论文
[1]基因芯片技术检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药性临床应用评价[J]. 许榕青,李丹,林银霞,黄明翔,陈新朝. 中国人兽共患病学报. 2017(01)
[2]耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因突变特征分析[J]. 孟庆琳,王玉峰,逄宇,赵雁林. 中国防痨杂志. 2016 (02)
[3]我国耐多药结核病控制策略概述[J]. 徐彩红,王黎霞,李仁忠,阮云洲,苏伟,富韵婷,陈明亭. 中国防痨杂志. 2015 (11)
[4]结核分枝杆菌对抗结核药物耐受机制的研究进展[J]. 张俊仙,吴雪琼. 中国防痨杂志. 2015 (11)
[5]复治耐多药肺结核患者临床治疗效果分析[J]. 陶满意,张雷,杜凤华,李玉勤. 安徽医学. 2014(03)
[6]基因芯片结核分枝杆菌耐多药检测在地市级实验室的应用性评估[J]. 赵冰,时金艳,逄宇,夏辉,李强,欧喜超,宋媛媛,王玉峰,池俊英,赵雁林. 中国防痨杂志. 2013(09)
[7]基因芯片检测技术检测结核分枝杆菌异烟肼和利福平耐药的实际应用效果评价[J]. 李卫彬,李新旭,张彤群,屈亚虹,马振亚,李仁忠. 中华临床医师杂志(电子版). 2012(16)
[8]结核分枝杆菌对异烟肼和利福平的耐药水平与其耐药基因突变的相关性研究[J]. 李桂莲,张敬蕊,赵秀芹,杨骜,连璐璐,万康林. 中国防痨杂志. 2012(06)
[9]基因芯片诊断耐多药结核病的临床多中心研究[J]. 周杨,欧喜超,乐军,谭耀驹,王胜芬,逄宇,李强,姜广路,赵冰,赵雁林. 中华检验医学杂志. 2011 (09)
[10]结核分枝杆菌耐药分子机制及耐药基因检测方法研究进展[J]. 李国利. 中国医师杂志. 2002(04)
博士论文
[1]武汉地区结核分枝杆菌药物敏感性及氟喹诺酮耐药分子机制研究[D]. 陈军.华中科技大学 2011
硕士论文
[1]耐药结核快速诊断方法评价及治疗效果分析[D]. 丰燕.南京医科大学 2014
本文编号：3570599
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3570599.html
最近更新
教材专著
