DDR2基因启动子区DNA甲基化修饰对乳腺癌细胞的作用研究
发布时间：2022-01-10 03:43
DNA甲基化是重要的表观遗传修饰方式,参与细胞分化、早期胚胎发育、基因组印记、X染色体失活以及肿瘤发生等过程的调控。研究表明异常DNA甲基化使得相关基因表达失调,与肿瘤的发生发展密切相关。因此鉴定肿瘤细胞的异常DNA甲基化变化,并针对性地进行调节将有利于肿瘤的诊断和治疗。本研究利用RNA-seq数据筛选和验证乳腺癌相关基因,检测候选基因与DNA甲基化修饰的相关性,并探讨了利用CRISPR/dCas9技术对DDR2基因启动子区进行甲基化编辑后对基因表达及肿瘤恶性表型的影响。1.不同乳腺癌细胞系中DNA甲基化对基因表达的调节本研究首先利用源于NCBI数据库的RNA-seq数据分别分析了乳腺癌细胞系MCF7、HS578T与乳腺上皮细胞系MCF10A的差异基因,求交集后得出62个共同差异基因,根据已有文献报道筛选出10个与乳腺癌发生相关的基因并进行验证,qPCR结果显示与RNA-seq数据趋势一致。在选择的10个基因中,DDR2对乳腺癌迁移与侵袭具有重要作用,本研究进一步检测了不同乳腺癌细胞系MCF7、HS578T与BCAP37中DDR2基因表达。结果表明,三种乳腺癌细胞中DDR2 mRNA与...
【文章来源】：内蒙古大学内蒙古自治区 211工程院校
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
RNA-seq数据分析
图 2.2 不同乳腺癌细胞系 DDR2 基因的 mRNA 与蛋白水平显著大于乳腺上皮细胞（p<0.05）。A. mRNA 表达。B.蛋白表达。g.2.2 The mRNA and protein levels of DDR2 gene in different breast cancer cell lines were significantly hithan those in breast epithelial cells（p<0.05）.A. mRNA expression. B. protein expression.2.2 DDR2 基因在不同乳腺癌细胞系的甲基化程度为检测 DNA 甲基化与 DDR2 基因表达的关系，本研究利用亚硫酸氢盐测序方法对 DD因启动子区甲基化进行分析。结果表明，不同乳腺癌细胞系的 DDR2 基因 DNA 甲基化显著低于乳腺上皮细胞（p<0.05），其中三阴性乳腺癌细胞系 HS578T 的 DDR2 基因位于未甲基化状态（图 2.3 C）。结合 DDR2 基因的 mRNA 及蛋白表达分析，可得出 DD因的表达与其基因启动子区 DNA 甲基化负相关。图 2.3 A 是 DDR2 基因 PCR 结果，该长 196 bp，PCR 最适退火温度为 59℃。图 2.3 B 是对转化结果进行验证，10 个白斑的目带（红色标注）均大于蓝斑，说明转化成功，均可送测序。
图 2.3 不同乳腺癌细胞系的 DDR2 基因甲基化程度显著小于乳腺上皮细胞（p<0.05）。A. DDR2 基因的 PCR 结果。B.转化结果验证。C.甲基化程度。Fig.2.3 The methylation level of DDR2 gene in different breast cancer cell lineswas significantly lower than that in breast epithelial cells (p<0.05).A. PCR results of DDR2 gene. B. Transformation result verification. C. Methylation level.
本文编号：3579988
【文章来源】：内蒙古大学内蒙古自治区 211工程院校
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
RNA-seq数据分析
图 2.2 不同乳腺癌细胞系 DDR2 基因的 mRNA 与蛋白水平显著大于乳腺上皮细胞（p<0.05）。A. mRNA 表达。B.蛋白表达。g.2.2 The mRNA and protein levels of DDR2 gene in different breast cancer cell lines were significantly hithan those in breast epithelial cells（p<0.05）.A. mRNA expression. B. protein expression.2.2 DDR2 基因在不同乳腺癌细胞系的甲基化程度为检测 DNA 甲基化与 DDR2 基因表达的关系，本研究利用亚硫酸氢盐测序方法对 DD因启动子区甲基化进行分析。结果表明，不同乳腺癌细胞系的 DDR2 基因 DNA 甲基化显著低于乳腺上皮细胞（p<0.05），其中三阴性乳腺癌细胞系 HS578T 的 DDR2 基因位于未甲基化状态（图 2.3 C）。结合 DDR2 基因的 mRNA 及蛋白表达分析，可得出 DD因的表达与其基因启动子区 DNA 甲基化负相关。图 2.3 A 是 DDR2 基因 PCR 结果，该长 196 bp，PCR 最适退火温度为 59℃。图 2.3 B 是对转化结果进行验证，10 个白斑的目带（红色标注）均大于蓝斑，说明转化成功，均可送测序。
图 2.3 不同乳腺癌细胞系的 DDR2 基因甲基化程度显著小于乳腺上皮细胞（p<0.05）。A. DDR2 基因的 PCR 结果。B.转化结果验证。C.甲基化程度。Fig.2.3 The methylation level of DDR2 gene in different breast cancer cell lineswas significantly lower than that in breast epithelial cells (p<0.05).A. PCR results of DDR2 gene. B. Transformation result verification. C. Methylation level.
本文编号：3579988
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3579988.html
最近更新
教材专著
