细粒棘球绦虫3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因的克隆及在其不同阶段的差异表达和生物信息学分析

发布时间：2022-01-12 03:55

　　目的研究细粒棘球绦虫3-羟基酰基-CoA脱氢酶分子特性及其在细粒棘球绦虫不同发育阶段的表达差异。方法通过分析细粒棘球绦虫原头蚴高通量转录组测序文库对Unigene进行KEGG通路分析,筛选出一个脂肪酸代谢酶通路及该通路的一个主要调控基因3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因。PCR扩增3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因,分析其核苷酸序列及其编码蛋白的结构和功能;通过实时荧光定量PCR分析虫体的原头蚴、成虫发育阶段的mRNA的转录情况。结果细粒棘球绦虫3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因具有完整的开放阅读框,cDNA全长为822bp,编码274个氨基酸。生物信息学预测3-羟基酰基-CoA脱氢酶蛋白质的相对分子质量及等电点分别为32.98×105和8.87。该蛋白无跨膜螺旋区,具有亲水性,且具有多个潜在的优势抗原表位。氨基酸序列多重比对分析显示其与多房棘球绦虫亲缘关系较近。实时荧光定量PCR检测对该基因在原头蚴和成虫期均有表达,以成虫阶段表达量更高。结论细粒棘球绦虫3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因在原头蚴和成虫期高表达,其编码蛋白具有潜在的优势抗原表位该基因可作为细粒棘球绦虫终末宿主抗原候选基因。 

【文章来源】：中国病原生物学杂志. 2020,15(11)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

3-羟基酰基-CoA脱氢酶CDNA PCR扩增

利用NCBI的Conserved Domain和在线网站（ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/）预测3-羟基酰基-CoA脱氢酶蛋白含有保守结构域，具有完整的开放阅读框，属于腺嘌呤黄素家族（图2）。图3 3-羟基酰基-CoA脱氢酶蛋白质的二级结构预测

3-羟基酰基-CoA脱氢酶蛋白质的二级结构预测

【参考文献】：
期刊论文
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[3]棘球蚴(包虫)病预防疫苗的研制与应用[J]. 张文宝,张壮志,郑雪婷,李军.  中国人兽共患病学报. 2018(09)
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[7]新疆北部地区囊型包虫病的流行现状[J]. 柴君杰,焦伟,伊斯拉音,常青,孟贺巴特,付承,韩玲玲,徐世东,孙立峰,白国琦,赛力克,马合木提,多鲁肯,薛海筹,冯正.  热带病与寄生虫学. 2004(03)

博士论文
[1]线虫脂肪酸代谢与性别决定研究[D]. 唐鸿云.浙江大学 2014

硕士论文
[1]地塞米松对弓形虫RH株增殖及宿主与弓形虫多不饱和脂肪酸代谢的影响[D]. 张爽.重庆医科大学 2017
[2]细粒棘球绦虫不同发育阶段表达谱的差异分析及特异性诊断抗原筛选的研究[D]. 赵殷奇.宁夏医科大学 2016



本文编号：3584051