利用CRISPR/Cas9技术获得水稻恢复系Bsr-d1基因突变体
发布时间:2022-01-15 23:06
为研究水稻抗稻瘟病基因Bsr-d1在杂交水稻恢复系中的功能,我们利用CRISPR/Cas9定点基因编辑方法,设计2个敲除靶标位点,构建了Bsr-d1基因编辑载体,并通过农杆菌介导的方法转化水稻恢复系品种‘GH998’,成功获得了转基因植株,并在T1代筛选到4个无转基因成分的纯合突变株系。纯合突变株系有4种突变类型,包括第199号碱基处缺失17个碱基、第212号碱基处缺失4个碱基、第216号碱基处插入1个碱基、第216号碱基处插入2个碱基突变类型。通过蛋白序列分析,发现纯合突变株系都存在移码现象导致氨基酸变化并提前终止翻译。本研究成功利用CRISPR/Cas9基因编辑方法敲除水稻恢复系‘GH998’中Bsr-d1基因,获得无转基因成分的纯合突变株系,为进一步研究Bsr-d1基因在杂交水稻上的功能提供了理论依据和品种资源。
【文章来源】:分子植物育种. 2020,18(16)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
Bsr-d1基因结构及g RNA靶点位置
将携带Bsr-d1基因2个靶标的表达载体CRIS-PR-Cas9-BSRD1通过农杆菌转化恢复系籼稻‘GH9-98’后,共获得22株T0代转基因株系。用抗潮霉素基因引物Hyg-F/Hyg-R检测以筛选转基因阳性植株。结果发现22株T0代转基因植株都带有抗性基因,阳性率为100%。为了分析‘GH998’中Bsr-d1基因的突变情况,用引物BSRD1-F/BSRD1-R扩增基因,并对PCR产物进行测序分析。测序结果表明,有13株阳性转基因苗在靶标2处发生了突变,突变率为59.1%,其中有4株为纯合突变,占30.8%,9株为杂合突变,占69.2%;而在靶标1处没有检测到有突变的植株。靶标2处的突变基因型包括纯合突变和杂合突变,突变类型包括碱基插入和缺失,以碱基缺失为主,占61.5%(表2)。
为了分析‘GH998’中Bsr-d1基因的突变情况,用引物BSRD1-F/BSRD1-R扩增基因,并对PCR产物进行测序分析。测序结果表明,有13株阳性转基因苗在靶标2处发生了突变,突变率为59.1%,其中有4株为纯合突变,占30.8%,9株为杂合突变,占69.2%;而在靶标1处没有检测到有突变的植株。靶标2处的突变基因型包括纯合突变和杂合突变,突变类型包括碱基插入和缺失,以碱基缺失为主,占61.5%(表2)。图4 重组质粒CRISPR-Cas9-BSRD1的PCR验证
【参考文献】:
期刊论文
[1]利用CRISPR/Cas9系统定向改良水稻稻瘟病抗性[J]. 徐鹏,王宏,涂燃冉,刘群恩,吴玮勋,傅秀民,曹立勇,沈希宏. 中国水稻科学. 2019(04)
[2]Production of Two Elite Glutinous Rice Varieties by Editing Wx Gene[J]. FEI Yunyan,YANG Jie,WANG Fangquan,FAN Fangjun,LI Wenqi,WANG Jun,XU Yang,ZHU Jinyan,ZHONG Weigong. Rice Science. 2019(02)
[3]水稻稻瘟病抗性基因Bsr-d1功能标记的开发和利用[J]. 王军,赵婕宇,许扬,范方军,朱金燕,李文奇,王芳权,费云燕,仲维功,杨杰. 作物学报. 2018(11)
[4]水稻“抗癌”新因子bsr-d1[J]. 李伟滔,朱紫薇,尹俊杰,贺闽,王静,朱孝波,陈学伟. 自然杂志. 2018(02)
[5]基于CRISPR/Cas9技术的水稻pi21基因编辑材料的创制及稻瘟病抗性鉴定[J]. 杨海河,毕冬玲,张玉,邹小维,高晓庆,袁正杰,曲海艳,何海燕,瞿绍洪. 分子植物育种. 2017(11)
[6]利用CRISPR-Cas9基因编辑技术获得水稻OsYUCCA1基因突变体[J]. 何先畅,黄国强,王道洋,常淑伟,张大兵. 基因组学与应用生物学. 2017(11)
[7]利用CRISPR/Cas9技术敲除水稻Pi21基因的效率分析[J]. 王芳权,范方军,李文奇,朱金燕,王军,仲维功,杨杰. 中国水稻科学. 2016(05)
[8]基于CRISPR/Cas9技术的水稻千粒重基因tgw6突变体的创建[J]. 王加峰,郑才敏,刘维,罗文龙,王慧,陈志强,郭涛. 作物学报. 2016(08)
[9]CRISPR/Cas系统在植物基因组编辑中的应用[J]. 瞿礼嘉,郭冬姝,张金喆,秦跟基. 生命科学. 2015(01)
本文编号:3591483
【文章来源】:分子植物育种. 2020,18(16)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
Bsr-d1基因结构及g RNA靶点位置
将携带Bsr-d1基因2个靶标的表达载体CRIS-PR-Cas9-BSRD1通过农杆菌转化恢复系籼稻‘GH9-98’后,共获得22株T0代转基因株系。用抗潮霉素基因引物Hyg-F/Hyg-R检测以筛选转基因阳性植株。结果发现22株T0代转基因植株都带有抗性基因,阳性率为100%。为了分析‘GH998’中Bsr-d1基因的突变情况,用引物BSRD1-F/BSRD1-R扩增基因,并对PCR产物进行测序分析。测序结果表明,有13株阳性转基因苗在靶标2处发生了突变,突变率为59.1%,其中有4株为纯合突变,占30.8%,9株为杂合突变,占69.2%;而在靶标1处没有检测到有突变的植株。靶标2处的突变基因型包括纯合突变和杂合突变,突变类型包括碱基插入和缺失,以碱基缺失为主,占61.5%(表2)。
为了分析‘GH998’中Bsr-d1基因的突变情况,用引物BSRD1-F/BSRD1-R扩增基因,并对PCR产物进行测序分析。测序结果表明,有13株阳性转基因苗在靶标2处发生了突变,突变率为59.1%,其中有4株为纯合突变,占30.8%,9株为杂合突变,占69.2%;而在靶标1处没有检测到有突变的植株。靶标2处的突变基因型包括纯合突变和杂合突变,突变类型包括碱基插入和缺失,以碱基缺失为主,占61.5%(表2)。图4 重组质粒CRISPR-Cas9-BSRD1的PCR验证
【参考文献】:
期刊论文
[1]利用CRISPR/Cas9系统定向改良水稻稻瘟病抗性[J]. 徐鹏,王宏,涂燃冉,刘群恩,吴玮勋,傅秀民,曹立勇,沈希宏. 中国水稻科学. 2019(04)
[2]Production of Two Elite Glutinous Rice Varieties by Editing Wx Gene[J]. FEI Yunyan,YANG Jie,WANG Fangquan,FAN Fangjun,LI Wenqi,WANG Jun,XU Yang,ZHU Jinyan,ZHONG Weigong. Rice Science. 2019(02)
[3]水稻稻瘟病抗性基因Bsr-d1功能标记的开发和利用[J]. 王军,赵婕宇,许扬,范方军,朱金燕,李文奇,王芳权,费云燕,仲维功,杨杰. 作物学报. 2018(11)
[4]水稻“抗癌”新因子bsr-d1[J]. 李伟滔,朱紫薇,尹俊杰,贺闽,王静,朱孝波,陈学伟. 自然杂志. 2018(02)
[5]基于CRISPR/Cas9技术的水稻pi21基因编辑材料的创制及稻瘟病抗性鉴定[J]. 杨海河,毕冬玲,张玉,邹小维,高晓庆,袁正杰,曲海艳,何海燕,瞿绍洪. 分子植物育种. 2017(11)
[6]利用CRISPR-Cas9基因编辑技术获得水稻OsYUCCA1基因突变体[J]. 何先畅,黄国强,王道洋,常淑伟,张大兵. 基因组学与应用生物学. 2017(11)
[7]利用CRISPR/Cas9技术敲除水稻Pi21基因的效率分析[J]. 王芳权,范方军,李文奇,朱金燕,王军,仲维功,杨杰. 中国水稻科学. 2016(05)
[8]基于CRISPR/Cas9技术的水稻千粒重基因tgw6突变体的创建[J]. 王加峰,郑才敏,刘维,罗文龙,王慧,陈志强,郭涛. 作物学报. 2016(08)
[9]CRISPR/Cas系统在植物基因组编辑中的应用[J]. 瞿礼嘉,郭冬姝,张金喆,秦跟基. 生命科学. 2015(01)
本文编号:3591483
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3591483.html
最近更新
教材专著