星豹蛛细胞色素CYP3001U15基因克隆与生物信息学分析

发布时间：2022-01-17 07:50

　　星豹蛛是农业害虫的重要捕食性天敌。通过转录组测序鉴定出66条星豹蛛细胞色素P450基因,进一步筛选分析出5条基因,预测其与外源物质代谢有关。为进一步研究星豹蛛细胞色素P450功能和代谢机制,选取其中一条基因进行生物信息学研究。试验通过RT-PCR扩增技术,将星豹蛛总RNA反转录cDNA,后以此为模板进行PCR扩增,回收纯化产物完成单克隆并测序,获取该基因序列信息,并对其进行生物信息学分析。结果发现,克隆到CYP3001U15基因ORF序列,该基因开放阅读框为1 074 bp,编码357个氨基酸,分子质量为42 ku,等电点为5.91,原子总数为5 808,分子式为C₁₈₇₇H₂₈₉₆N₄₉₄O₅₃₁S₁₀;正电荷残基47个,占氨基酸总数的13.2%,负电荷残基52个,占氨基酸总数的14.6%;蛋白的二级结构预测结果显示,α螺旋占47.62%,β折叠占8.96%,β转角占4.76%,无规则卷曲占38.66%;亚细胞定位预测结果显示,其定位在细胞内质网上;蛋白信号肽预测结果显示,该... 

【文章来源】：山西农业科学. 2020,48(06)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 试验材料
    1.2 主要试剂
    1.3 试验方法
        1.3.1 星豹蛛总RNA的提取及c DNA的合成
        1.3.2 CYP3001U15基因克隆
        1.3.3 CYP3001U15基因及其编码产物的生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 CYP3001U15基因克隆
    2.2 CYP3001U15编码的蛋白理化性质分析
    2.3 CYP3001U15跨膜预测、信号肽和亚细胞定位分析
    2.4 CYP3001U15编码的蛋白二级结构预测分析
    2.5 CYP3001U15编码的蛋白三级结构预测
    2.6 CYP3001U15基因编码蛋白与其他蛛形纲物种系统发育树分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
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[3]昆虫细胞色素P450抑制剂及杀虫剂面临的挑战与机遇[J]. 筱禾.  世界农药. 2015(06)
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博士论文
[1]柑橘全爪螨细胞色素P450及其相关基因的鉴定和表达模式研究[D]. 丁天波.西南大学 2014
[2]飞蝗细胞色素P450基因的分子特性及功能研究[D]. 郭艳琼.山西大学 2012

硕士论文
[1]莲草直胸跳甲细胞色素P450的生物信息学分析[D]. 李鑫.山西农业大学 2018
[2]甘蓝夜蛾细胞色素P450基因的克隆及功能分析[D]. 周夏.东北农业大学 2015
[3]飞蝗三个P450基因的分子特性及功能分析[D]. 于荣荣.山西大学 2012



本文编号：3594344