黄毛草莓FnMYB24转录因子基因和启动子的克隆及表达分析
发布时间:2022-01-24 05:23
该研究以黄毛草莓(Fragaria nilgerrensis Schltdl.)为材料,采用RT-PCR技术克隆了黄毛草莓FnMYB24基因的cDNA和启动子序列。生物信息学分析表明,FnMYB24的cDNA序列长为1 033 bp(GenBank登录号为MN879283),其开放阅读框(ORF)长为609 bp,编码202个氨基酸,含有1个保守的MYBDNA-binding结构域。同源分析结果显示,黄毛草莓FnMYB24基因编码的氨基酸序列与森林草莓(Fragaria vesca)编码的氨基酸相似性较高;同时进一步克隆了该基因编码起始位点上游长度为718 bp启动子序列(GenBank登录号为MN879285),预测该序列包含激素响应元件、光调控元件等多个顺式作用元件。通过构建pFnMYB24∷GUS表达载体进行烟草瞬时转化,发现pFnMYB24启动子具有转录活性且能够驱动FnMYB24基因表达。实时荧光定量PCR结果显示:抗病品种黄毛草莓和易感病栽培品种‘妙香3号’的叶片接种胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)后MYB24...
【文章来源】:西北植物学报. 2020,40(10)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
黄毛草莓FnMYB24基因的PCR扩增及检测
从黄毛草莓中克隆并测序了FnMYB24的上游718 bp的启动子序列(图5),命名为pFnMYB24(GenBank登录号为MN879285),利用PlantCare在线软件对启动子的顺式作用元件进行预测(图6),结果显示:FnMYB24启动子基因组序列上除TATA-box(转录起始-30核心启动子元件)、CAAT-box(启动子和增强子区的一般顺式作用元件)等基本顺式作用元件之外,还存在逆境诱导位点的TCA元件、应激反应元件STRE、参与光反应的G-Box元件以及参与损伤与防御反应元件WRE3。这些元件的存在表明黄毛草莓FnMYB24启动子可能响应多种生物及非生物胁迫。图4 黄毛草莓FnMYB24氨基酸序列和其他植物
黄毛草莓FnMYB24氨基酸序列和其他植物
【参考文献】:
期刊论文
[1]黄毛草莓编码NB-ARC结构域的FnCN基因和启动子克隆及FnCN基因表达分析[J]. 胡玉慈,姚立萍,张童,何淑敏,唐鑫彪,陈清西,文志丰. 植物资源与环境学报. 2020(04)
[2]柑橘R2R3-MYB类转录因子CitMYB20的克隆与表达分析[J]. 范海芳,彭蕴,张庆雯,何永睿,邹修平,李强,彭爱红,许兰珍,雷天刚,陈善春,姚利晓. 分子植物育种. 2019(10)
[3]马铃薯R2R3-MYB转录因子的克隆及植物表达载体的构建[J]. 杨奕琦,徐佳妮,秦玉芝,熊兴耀,周倩. 分子植物育种. 2018(18)
[4]黄毛草莓和五叶草莓的耐热性及其对高温的响应[J]. 郭玲玲,李钧敏,闫明. 江苏农业科学. 2018(09)
[5]水杨酸对草莓炭疽病响应基因FaNBS20表达的影响[J]. 张庆雨,刘芳春,段可,王飞,王延秀,高清华. 园艺学报. 2014(01)
[6]华东葡萄抗白粉病VpMYBR1基因表达与功能分析[J]. 侯鸿敏,王浩,殷向静,闫琴,王跃进,王西平. 中国农业科学. 2013(07)
[7]MYB转录因子在植物抗逆胁迫中的作用及其分子机理[J]. 刘蕾,杜海,唐晓凤,吴燕民,黄玉碧,唐益雄. 遗传. 2008(10)
[8]中国草莓属(Fragaria)植物的分类研究[J]. 雷家军,代汉萍,谭昌华,邓明琴,赵密珍,钱亚明. 园艺学报. 2006(01)
博士论文
[1]拟南芥转录因子MYB73抗核盘菌的分子机制研究[D]. 贾娇.河北农业大学 2012
硕士论文
[1]小麦MYB转录因子TaMYB86和TaRIM1的分子特征与防御功能分析[D]. 单天雷.中国农业科学院 2016
[2]转录因子AtMYB44促进拟南芥抗病耐热及抑制开花的作用[D]. 田双梅.南京农业大学 2012
[3]中国草莓属野生资源及白草莓育种初探[D]. 明晓.北京林业大学 2012
[4]野生草莓种质资源对胶孢炭疽菌的抗性研究[D]. 黄金凤.南京农业大学 2012
本文编号:3605941
【文章来源】:西北植物学报. 2020,40(10)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
黄毛草莓FnMYB24基因的PCR扩增及检测
从黄毛草莓中克隆并测序了FnMYB24的上游718 bp的启动子序列(图5),命名为pFnMYB24(GenBank登录号为MN879285),利用PlantCare在线软件对启动子的顺式作用元件进行预测(图6),结果显示:FnMYB24启动子基因组序列上除TATA-box(转录起始-30核心启动子元件)、CAAT-box(启动子和增强子区的一般顺式作用元件)等基本顺式作用元件之外,还存在逆境诱导位点的TCA元件、应激反应元件STRE、参与光反应的G-Box元件以及参与损伤与防御反应元件WRE3。这些元件的存在表明黄毛草莓FnMYB24启动子可能响应多种生物及非生物胁迫。图4 黄毛草莓FnMYB24氨基酸序列和其他植物
黄毛草莓FnMYB24氨基酸序列和其他植物
【参考文献】:
期刊论文
[1]黄毛草莓编码NB-ARC结构域的FnCN基因和启动子克隆及FnCN基因表达分析[J]. 胡玉慈,姚立萍,张童,何淑敏,唐鑫彪,陈清西,文志丰. 植物资源与环境学报. 2020(04)
[2]柑橘R2R3-MYB类转录因子CitMYB20的克隆与表达分析[J]. 范海芳,彭蕴,张庆雯,何永睿,邹修平,李强,彭爱红,许兰珍,雷天刚,陈善春,姚利晓. 分子植物育种. 2019(10)
[3]马铃薯R2R3-MYB转录因子的克隆及植物表达载体的构建[J]. 杨奕琦,徐佳妮,秦玉芝,熊兴耀,周倩. 分子植物育种. 2018(18)
[4]黄毛草莓和五叶草莓的耐热性及其对高温的响应[J]. 郭玲玲,李钧敏,闫明. 江苏农业科学. 2018(09)
[5]水杨酸对草莓炭疽病响应基因FaNBS20表达的影响[J]. 张庆雨,刘芳春,段可,王飞,王延秀,高清华. 园艺学报. 2014(01)
[6]华东葡萄抗白粉病VpMYBR1基因表达与功能分析[J]. 侯鸿敏,王浩,殷向静,闫琴,王跃进,王西平. 中国农业科学. 2013(07)
[7]MYB转录因子在植物抗逆胁迫中的作用及其分子机理[J]. 刘蕾,杜海,唐晓凤,吴燕民,黄玉碧,唐益雄. 遗传. 2008(10)
[8]中国草莓属(Fragaria)植物的分类研究[J]. 雷家军,代汉萍,谭昌华,邓明琴,赵密珍,钱亚明. 园艺学报. 2006(01)
博士论文
[1]拟南芥转录因子MYB73抗核盘菌的分子机制研究[D]. 贾娇.河北农业大学 2012
硕士论文
[1]小麦MYB转录因子TaMYB86和TaRIM1的分子特征与防御功能分析[D]. 单天雷.中国农业科学院 2016
[2]转录因子AtMYB44促进拟南芥抗病耐热及抑制开花的作用[D]. 田双梅.南京农业大学 2012
[3]中国草莓属野生资源及白草莓育种初探[D]. 明晓.北京林业大学 2012
[4]野生草莓种质资源对胶孢炭疽菌的抗性研究[D]. 黄金凤.南京农业大学 2012
本文编号:3605941
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3605941.html
最近更新
教材专著