糠椴核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶基因生物信息学分析

发布时间：2022-02-10 11:36

　　核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶（Rubisco）是植物光合作用的关键酶.利用生物信息学对糠椴Rubisco基因进行开放阅读框、氨基酸组成、跨膜结构域、亚细胞定位和结合区分析,预测糠椴Rubisco的亲/疏水性和二级结构,通过同源建模构建糠椴Rubisco的三维结构.结果表明:糠椴Rubisco基因共有5个开放阅读框,其中最长的开放阅读框为1 454 bp;糠椴Rubisco为亲水蛋白,共有12个蛋白结合区,含有20种氨基酸,由34.92%的α螺旋、11.36%的β折叠和53.72%的无规则卷曲组成.该结果可为研究糠椴Rubisco基因结构和功能提供参考. 

【文章来源】：北华大学学报(自然科学版). 2020,21(04)

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

糠椴Rubisco基因的开放阅读框

糠椴Rubisco的氨基酸组成

跨膜蛋白在细胞增殖和分化、能量转换、信号转导及物质运输等方面具有重要作用，是介导细胞间物质和能量信号的传递者[23]．通过TMHMM分析糠椴Rubisco的跨膜区发现，糠椴Rubisco在膜内的概率为0，在膜外的概率为100%(图4)，说明糠椴Rubisco不存在跨膜结构域．图4 糠椴Rubisco的跨膜结构预测

【参考文献】：
期刊论文
[1]蒙古栎-糠椴天然混交林空间格局研究[J]. 李艳丽,杨华,邓华锋.  北京林业大学学报. 2019(03)
[2]遮光下糠椴幼苗的适应性研究[J]. 刘兴,赵丹,杨晓,金梦然,史宝胜.  新疆农业大学学报. 2019(02)
[3]糠椴花挥发性成分HS-SPME-GCMS分析[J]. 王建刚,赵轶博,罗航.  山东化工. 2018(24)
[4]常绿杜鹃组植物Rubisco大亚基（RbcL）的生物信息学预测及分析[J]. 周晓馥,陈思霖,武慧,徐洪伟.  北方园艺. 2016(23)
[5]香蕉1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基克隆与生物信息学分析[J]. 魏军亚,刘德兵,陈业渊,魏守兴,谢子四,刘国银.  中国园艺文摘. 2015(01)
[6]毛果杨HDAC基因家族序列及其表达分析[J]. 李淑娟,张超,张彦妮,董亚茹,马旭俊.  西北农林科技大学学报(自然科学版). 2015(03)
[7]植物基因组上游开放阅读框的挖掘方法及其翻译调控[J]. 王庭璋,胡望雄,徐建红,薛庆中.  中国农业科学. 2013(16)
[8]糠椴和紫椴木质部比较研究[J]. 倪福太,马冰,李长有,王占武,刘强.  吉林师范大学学报(自然科学版). 2013(03)
[9]椴属资源的现状与发展对策研究[J]. 龙作义,胡玉琴.  中国林副特产. 2013(03)
[10]蛋白质二级结构预测方法的评价[J]. 孟翔燕,孟军,葛家麒.  生物信息学. 2010(03)

硕士论文
[1]两种忍冬属植物和糠椴的传粉生物学观察[D]. 李宇艳.东北师范大学 2010



本文编号：3618822