骤然低温下转录组测序揭示川百合抗寒通路与相关基因

发布时间：2022-02-20 07:47

　　在没有参考基因组的情况下,为了揭示川百合（Lilium davidii）在4℃处理下基因表达谱的变化,为百合抗寒育种、引种及栽培提供理论支撑及技术支持。采用高通量Illumina Hiseq测序平台对川百合20℃（对照组）与4℃（处理组）温度条件下进行转录组测序,并对测序数据进行了分析研究,进一步探究川百合寒冷应答的分子机制。结果表明,经富集分析后得,与光合作用、光合作用-天线蛋白、光合生物体中的碳固定、叶绿素代谢等相关的基因可以作为研究川百合寒冷响应机制的主要研究对象。实时荧光定量PCR（qRT-PCR）分析结果表明,随机选出的10个差异性表达基因的表达趋势与高通量测序结果一致。这为川百合响应低温相关基因的发掘与利用、川百合耐寒分子机制的揭示及百合种植资源遗传改良奠定了基础。 

【文章来源】：江苏农业科学. 2020,48(22)

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 低温胁迫处理
    1.3 指标测定
        1.3.1 转录测序
        1.3.2 PCR验证
    1.4 数据分析
2 结果与分析
    2.1 测序结果与Trinity拼接
    2.2 基因功能注释结果
    2.3 基因表达差异分析
        2.3.1 GO富集分析
        2.3.2 KEGG富集分析
    2.4 qRT-PCR验证
3 讨论与结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]转录组测序研究兰州百合抗冻关键基因及途径[J]. 田雪慧,郁继华,颉建明.  广东农业科学. 2019(08)
[2]γ-氨基丁酸对高温胁迫下黑麦草光合特性及碳水化合物代谢的影响[J]. 王日明,王志强,向佐湘.  草业学报. 2019(02)
[3]干旱胁迫及复水对入侵植物节节麦幼苗生长及生理特性的影响[J]. 王宁,袁美丽,陈浩,李真真,张铭鑫.  草业学报. 2019(01)
[4]干旱胁迫对桢楠幼树生长及光合特性的影响[J]. 王彬,胡红玲,胡庭兴,何时东,胡义,周鑫,谭飞.  西北农林科技大学学报(自然科学版). 2019(02)
[5]8个苜蓿品种抗寒性的比较[J]. 朱爱民,张玉霞,王显国,田永雷,丛百明,张庆昕.  西北农林科技大学学报(自然科学版). 2019(01)
[6]三种食用百合种质资源限制生长保存及遗传稳定性研究[J]. 万珠珠,牛来春,谭秀梅,刘敏,吴亮,董草.  北方园艺. 2016(13)
[7]食用百合种质创制及F1代杂种鉴定[J]. 李润根,却志群,卢其能,罗霞,曾巧灵.  湖南农业大学学报(自然科学版). 2015(06)
[8]早实核桃不同品种抗寒性综合评价[J]. 刘杜玲,张博勇,孙红梅,彭少兵,朱海兰.  园艺学报. 2015(03)
[9]低温胁迫下植物响应机理的研究进展[J]. 许英,陈建华,朱爱国,栾明宝,王晓飞,孙志民.  中国麻业科学. 2015(01)
[10]9个野生早熟禾对低温胁迫的生理响应及苗期抗寒性评价[J]. 吕优伟,贺佳圆,白小明,董沁,雷娅伟.  草地学报. 2014(02)

博士论文
[1]野生百合卷丹（Lilium lancifolium）响应低温信号的分子机制研究[D]. 王晶懋.北京林业大学 2015



本文编号：3634594