玉米JAZ基因家族的生物信息学分析

发布时间：2022-05-08 08:44

　　基于已发布的玉米全基因组数据,利用系列生物信息学分析软件对玉米JAZ基因家族进行了氨基酸组成及其理化性质、蛋白质亲疏水性、磷酸化位点、二级结构元件和含量、跨膜结构域、信号肽、蛋白质亚细胞定位、功能结构域预测和分析。结果表明,玉米JAZ蛋白的氨基酸残基数目介于110～426个,相对分子质量介于11 834.49～30 494.24,理论等电点介于4.89～10.18,玉米JAZ蛋白的主要氨基酸为丙氨酸、脯氨酸、精氨酸等。稳定性预测结果表明,玉米JAZ蛋白均为非稳定性蛋白质;信号肽和跨膜结构域预测结果显示,这些蛋白质均为非分泌蛋白质,不具有信号肽,且没有明显的跨膜结构域。JAZ蛋白二级结构元件主要为不规则卷曲、α-螺旋和延伸链。亚细胞定位预测结果显示,JAZ蛋白质主要定位于细胞核;结构域预测结果表明,JAZ蛋白均含有JAZ蛋白家族典型的TIFY和CCT-2功能结构域。研究结果可为玉米JAZ基因功能研究和玉米性状定向改良奠定理论基础。 

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 JAZ基因碱基序列
    1.2 试验方法
2 结果与分析
    2.1 玉米JAZ蛋白的氨基酸组成及理化性质分析
    2.2 玉米JAZ蛋白磷酸化位点预测及分析
    2.3 玉米JAZ蛋白信号肽和跨膜结构的预测分析
    2.4 玉米JAZ蛋白的二级结构及各元件含量预测
    2.5 玉米JAZ蛋白亚细胞定位预测和分析
    2.6 玉米JAZ蛋白功能结构域的预测和分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3651324