国槐花色转录组学分析与花青苷积累关键基因功能验证
发布时间:2022-05-08 17:36
国槐(Sophora japonica L.)为蝶形花科(Papilionaceae)槐属落叶乔木,在我国已有3000多年的栽培历史。国槐的花瓣通常为白色或者浅黄绿色,单调的花色严重的限制了其观赏性。许多研究表明,国槐花瓣中富含黄酮、黄酮醇等物质,但其花瓣中是否含有花青苷?花青苷的种类和含量情况如何?针对这些问题的研究尚未见报道。本课题组经过多年的选育工作,筛选到了一棵粉花突变植株,该植株的旗瓣、翼瓣和龙骨瓣均为粉色,但关于该植株花色发生突变的原因尚不清楚。国槐花瓣中富含芦丁等黄酮类物质,而这些物质是花青苷合成的前体。因此,作者推测该突变植株花瓣中花青苷的含量或种类发生了变化导致了其花色转为粉色。为了证明该推测,本研究以国槐粉花突变(PM)不同时期的花瓣为研究材料,以相应时期的野生型(WT)的花瓣为对照,通过花青苷定性定量分析和转录组测序分析,挖掘了导致PM花色形成的关键基因,并对关键基因的CDS区进行克隆与功能验证。主要研究结果如下:(1)应用HPLC-DAD-MS~2技术测定国槐PM和WT四个时期花瓣中的花青苷与类黄酮的种类和含量。在PM和WT的花瓣中均检测到了两种花青苷和8种黄酮...
【文章页数】:160 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
abstract
1 引言
1.1 植物花色形成机理与花青苷生物合成调控
1.1.1 花色形成机理
1.1.2 花青苷生物合成通路中的关键酶与基因
1.1.3 花青苷生物合成关键转录因子
1.1.4 花青苷生物合成调控
1.2 国槐花色研究进展
1.3 该研究的目的意义及技术路线
1.3.1 目的意义
1.3.2 研究内容
1.3.3 技术路线
2 国槐花瓣中花青苷组分分析
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 试验方法
2.2 结果与分析
2.2.1 花青苷与黄酮的定性分析
2.2.2 花青苷与黄酮醇的定量分析
2.3 讨论
2.3.1 花青苷组成和花色的关系
2.3.2 国槐花青苷生物合成通路
2.4 小结
3 国槐不同花色的转录组学研究
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 试验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 转录组测序RNA样本的质量检测与分析
3.2.2 Unigene的组装结果分析
3.2.3 Unigene功能注释
3.2.4 DEGs表达分析
3.2.5 国槐花青苷合成关键基因筛选
3.2.6 转录数据q RT-PCR验证
3.3 讨论
3.3.1 国槐Sj DFR基因可能是PM花瓣中花青苷积累的关键基因
3.3.2 国槐PM花青苷生物合成可能受到多种转录因子调控
3.3.3 植物激素与光信号可能影响国槐中花青苷的合成
3.4 小结
4 国槐DFR基因CDS克隆及功能验证
4.1 材料及方法
4.1.1 试验材料
4.1.2 试验方法
4.2 结果与分析
4.2.1 国槐总RNA质量分析
4.2.2 国槐SjDFR基因CDS全长序列克隆
4.2.3 生物信息学分析
4.2.4 国槐花青苷含量测定与SjDFR基因组织特异性表达分析
4.2.5 国槐DFR亚细胞定位
4.2.6 转SjDFR烟草鉴定及表型分析
4.2.7 转基因烟草中SjDFR表达分析与总花青苷含量测定
4.3 讨论
4.3.1 国槐DFR蛋白保守性与进化分析
4.3.2 国槐DFR蛋白功能结构域及底物特异性
4.3.3 国槐DFR基因的表达特性
4.3.4 DFR基因在观赏植物的呈色及花青苷合成途径中的作用
4.4 小结
5 国槐PAP1 基因CDS克隆及功能验证
5.1 材料及方法
5.1.1 试验材料
5.1.2 试验方法
5.2 结果与分析
5.2.1 国槐PAP1 基因CDS全长序列克隆
5.2.3 国槐PAP1基因生物信息学分析
5.2.4 SjPAP1组织特异性表达分析
5.2.5 SjPAP1亚细胞定位
5.2.6 SjPAP1基因功能验证
5.3 讨论
5.3.1 SjPAP1保守结构基序与进化分析
5.3.2 SjPAP1表达组织特异性
5.3.3 SjPAP1参与花青苷合成调控
5.4 小结
6 结论和展望
6.1 结论
6.2 该研究的创新点
6.3 展望
参考文献
附录 A
个人简介
导师简介
获得成果目录
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]植物激素调控果实色泽形成的分子机制研究进展[J]. 汤红,李娜,曾教科,李雯. 分子植物育种. 2019(08)
[2]花青素转录因子调控机制及代谢工程研究进展[J]. 宋雪薇,魏解冰,狄少康,庞永珍. 植物学报. 2019(01)
[3]依据理化性质分析牡丹花色形成的影响因素[J]. 李想,段晶晶,罗小宁,张延龙,牛立新,史倩倩. 东北林业大学学报. 2019(03)
[4]川乌头F3′5′H基因在矮牵牛中的遗传转化及功能分析[J]. 马璐琳,崔光芬,贾文杰,王祥宁,段青,杜文文,王继华. 分子植物育种. 2019(09)
[5]梅花花青素苷调控基因PmMYB1的分离及功能分析[J]. 张芹,徐宗大,赵凯,李晓伟,张罗沙,张启翔. 林业科学. 2018(10)
[6]生长素信号转导研究进展[J]. 冯寒骞,李超. 生物技术通报. 2018(07)
[7]乙烯利对红掌‘特伦萨’花青苷合成及相关基因的影响[J]. 郑高言,张黎,刘克林,赵欢,刘春. 分子植物育种. 2018(24)
[8]红花查尔酮异构酶基因的克隆及表达分析[J]. 任超翔,唐小慧,何雯,陈江,裴瑾,吴清华. 天然产物研究与开发. 2018(09)
[9]鸡爪槭叶片花青素合成酶基因ApANS的克隆与表达分析[J]. 钟淮钦,陈裕德,林榕燕,罗远华,林兵,陈诗林. 中国细胞生物学学报. 2017(12)
[10]百脉根花青素合酶基因(LcANS)的克隆及表达分析[J]. 马兰. 基因组学与应用生物学. 2017(07)
博士论文
[1]同核异质雄性不育小麦花粉发育的调控模型构建及育性相关基因TaUGP1-6A的功能分析[D]. 刘子涵.西北农林科技大学 2019
[2]葡萄风信子MYB和bHLH转录因子对花青苷合成的调控研究[D]. 陈凯利.西北农林科技大学 2017
[3]葡萄风信子(Muscari)花色形成与相关基因研究[D]. 娄倩.西北农林科技大学 2014
[4]四种观赏植物花青苷分析及其花色形成机制[D]. 张洁.西北农林科技大学 2011
[5]花青素苷合成途径中结构基因的表达对菊花和瓜叶菊花色的影响[D]. 胡可.北京林业大学 2010
[6]彩叶草(Solenostemon scutellarioides)叶色形成相关的花色素苷生物合成途径的分子调控研究[D]. 祝钦泷.西南大学 2007
硕士论文
[1]香雪兰(Freesia hybrida)二氢黄酮醇4-还原酶基因功能解析[D]. 刘兴雪.东北师范大学 2016
[2]节节麦二氢黄酮-4-还原酶基因的克隆与功能分析[D]. 陈瑞金.河南大学 2016
[3]桂花CHS、DFR基因全长克隆、表达分析及表达载体构建[D]. 徐秀荣.山东农业大学 2016
[4]影响单子叶植物蓝色花蓝色形成主要因子的研究[D]. 李慧波.西北农林科技大学 2013
[5]单子叶植物蓝色花花瓣表型观察与解剖结构研究[D]. 岳娟.西北农林科技大学 2013
[6]多花水仙花色相关基因的克隆与cDNA文库的构建[D]. 鲁娜.福建农林大学 2013
[7]紫甘蓝色素的研究[D]. 王倩.江南大学 2011
[8]紫茎泽兰F3’H基因表达载体的构建及对烟草转化的研究[D]. 张松焕.河南农业大学 2009
[9]国槐分类学与繁殖特性研究[D]. 赵燕.山东师范大学 2007
[10]菊花查尔酮合成酶基因的克隆与序列分析[D]. 张明姝.北京林业大学 2006
本文编号:3652084
【文章页数】:160 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
abstract
1 引言
1.1 植物花色形成机理与花青苷生物合成调控
1.1.1 花色形成机理
1.1.2 花青苷生物合成通路中的关键酶与基因
1.1.3 花青苷生物合成关键转录因子
1.1.4 花青苷生物合成调控
1.2 国槐花色研究进展
1.3 该研究的目的意义及技术路线
1.3.1 目的意义
1.3.2 研究内容
1.3.3 技术路线
2 国槐花瓣中花青苷组分分析
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 试验方法
2.2 结果与分析
2.2.1 花青苷与黄酮的定性分析
2.2.2 花青苷与黄酮醇的定量分析
2.3 讨论
2.3.1 花青苷组成和花色的关系
2.3.2 国槐花青苷生物合成通路
2.4 小结
3 国槐不同花色的转录组学研究
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 试验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 转录组测序RNA样本的质量检测与分析
3.2.2 Unigene的组装结果分析
3.2.3 Unigene功能注释
3.2.4 DEGs表达分析
3.2.5 国槐花青苷合成关键基因筛选
3.2.6 转录数据q RT-PCR验证
3.3 讨论
3.3.1 国槐Sj DFR基因可能是PM花瓣中花青苷积累的关键基因
3.3.2 国槐PM花青苷生物合成可能受到多种转录因子调控
3.3.3 植物激素与光信号可能影响国槐中花青苷的合成
3.4 小结
4 国槐DFR基因CDS克隆及功能验证
4.1 材料及方法
4.1.1 试验材料
4.1.2 试验方法
4.2 结果与分析
4.2.1 国槐总RNA质量分析
4.2.2 国槐SjDFR基因CDS全长序列克隆
4.2.3 生物信息学分析
4.2.4 国槐花青苷含量测定与SjDFR基因组织特异性表达分析
4.2.5 国槐DFR亚细胞定位
4.2.6 转SjDFR烟草鉴定及表型分析
4.2.7 转基因烟草中SjDFR表达分析与总花青苷含量测定
4.3 讨论
4.3.1 国槐DFR蛋白保守性与进化分析
4.3.2 国槐DFR蛋白功能结构域及底物特异性
4.3.3 国槐DFR基因的表达特性
4.3.4 DFR基因在观赏植物的呈色及花青苷合成途径中的作用
4.4 小结
5 国槐PAP1 基因CDS克隆及功能验证
5.1 材料及方法
5.1.1 试验材料
5.1.2 试验方法
5.2 结果与分析
5.2.1 国槐PAP1 基因CDS全长序列克隆
5.2.3 国槐PAP1基因生物信息学分析
5.2.4 SjPAP1组织特异性表达分析
5.2.5 SjPAP1亚细胞定位
5.2.6 SjPAP1基因功能验证
5.3 讨论
5.3.1 SjPAP1保守结构基序与进化分析
5.3.2 SjPAP1表达组织特异性
5.3.3 SjPAP1参与花青苷合成调控
5.4 小结
6 结论和展望
6.1 结论
6.2 该研究的创新点
6.3 展望
参考文献
附录 A
个人简介
导师简介
获得成果目录
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]植物激素调控果实色泽形成的分子机制研究进展[J]. 汤红,李娜,曾教科,李雯. 分子植物育种. 2019(08)
[2]花青素转录因子调控机制及代谢工程研究进展[J]. 宋雪薇,魏解冰,狄少康,庞永珍. 植物学报. 2019(01)
[3]依据理化性质分析牡丹花色形成的影响因素[J]. 李想,段晶晶,罗小宁,张延龙,牛立新,史倩倩. 东北林业大学学报. 2019(03)
[4]川乌头F3′5′H基因在矮牵牛中的遗传转化及功能分析[J]. 马璐琳,崔光芬,贾文杰,王祥宁,段青,杜文文,王继华. 分子植物育种. 2019(09)
[5]梅花花青素苷调控基因PmMYB1的分离及功能分析[J]. 张芹,徐宗大,赵凯,李晓伟,张罗沙,张启翔. 林业科学. 2018(10)
[6]生长素信号转导研究进展[J]. 冯寒骞,李超. 生物技术通报. 2018(07)
[7]乙烯利对红掌‘特伦萨’花青苷合成及相关基因的影响[J]. 郑高言,张黎,刘克林,赵欢,刘春. 分子植物育种. 2018(24)
[8]红花查尔酮异构酶基因的克隆及表达分析[J]. 任超翔,唐小慧,何雯,陈江,裴瑾,吴清华. 天然产物研究与开发. 2018(09)
[9]鸡爪槭叶片花青素合成酶基因ApANS的克隆与表达分析[J]. 钟淮钦,陈裕德,林榕燕,罗远华,林兵,陈诗林. 中国细胞生物学学报. 2017(12)
[10]百脉根花青素合酶基因(LcANS)的克隆及表达分析[J]. 马兰. 基因组学与应用生物学. 2017(07)
博士论文
[1]同核异质雄性不育小麦花粉发育的调控模型构建及育性相关基因TaUGP1-6A的功能分析[D]. 刘子涵.西北农林科技大学 2019
[2]葡萄风信子MYB和bHLH转录因子对花青苷合成的调控研究[D]. 陈凯利.西北农林科技大学 2017
[3]葡萄风信子(Muscari)花色形成与相关基因研究[D]. 娄倩.西北农林科技大学 2014
[4]四种观赏植物花青苷分析及其花色形成机制[D]. 张洁.西北农林科技大学 2011
[5]花青素苷合成途径中结构基因的表达对菊花和瓜叶菊花色的影响[D]. 胡可.北京林业大学 2010
[6]彩叶草(Solenostemon scutellarioides)叶色形成相关的花色素苷生物合成途径的分子调控研究[D]. 祝钦泷.西南大学 2007
硕士论文
[1]香雪兰(Freesia hybrida)二氢黄酮醇4-还原酶基因功能解析[D]. 刘兴雪.东北师范大学 2016
[2]节节麦二氢黄酮-4-还原酶基因的克隆与功能分析[D]. 陈瑞金.河南大学 2016
[3]桂花CHS、DFR基因全长克隆、表达分析及表达载体构建[D]. 徐秀荣.山东农业大学 2016
[4]影响单子叶植物蓝色花蓝色形成主要因子的研究[D]. 李慧波.西北农林科技大学 2013
[5]单子叶植物蓝色花花瓣表型观察与解剖结构研究[D]. 岳娟.西北农林科技大学 2013
[6]多花水仙花色相关基因的克隆与cDNA文库的构建[D]. 鲁娜.福建农林大学 2013
[7]紫甘蓝色素的研究[D]. 王倩.江南大学 2011
[8]紫茎泽兰F3’H基因表达载体的构建及对烟草转化的研究[D]. 张松焕.河南农业大学 2009
[9]国槐分类学与繁殖特性研究[D]. 赵燕.山东师范大学 2007
[10]菊花查尔酮合成酶基因的克隆与序列分析[D]. 张明姝.北京林业大学 2006
本文编号:3652084
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3652084.html
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