胎生蜥蜴MHC Ⅰ类基因的多态性及对母胎免疫影响的研究
发布时间:2022-07-08 13:25
胎生蜥蜴作为古北界蜥蜴的代表,具有卵胎生繁殖模式。在中国的分布仅局限于黑龙江、内蒙古和新疆3个省区。由于人为干扰对其生境的破坏,导致胎生蜥蜴已处于渐危状态。主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)基因是免疫系统中的具有高度多态性的功能基因之一,且由于识别多种病原体和适应环境的需要,使其抗原结合区存在较高的变异性。本研究首次对大小兴安岭山区共4个地区的胎生蜥蜴的74个个体的MHC Ⅰ类基因多态性和母胎免疫影响进行分析,得出以下4个结果:1.从19个个体中克隆出570条序列,其中α2的核苷酸长度为201~223 bp,α3的核苷酸长度为181~184 bp,α2和α3的氨基酸长度为111~178 aa。实验中共得到47个等位基因,推测至少有3~6个MHC Ⅰ类基因座,符合基因“出生-死亡”进化模式,说明其在进化过程中经历了基因复制或丢失。2.通过对核苷酸序列变异位点的计算得出4个种群核苷酸多态性π在0.305~0.659之间,表明胎生蜥蜴核苷酸多态性水平较高,其中牙克石种群核苷酸多态性最高,嫩江种群最低。3.综合平均氨基酸距离小于平均...
【文章页数】:73 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第1章 绪论
1.1 胎生蜥蜴研究现状
1.2 主要组织相容性复合体研究进展及其应用
1.2.1 MHC分子结构与功能
1.2.2 MHC基因特征
1.2.3 MHC分子在非爬行动物中的研究概况
1.2.4 爬行类动物经典MHCⅠ类基因的遗传进化机制研究
1.3 母胎免疫机制与遗传多态性
1.3.1 母胎免疫机制概述
1.3.2 遗传多态性分析与应用
1.4 研究目的及意义
第2章 材料和方法
2.1 实验材料
2.1.1 样品的采集与饲养
2.1.2 主要仪器和设备
2.1.3 主要的实验试剂及配制
2.2 实验方法
2.3 数据分析
2.3.1 等位基因的确定及序列比对
2.3.2 计算遗传多态性指标
2.3.3 系统进化关系分析
2.3.4 选择信号检测
2.3.5 重组检测
第3章 胎生蜥蜴MHCⅠ类基因的多态性
3.1 基因组DNA提取结果的检测
3.2 总RNA提取结果的检测
3.3 常规PCR产物检测及纯化测序
3.4 遗传多态性分析
3.4.1 序列多态性分析
3.4.2 正选择位点分析
3.4.3 跨种多态性分析
3.4.4 重组检测
3.5 讨论
3.5.1 MHCⅠ基因多态性分析
3.5.2 正选择
3.5.3 跨物种多态性
3.5.4 重组现象
3.6 本章小结
第4章 胎生蜥蜴MHCⅠ类基因对母胎免疫的影响
4.1 RT-PCR产物检测
4.2 不同生理时期基因的相对表达量
4.3 不同组织基因相对表达量
4.4 讨论
4.5 本章小结
结论
参考文献
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]母—胎界面免疫分子的相互作用以及其对妊娠结局的影响[J]. 张卫国,李悦含,王仁杰,耿玉迪,靳镭,廖书杰. 中国妇产科临床杂志. 2018(05)
[2]中华鳖实时定量PCR内参基因的筛选与评价[J]. 刘文婷,张贝贝,张耀红,管越强. 内蒙古大学学报(自然科学版). 2017(05)
[3]HLA-G与复发性流产的相关性研究进展[J]. 顾灵,何晓燕. 中国优生与遗传杂志. 2017(03)
[4]HLA-G与母胎免疫耐受[J]. 李静博,周美英,许惠惠,颜卫华. 医学研究杂志. 2017(01)
[5]珠江口3种鲸豚的MHC-I基因多态性研究[J]. 余新建,张西阳,林文治,周蕊莲,吴玉萍. 海洋科学. 2016(10)
[6]母—胎免疫耐受研究进展[J]. 王松存,杜美蓉,李大金. 科学通报. 2016(27)
[7]我国蜥蜴科动物线粒体基因组全序列的研究现状[J]. 马微微,刘欢,赵文阁,刘鹏. 野生动物学报. 2016(01)
[8]平衡选择和重组作用共同维持大熊猫I类MHC基因的遗传变异(英文)[J]. 于方鉴,朱英,熊铁一,万秋红,张和民. Science Bulletin. 2015(01)
[9]尼罗罗非鱼MHC Ⅰα全长cDNA的克隆、多态性及组织表达特征[J]. 黎建平,高风英,卢迈新,曹建萌,朱华平,可小丽,刘志刚. 中国水产科学. 2014(06)
[10]3种麻蜥MHC I类基因外显子3和外显子4序列特征[J]. 原秀云,刘金龙,曾晓茂,郭宪光. 应用与环境生物学报. 2014(05)
博士论文
[1]川金丝猴MHCⅡ类基因遗传分析及其对配偶选择的影响[D]. 宋晓越.西北大学 2016
[2]浙江扬子鳄迁地保护种群的谱系构建和放归野外奠基种群的筛选[D]. 倪小伟.浙江大学 2012
硕士论文
[1]基于微卫星对中国胎生蜥蜴遗传多样性及亲权关系的研究[D]. 赵丹.哈尔滨师范大学 2017
[2]胎生蜥蜴遗传多样性研究[D]. 刘欢.哈尔滨师范大学 2016
[3]有尾两栖动物MHC1类基因的多态性及其进化机制[D]. 李颖华.华中师范大学 2016
[4]虎纹蛙MHCⅠ类、Ⅱ类基因的克隆与多态性分析[D]. 程岩岩.浙江师范大学 2016
[5]HCV5’非翻译区靶向性M1GS核酶构建及其胞内反义活性的研究[D]. 罗桂飞.广东药学院 2013
本文编号:3657110
【文章页数】:73 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第1章 绪论
1.1 胎生蜥蜴研究现状
1.2 主要组织相容性复合体研究进展及其应用
1.2.1 MHC分子结构与功能
1.2.2 MHC基因特征
1.2.3 MHC分子在非爬行动物中的研究概况
1.2.4 爬行类动物经典MHCⅠ类基因的遗传进化机制研究
1.3 母胎免疫机制与遗传多态性
1.3.1 母胎免疫机制概述
1.3.2 遗传多态性分析与应用
1.4 研究目的及意义
第2章 材料和方法
2.1 实验材料
2.1.1 样品的采集与饲养
2.1.2 主要仪器和设备
2.1.3 主要的实验试剂及配制
2.2 实验方法
2.3 数据分析
2.3.1 等位基因的确定及序列比对
2.3.2 计算遗传多态性指标
2.3.3 系统进化关系分析
2.3.4 选择信号检测
2.3.5 重组检测
第3章 胎生蜥蜴MHCⅠ类基因的多态性
3.1 基因组DNA提取结果的检测
3.2 总RNA提取结果的检测
3.3 常规PCR产物检测及纯化测序
3.4 遗传多态性分析
3.4.1 序列多态性分析
3.4.2 正选择位点分析
3.4.3 跨种多态性分析
3.4.4 重组检测
3.5 讨论
3.5.1 MHCⅠ基因多态性分析
3.5.2 正选择
3.5.3 跨物种多态性
3.5.4 重组现象
3.6 本章小结
第4章 胎生蜥蜴MHCⅠ类基因对母胎免疫的影响
4.1 RT-PCR产物检测
4.2 不同生理时期基因的相对表达量
4.3 不同组织基因相对表达量
4.4 讨论
4.5 本章小结
结论
参考文献
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]母—胎界面免疫分子的相互作用以及其对妊娠结局的影响[J]. 张卫国,李悦含,王仁杰,耿玉迪,靳镭,廖书杰. 中国妇产科临床杂志. 2018(05)
[2]中华鳖实时定量PCR内参基因的筛选与评价[J]. 刘文婷,张贝贝,张耀红,管越强. 内蒙古大学学报(自然科学版). 2017(05)
[3]HLA-G与复发性流产的相关性研究进展[J]. 顾灵,何晓燕. 中国优生与遗传杂志. 2017(03)
[4]HLA-G与母胎免疫耐受[J]. 李静博,周美英,许惠惠,颜卫华. 医学研究杂志. 2017(01)
[5]珠江口3种鲸豚的MHC-I基因多态性研究[J]. 余新建,张西阳,林文治,周蕊莲,吴玉萍. 海洋科学. 2016(10)
[6]母—胎免疫耐受研究进展[J]. 王松存,杜美蓉,李大金. 科学通报. 2016(27)
[7]我国蜥蜴科动物线粒体基因组全序列的研究现状[J]. 马微微,刘欢,赵文阁,刘鹏. 野生动物学报. 2016(01)
[8]平衡选择和重组作用共同维持大熊猫I类MHC基因的遗传变异(英文)[J]. 于方鉴,朱英,熊铁一,万秋红,张和民. Science Bulletin. 2015(01)
[9]尼罗罗非鱼MHC Ⅰα全长cDNA的克隆、多态性及组织表达特征[J]. 黎建平,高风英,卢迈新,曹建萌,朱华平,可小丽,刘志刚. 中国水产科学. 2014(06)
[10]3种麻蜥MHC I类基因外显子3和外显子4序列特征[J]. 原秀云,刘金龙,曾晓茂,郭宪光. 应用与环境生物学报. 2014(05)
博士论文
[1]川金丝猴MHCⅡ类基因遗传分析及其对配偶选择的影响[D]. 宋晓越.西北大学 2016
[2]浙江扬子鳄迁地保护种群的谱系构建和放归野外奠基种群的筛选[D]. 倪小伟.浙江大学 2012
硕士论文
[1]基于微卫星对中国胎生蜥蜴遗传多样性及亲权关系的研究[D]. 赵丹.哈尔滨师范大学 2017
[2]胎生蜥蜴遗传多样性研究[D]. 刘欢.哈尔滨师范大学 2016
[3]有尾两栖动物MHC1类基因的多态性及其进化机制[D]. 李颖华.华中师范大学 2016
[4]虎纹蛙MHCⅠ类、Ⅱ类基因的克隆与多态性分析[D]. 程岩岩.浙江师范大学 2016
[5]HCV5’非翻译区靶向性M1GS核酶构建及其胞内反义活性的研究[D]. 罗桂飞.广东药学院 2013
本文编号:3657110
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3657110.html
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