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富含亮氨酸重复序列和免疫球蛋白样结构域1(LRIG1)基因在非小细胞肺癌中的表达、信号通路及其与预后的关系

发布时间:2022-07-27 19:45
  目的:探讨富含亮氨酸重复序列和免疫球蛋白样结构域1(LRIG1)基因在非小细胞肺癌(NSCLC)患者中的表达、相关信号通路及其与患者预后的关系。方法:依靠癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析LRIG1基因mRNA在NSCLC患者癌组织和癌旁组织中的表达水平;依靠蛋白相互作用(STRING)数据库构建LRIG1蛋白-蛋白相互作用网络,并对相关蛋白功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路进行富集。同时分析比较LRIG1基因表达与NSCLC患者总生存期和无疾病进展生存期的关系。选取手术治疗的96例NSCLC患者,采用免疫组织化学法检测LRIG1蛋白在癌组织和癌旁组织中的表达,对数据库分析结果进行验证。结果:LRIG1基因在癌旁正常组织中表达水平较高,而在癌组织中表达较低;与LRIG1蛋白相互作用较为紧密的10蛋白相互作用网络富集显著(P<0.001);共表达分析显示,L-型电压依赖性钙离子通道α1D亚基(CACNA1D)基因与LRIG1基因正向共表达最为明显(r=0.51, P<0.05),而G蛋白信号转导调节因子20(RGS20)基因与LRIG1基因负向共表达最为明显... 

【文章页数】:8 页

【文章目录】:
1 资料与方法
    1.1 LRIG1表达水平分析
    1.2 LRIG蛋白-蛋白相互作用网络
    1.3 LRIG1基因功能富集
    1.4免疫组化检测LRIG1蛋白表达
    1.5 LRIG1蛋白高低表达判断
    1.6 统计学方法
2 结果
    2.1 LRIG1基因表达
    2.2 LRIG1蛋白-蛋白相互作用
    2.3 LRIG1基因共表达
    2.4 功能富集
    2.5 京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路
    2.6 生存分析
    2.7 LRIG1蛋白表达与NSCLC患者临床病理特征的关系
3 讨论


【参考文献】:
期刊论文
[1]LRIG1及Fascin-1在非小细胞肺癌中的共表达及其临床意义[J]. 房艳红,张晓乐,刘绪艳,张学军,李毅,袁海红.  吉林医学. 2018(10)
[2]Over-expression of LRIG1 Suppresses Biological Function of Pituitary Adenoma via Attenuation of PI3K/AKT and Ras/Raf/ERK Pathways In Vivo and In Vitro[J]. 程世奇,范恒怡,徐新,高伟伟,吕世刚,叶敏华,吴淼经,沈晓黎,程祖珏,祝新根,张焱.  Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences). 2016(04)



本文编号:3666062

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