版纳微型猪近交系FANK1基因CDS克

发布时间：2022-09-17 20:24

　　【目的】获得猪FANK1基因CDS序列、组织表达和蛋白质功能信息。【方法】以GenBank下载的猪及近缘物种的FANK1 mRNA序列为参考序列,设计特异引物从版纳微型猪近交系（BMI）睾丸组织中扩增FANK1基因完全编码序列及部分侧翼序列。应用实时荧光定量PCR技术检测BMI 15个重要组织的FANK1 mRNA转录表达水平,并对FANK1翻译的蛋白质序列进行多种功能生物信息学分析,预测FANK1蛋白质的功能,最后构建FANK1多物种氨基酸系统进化树。【结果】获得了BMI FANK1编码区序列长1 041 bp,编码346个氨基酸,序列已提交GenBank,基因登录号为KU705617和KU705618,对应的氨基酸登录号为AOC89035和AOC89036。基因组结构分析表明FANK1基因定位于猪14号染色体,有11个外显子和10个内含子。多组织相对荧光定量表达分析表明FANK1基因在睾丸、尿道球腺和精囊腺中呈高表达水平;在其他组织中呈中低表达水平。功能生物信息学分析表明FANK1蛋白质含有2种保守结构域FN3和ANK,无跨膜螺旋结构,无N端信号肽序列,二级结构以无规卷曲为主,N末... 

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 总RNA提取和第一链c DNA合成
        1.2.2 引物设计及合成
        1.2.3 RT-PCR分离FANK1基因
        1.2.4 FANK1基因多组织表达分析
        1.2.5 序列确定和数据分析
2 结果与分析
    2.1 FANK1基因RT-PCR扩增结果
    2.2 FANK1基因序列及其编码的氨基酸序列
    2.3 FANK1基因组结构分析
    2.4 多组织荧光定量表达分析
    2.5 FNAK1蛋白质一级结构信息
    2.6 FANK1蛋白质二级结构
    2.7 FANK1蛋白质功能域
    2.8 FANK1蛋白质的疏水性
    2.9 FANK1蛋白质功能位点分析
    2.1 0 FANK1蛋白质信号肽及跨膜结构分析
    2.1 1 FANK1蛋白质序列多物种系统进化分析
3 讨论和结论



本文编号：3679885