基于选择消除分析挖掘豌豆耐冻相关基因

发布时间：2022-10-04 16:13

　　近年来,冬季的低温对豌豆生产造成严重损失。本试验对16份极端耐冻豌豆和14份极端冷敏感豌豆的全基因组重测序数据与参考基因组进行比对获得SNP,再基于过滤后的SNP数据对所有材料进行系统发育树构建、主成分分析、连锁不平衡分析以及选择消除分析等,并依据选择消除分析的群体多样性（θπ）、杂合率（Hp）和群体分化（Fst）三者交集的前5%候选区域,最终筛选获得34个与豌豆耐冻相关的基因。研究结果为豌豆耐冻品种选育和"冬豆北移"栽培模式提供理论支撑。 

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 全基因组重测序数据的获取与比对
    1.3 SNP检测与注释
    1.4 系统发育树构建与主成分分析
    1.5 连锁不平衡(LD)分析
    1.6 选择消除分析
2 结果与分析
    2.1 重测序数据统计
    2.2 SNP的注释
    2.3 系统发育树构建与主成分分析
    2.4 连锁不平衡分析
    2.5 耐冻与冷敏感资源的选择消除分析
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]火龙果抗寒性研究[J]. 张慧君,梁亚灵.  基因组学与应用生物学. 2017(05)
[2]木本植物低温胁迫生理及分子机制研究进展[J]. 乌凤章,王贺新,徐国辉,张自川.  林业科学. 2015(07)
[3]豌豆的特征特性及开发利用价值[J]. 崔再兴,李玲.  杂粮作物. 2010(02)
[4]磷脂酶Dα在拟南芥低温驯化过程中的作用途径分析[J]. 曾正兵,梅旭荣,钟秀丽,李玉中,王涛,王海燕,孙磊.  基因组学与应用生物学. 2009(04)
[5]逆境条件下植物体内渗透调节物质的积累与活性氧代谢[J]. 王娟,李德全.  植物学通报. 2001(04)

硕士论文
[1]基于SSR标记的豌豆遗传连锁图谱加密及抗冻基因关联分析[D]. 方俐.中国农业科学院 2016



本文编号：3685351