植物中E（z）同源基因的保守性和功能分化研究

发布时间：2022-10-27 21:52

　　组蛋白甲基化修饰是一种重要的表观遗传调控过程,通过在组蛋白的赖氨酸和精氨酸等位点添加甲基来影响基因的转录表达过程,从而控制植物的生长发育。PcG（Polycomb Group）蛋白参与动植物的组蛋白甲基化修饰过程,在基因沉默和发育调控中都发挥着至关重要的作用。E（z）（Enhancer of Zeste）同源基因编码一类含有SET结构域的PcG蛋白,参与组蛋白的甲基化过程。该基因广泛存在于动植物中。哺乳动物中包含EZH1和EZH2两种E（Z）同源基因,拟南芥中则包含CLF C CURLY LEAF)、SWN（SWINGER）和MEA（MEDEA）等三种E（Z）同源基因。为了深入解组蛋白甲基化相关基因在植物中的起源和进化过程,本研究利用比较基因组学和系统发生学的手段对植物中的E（Z）同源基因进行了分析。主要研究结果如下:（1）利用比较基因组学的方法进行系统发育分析。系统发育分析结果表明E（Z）同源基因在绿色植物中高度保守,主要以单拷贝的形式存在于绿藻和早期陆生植物中。E（Z）同源基因在种子植物中却分成了两个分支:CLF分支和SWN分支,这两个分支都有被子植物和裸子植物,表明这两个分支可能... 

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【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
1 绪论
    1.1 基因组和转录组
        1.1.1 植物基因组研究
        1.1.2 植物转录组研究
        1.1.3 植物比较基因组和转录组研究
    1.2 基因重复
    1.3 E(z)同源基因的背景介绍
        1.3.1 PcG蛋白的发现
        1.3.2 PcG蛋白在植物中的功能研究
        1.3.3 E(z)同源基因的结构和功能
        1.3.4 印记基因MEDEA
    1.4 本研究的目的和意义
2 材料和方法
    2.1 数据检索与数据库的构建
    2.2 E(z)同源基因的鉴定
    2.3 多序列比对与系统发育树的构建
    2.4 保守基序分析和基因结构分析
    2.5 共线性分析和选择压力分析
    2.6 表达分析
3 结果
    3.1 E(z)同源基因在绿色植物中的鉴定
    3.2 E(z)同源基因在种子植物中的复制和分化
    3.3 E(z)同源基因在被子植物中的扩张
    3.4 十字花科和豆科植物中E(z)同源基因的蛋白序列和基因结构分析
    3.5 豆科植物SWN2分支展现了明显的氨基酸置换率和正向选择
    3.6 E(z)同源基因在大豆各组织中的表达谱分析
4 讨论
    4.1 绿色植物中E(z)同源基因的进化模式
    4.2 豆科植物E(z)同源基因的新功能化
参考文献
附录A 物种统计和系统发育树
附录B 保守基序分析
附录C 基因结构分析
附录D 选择压力分析
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用[J]. 祁云霞,刘永斌,荣威恒.  遗传. 2011(11)
[2]Genome-wide transcriptional analysis of maize endosperm in response to ae wx double mutations[J]. Xiang Li,Guang Hui Chen,Wei Yang Zhang,Xiansheng Zhang State Key Laboratory of Crop Biology,College of Life Sciences,Shandong Agricultural University,Taian 271018,China.  遗传学报. 2010(11)



本文编号：3697280